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文献和实验液为预先优化好的混合物,通常包含缓冲液、DNA聚合酶、dNTP、MgCl2及其他专利的添加剂。 一些专业人士坦言,对于多个指标,包括qPCR 效率、特异性、灵敏度、速度及耐受多个循环条件和样品类型,目前还尚未实现完美的平衡。大部分qPCR预混液能够在一些方面胜出,但很难是全部。如何选择最适合的那一个,小编下面给出了一些建议。 探针 还是染料? 当然,就多重分析而言,探针法是唯一选择。SYBR Green只适合单重反应。不过,SYBR Green的优势
Real-time qPCR 手册——手把手教你从菜鸟到高手
设置好,可以保存,修改反应程序或者立刻进行反应。 需要注意一点 ABI 仪器需要加 ROX 参比染料,默认的是 ROX。有些公司是把 ROX 或者其他染料配制在 MasteMix 里面;也有的是单独分开。要根据不同公司的 MasterMix 进行这一个步骤的选择。BioTeke 的 MasterMix 里没有参比染料,所以选择「none」。 设置好之后,就可以把配置好的 PCR 管放进仪器,点击 RUN! 五、Real-time qPCR 数据分析 1. Real-time qPCR 常见参数
。2.Mix配制一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为100-400mM;模板如果是总RNA一般是10ng-500,如果cDNA,通常情况下是1ul或者1ul的10倍稀释液,要根据目的基因的表达丰度进行调整。当然这些都是经验值,在操作过程中,还需要根据所用
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