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文献和实验做 ChIP(Chromatin Immunoprecipitation)已经几个月了,虽时间不长,但深刻体会细节决定成败,这里就把自己认为值得注意的细节总结如下: 1、cell counting:尽量做到准确,会影响 input 结果。 2、cross link:甲醛的终浓度是 1%,这个基本所有的 protocol 上都会强调。 3、resuspend cells with SDS:一定要选用小的 tip 头,在液面下吹打,否则很容易产生气泡,后面的 sonication 就麻烦
染色质免疫共沉淀测序技术(Chromatin immunoprecipitation Sequencing, ChIP- seq)将染色质免疫共沉淀与第二代测序相结合的一种技术。它能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段,是研究体内转录因子和靶基因启动子区域直接相互作用的方法,对于调控蛋白在基因组上的结合靶点筛选、差异化表观遗传变异的原理揭示提供了重要的解决思路。因此,在过去十年已经成为表观遗传信息研究的主要方法,并且一大波的CNS都展示了完美的结果。我想做过ChIP
Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
INTRODUCTION Chromatin immunoprecipitation (ChIP) is an invaluable method for studying interactions between specific proteins or modified forms of proteins and a genomic DNA region. ChIP can be used to determine whether a transcription
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