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上海经科化学科技有限公司
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50T
RNASweAMI原位杂交简介
原位杂交(In situ hybridization),即ISH技术,基本原理是基于碱基互补配对原则,利用特定标记(如荧光素、地高欣等)的已知序列单链核酸作为探针,与待检测的细胞或组织切片中的靶基因(DNA或RNA)特异性结合,二者经碱基互补配对,形成靶基因与标记探针的杂交体。随后根据探针的标记物,利用不同的显色系统对杂交体进行显色及信号放大,从而对靶基因进行精确定量定位。根据探针的标记物不同,有荧光显色系统、DAB显色系统等。
RNASweAMI ISH原位杂交技术检测流程如图1所示,特异性的寡核苷酸探针通过碱基互补配对原则与组织样本中的靶标RNA杂交,然后通过两个“L”型结构(单链DNA)使得靶标处富集大量的信号探针,实现级联式信号放大,经明场或者荧光成像技术,可观察到靶标RNA处形成的明显点状或团簇状信号。相比于传统的原位杂交直标方法,该方法理论上可以将信号放大400-8000倍,实现单分子RNA的可视化,且具有很高信噪比。
实验前准备
1 实验流程概览

2 试剂准备
(1) 配制1×修复液:将修复液(20×)用无核酸酶水稀释20倍,即1mL修复液(20×)与19mL无核酸酶水混匀。
(2) 配制Proteinase K工作液:将Proteinase K用1×PBS稀释10倍,即每100μL Proteinase K与900μL 1×PBS混匀,得到Proteinase K工作液。
(3) 配制靶标探针混合物1杂交液:靶标探针混合物1用杂交液稀释5倍。
(4) 配制靶标探针混合物2杂交液:靶标探针混合物2用杂交液稀释5倍。
(5) 配制2×SSC:将20×SSC用无核酸酶水稀释10倍,即每1mL 20×SSC与9mL无酶水混匀。
(6) 配制1×SSC:将20×SSC用无核酸酶水稀释20倍,即每1mL 20×SSC与19mL无酶水混匀。
(7) 配制0.5×SSC:将20×SSC用无核酸酶水稀释40倍,即每1mL 20×SSC与39mL无酶水混匀。
(8) 配制0.1×SSC:将20×SSC用无核酸酶水稀释200倍,即每1mL 20×SSC与199mL无酶水混匀。
(9) 配制信号探针杂交液:将探针试剂盒中相应的荧光信号探针(200×)用杂交液稀释200倍。
样本前处理
1 组织石蜡切片
(1) 脱蜡复水:制备好的组织石蜡切片(3-5μm)依次进入二甲苯I 15min-二甲苯II 15min-无水乙醇Ⅰ5min-无水乙醇Ⅱ5min-85%乙醇5min-75%乙醇5min-无核酸酶水。
(2) 热修复:1×修复液置于抗原修复盒内,将组织切片浸没于1×修复液中,将抗原修复盒置于提前加温至100℃的水浴锅内,继续保温至1×修复液沸腾并维持15min,然后取出抗原修复盒,自然冷却至室温,1×PBS清洗3次,每次5min。
(3) 消化:用免疫组化笔画圈圈住组织,向圈内滴加Proteinase K工作液覆盖组织,置于37℃消化20-30min,之后切片经1×PBS洗3次,每次5min。(优秀消化条件需根据实际实验情况进行优化调整,以获得最佳实验效果)
2 组织冰冻切片
(1) 固定:冰冻切片经室温静置5-10min复温干燥后,滴加试剂盒内配套的固定液覆盖组织,室温固定10-15min,晾干后以1×PBS清洗3次,每次5min。
(2) 消化:用免疫组化笔画圈圈住组织,向圈内滴加Proteinase K工作液覆盖组织,置于37℃消化5-15min,之后切片经1×PBS洗3次,每次5min。(优秀消化条件需根据实际实验情况进行优化调整,以获得最佳实验效果,必要时可用修复液高温修复)。
3 贴壁细胞样本
(1) 固定:去除细胞培养板中的培养基,用1×PBS缓冲液(无核酸酶)清洗1次,之后向孔板内加入固定液1-2mL覆盖细胞,室温固定10-15min后,以1×PBS清洗3次,每次5min。
(2) 破膜:在细胞培养板中滴加300-500μL通透剂覆盖细胞,室温孵育20min后,1×PBS洗3次,每次5min。
(3) 消化:细胞培养板稍甩干后,用免疫组化笔在细胞培养板边缘均匀画圈,向圈内加50-100μL Proteinase K工作液37℃消化5-10min。细胞培养板经1×PBS润洗3次,每次5min。(优秀消化条件需根据实际实验情况进行优化调整,以获得最佳实验效果)
4 悬浮细胞样本
(1) 涂片:将收集的适量细胞重悬于1×PBS缓冲液(无核酸酶)中,吸取50-100μL细胞悬液滴于防脱玻片上,使用一片洁净的载玻片轻柔涂开细胞悬液;
(2) 固定:滴加试剂盒内配套的固定液完全覆盖组织,室温固定10-15min后,以1×PBS清洗3次,每次5min。
(3) 破膜:在细胞培养板中滴加300-500μL通透剂覆盖细胞,室温孵育20min后,1×PBS洗3次,每次5min。
