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48T
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文献和实验原理: 将染色质和与之相互作用的转录因子和组蛋白通过甲醛等物质交联起来,然后通过超声将染色质打碎成小片段,加入针对特定转录因子或特殊修饰的组蛋白抗体,通过 Protein A/Protein G 微球或磁珠将抗体-转录因子-染色质复合物拖下来,通过 PCR 或测序的方法检测与目的蛋白相结合的 DNA 序列,进而研究这些转录因子在细胞发育或者生长中的作用位点。 ✦ ChIP-seq: ChIP-seq 将 ChIP 技术与二代测序相结合,将 ChIP 下来的 DNA 进行二代测序文库构建,能够获取
分析 水稻花序组织复杂,不同细胞类型之间异质性大,因此需要对同类细胞进行细分分类,以获得更精细的解析结果,这也是遇到复杂组织时的常见分析策略。在对花细胞进行了细分分群(图 2a)过程中,烈冰团队结合已报道的 marker gene 对各个簇进行了细胞类型鉴定(图 2b),得到了包括外稃、内稃、浆片和雄蕊在内的该时期全部已知水稻花器官,还发现了小穗属性细胞(SIC)、花分生组织(FM)、边界细胞(boundary)、隐性苞片(cryptic bract)等新的细胞类群。研究发现,WOX 类转录因子
三句话读懂一篇 CNS:这种野草具有延缓衰老和抗压奇效?不吃晚餐或有助改善代谢……
and the evolution of neo-sex chromosomes in parrots。 该研究利用 PacBio 三代测序与 HiC 辅助组装技术获得高质量的鹦鹉基因组测序数据,比较了 4 种染色体级别的鹦鹉基因组,提出了 ALC1 的缺失将导致同源重组的功能缺陷,深层次揭示了由转座子及基因丢失介导的基因组不稳定性机制! 图 3:来源 Nature Communications 4. The Plant Cell:揭示番茄响应紫外光 UV-B 新机制 酸酸甜甜的番茄是广受人们欢迎的作物
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