(4) 消化:细胞培养板稍甩干后,用免疫组化笔在细胞培养板边缘均匀画圈,向圈内加50-100μL Proteinase K工作液37℃消化5-10min。细胞培养板经1×PBS润洗3次,每次5min。(优秀消化条件需根据实际实验情况进行优化调整,以获得最佳实验效果)
原位杂交检测
(1) 预杂交:轻轻甩干切片后,将切片水平置于湿盒内,滴加40℃预热的杂交液覆盖样本,盖上湿盒盖子,将湿盒整体置于预热的杂交仪内40℃孵育30min,此过程需注意防止干片。
(2) 靶标探针1杂交:探针孵育:倾去杂交液,滴加40℃预热的靶标探针混合物1杂交液约60μL覆盖样本,水平置于湿盒内,然后将湿盒置于杂交仪内40°C孵育3h(或40℃孵育过夜),此过程需注意密封湿盒防止干片。
(3) 杂交后洗涤:倾去靶标探针混合物1杂交液,切片依次经40°C预热的2×SSC、1×SSC、0.5×SSC、0.1×SSC于40℃漂洗,各5min。
注意:若非特异性杂交体较多,可以在此步增加洗涤时间、次数及调整杂交液中甲酰胺浓度。
(4) 靶标探针2杂交:轻轻甩干切片,滴加40℃预热的靶标探针混合物2杂交液约60μL覆盖样本,水平置于湿盒内,将湿盒置于杂交仪内40℃孵育45min。
注意:湿盒底部加入50mL 2×SSC,防止干片。
(5) 杂交后洗涤:倾去靶标探针混合物2杂交液,切片依次经40°C预热的2×SSC、1×SSC、0.5×SSC、0.1×SSC于40℃漂洗各5min。
注意:若非特异性杂交体较多,可以在此步增加洗涤时间、次数及调整杂交液中甲酰胺浓度。
(6) 荧光信号探针杂交:轻轻甩干切片,滴加37℃预热的荧光信号探针杂交液约60μL覆盖样本,水平置于湿盒内,将湿盒置于杂交仪内37℃孵育3h。注意:湿盒底部加入50mL 2×SSC,防止干片。
(7) 杂交后洗涤:倾去荧光信号探针杂交液,切片依次经37°C预热的2×SSC、1×SSC、0.5×SSC、0.1×SSC于37℃漂洗各5min。
注意:若非特异性杂交体较多,可以在此步增加洗涤时间、次数及调整杂交液中甲酰胺浓度。
(8) 复染细胞核:切片经1×PBS(无酶)润洗1次,稍微甩干后,向圈内滴加200-500μL DAPI工作液完全覆盖组织,室温避光染色8min。
(9) 封片:切片经1×PBS(无酶)冲洗后,滴加抗荧光淬灭封片剂进行封片。注意,抗荧光淬灭剂为非固化型封片剂,封片后小心存放,防止盖玻片移动导致组织干片。
(10) 检测结果观察:使用标准荧光显微镜观察切片,在适当倍数(20×-40×)物镜下通过相应荧光检测通道或者滤光片检测荧光信号。各荧光信号激发波长和发射波长如下:
DAPI紫外激发波长330-380nm,发射波长420nm;
Cy3激发波长550nm,发射波长570nm;
IF488激发波长501nm,发射波长523nm;
IF550激发波长554nm,发射波长576nm;
IF590激发波长594nm,发射波长624nm;
IF647激发波长645nm,发射波长669nm。
靶标探针检测结果呈现为细胞内的点状或团簇状荧光信号,细胞核呈蓝色荧光信号。
储存与运输
冰袋运输,-20℃保存,有效期一年
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文献和实验相比于传统的原位杂交直标方法,该方法理论上可以将信号放大400-8000倍,实现单分子RNA的可视化,且具有很高信噪比。
最近有一些战友对荧光原位杂交技术比较感兴趣,我整理了相关资料和自己的心得,和大家交流一下。不妥之处,请大家指出,共同讨论学习。 内容分三部分: 一、概述 1. 克隆性染色体异常是肿瘤的特征 2. 染色体异常常见的类型3. 染色体异常的检测方法 二、荧光原位杂交及其探针 1. 荧光原位杂交的原理2. 荧光原位杂交的探针 一、 概述 1. 克隆性染色体异常是肿瘤的特征 1914年德国遗传学家Boveri就提出染色体畸变与肿瘤起源相关
网络 第三节 DNA及寡核苷酸探针在原位杂交组织化学中的应用 一、DNA探针的应用 虽然一般认为DNA探针敏感度不如cRNA探针,但在病毒的检测等领域中DNA探针仍得到广泛的应用。 在原位杂交细胞化学的操作步骤方面与cRNA探针基本相同,所不同的是:(1)杂交时需先在高温80~95℃短时处理,使DNA探针及细胞内靶DNA变性,解离成单
1.PCR引物序列来做原位杂交的探针序列 http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=464691&sty=3&keywords=%D4%AD%CE%BB%D4%D3%BD%BB%B5%C4%CC%BD%D5%EB 2.设计原则 http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/2339929_0.html http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/2378416
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