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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
-20℃
- 保质期:
12个月
- 库存:
100
- 供应商:
晶风生物
- 规格:
50T
本产品仅供科研
更多产品详细信息可免费向客服索取
产品名称:Brachyspira spp.短螺旋体探针法荧光定量PCR试剂盒
保存条件:-20℃
保质期:12个月
包装规格及成分(具体信息详见说明书):

通用原则
1. 先选择好探针,然后设计引物使其尽可能的靠近于探针;
2. 扩增子的长度应不超过400bp,理想的最好能在100-150bp内,扩增片断越短,有效的扩增反应就越容易获得,较短的扩增片断也容易保证分析的一致性;
3. 保持GC含量在20%和80%之间,GC富含区容易产生非特异反应,从而会导致扩增效率的降低,及在SG分析中非特异信号;
4. 为了保证效率和重复性,应避免重复的核苷酸序列,尤其是G(不能有4个连续的G);
5. 将引物和探针互相进行配对检测,以避免二聚体和发卡结构的形成。
探针设计指导
1. 在设计引物之前设计探针;
2. 探针的Tm值应在68-70℃之间,如果是目测探针,则要仔细审查GC富含区;
3. 探针的5’端要避免有鸟氨酸,5’G会有淬灭作用,即使被切割下来这种淬灭作用也还会存在;
4. 选择C多于G的链作探针,G的含量多于C会降低反应效率,这时就应选择配对的另一条链作为探针。
5. 探针应尽可能的短,不要超过30个bp。
6. 检测探针的DNA折叠和二级结构。
引物设计指导
1. 引物的Tm值应在58-60℃之间,这非常重要,因为我们的试验一般都使用退火温度为60℃,在这个温度下,5’核酸外切酶的活性最高。
2. 引物末端(最后5个核苷酸)不能有超过2个的G和C。
3. 将引物尽量接近于探针

设置qPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)
如果进行定量分析,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照,6个用于标准曲线样品。如果做定性分析,则6个标准曲线样品只选一个做(可以选4号,其余样品不变)。以下只介绍定量分析的反应设置。
Brachyspira spp.短螺旋体探针法荧光定量PCR试剂盒数据处理
1. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log 值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品核酸浓度的 log 值,再推算出其浓度。
2. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct 必须大于或等于 40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于 39。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于40 则为阴性,如果小于或等于 39 则为阳性。如果在 39-40 之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于 40 则为阴性,如果小于 40,则为阳性。
下面介绍我公司部分一两种产品,更多产品请联系我们
本公司一管式植物DNAOUT产品及特点:
本产品是一管式超快植物种子和叶片基因组DNA 提取试剂,得到的产物可以直接用于PCR。整个过程简单快速,尤其适合于大规模的转基因植物筛选时样品的制备。
1. 快速,整个过程只需要15分钟左右,不需要液氮对植物组织进行冰冻、机械处理、纯化或者DNA的沉淀。运输及保存2. 一管式,在一个试管内完成所有操作,不容易交叉污染。常温运输及保存,有效期一年。
3. 裂解液可以直接用于PCR,剩余样品可以在4℃保存一月以上。
4. 便于高通量和自动化,适合于海关和企业进行大规模的GMO PCR 筛选。
5. 适用于大多数植物叶片和种子。
使用及效果:将压碎的一小片重量约在100 mg 左右的植物种子(约1/4 黄豆大小)或直径约为0.5-0.7 cm(或面积相当的其他形状)的植物叶片直接加到新鲜配制的0.1 mL溶液A 中,95℃保温10-15 分钟,加入0.1 mL 溶液B,混匀,直接取上清液(相当于PCR 体积的1/10)作为模板进行PCR。剩余样品可以放4℃保存。
我公司即用型PCR试剂盒:
运输及保存:低温运输、-20℃保存,有效期一年。
二,即用型PCR试剂盒的改良产品, 含有Taq DNA 聚合酶、dNTPs、MgCl2、反应缓冲液、PCR 增强剂、上样染料等所有PCR 所需要的成分,用户只需加入模板和引物即可进行PCR 反应,具有广泛的用途。
1. 方便,用户只需准备模板和引物既可以进行PCR 实验。
2. 快捷,操作步骤已经最大限度地简化,能减少污染,降低实验误差。
3. 本产品A 型含电泳染料,PCR 反应液可直接上样电泳,进一步简化了操作。
4. 由于各成分的浓度和比例都经过精心优化,反应的灵敏度高,特异性强。能扩增各种常见的DNA 样品。
5. 产物可直接用于T 载体克隆,不需要额外的加A 反应。
使用及效果:将本产品15 μL 与用户自备的模板,引物和水共15 μL 混合后,直接进行PCR反应(PCR 参数由用户自己确定),反应结束后直接取10 μL 电泳检查扩增结果。
Brachyspira spp.短螺旋体探针法荧光定量PCR试剂盒检测方法的局限性
A.样本检测结果与样本收集、处理、运送以及保存质量有关;
B.样本提取过程中没有控制好交叉污染,会出现假阳性结果;
C.阳性对照、扩增产物泄漏,会导致假阳性结果;
D.病原体在流行过程中基因突变、重组,会导致假阴性结果;
E.不同的提取方法存在提取效率差异,会导致假阴性结果;
F.试剂运输,保存不当或试剂配制不准确引起的试剂检测效能下降,出现假阴性或定量检测不准确的结果;
Brachyspira spp.短螺旋体探针法荧光定量PCR试剂盒注意事项
1操作严格按照说明书进行;
2试剂盒内各种组分使用前应自然融化,完全混匀并短暂离心;
3反应液应避光保存;
4反应中尽量避免气泡存在,管盖需盖紧;
5使用一次性吸头、一次性手套和各区专用工作服;
6样本处理、试剂配制、加样需在不同区进行,以免交叉污染;
7实验完毕后用10%次氯酸或75%酒精或紫外灯处理工作台和移液器;
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文献和实验上还连接有MGB (Minor Groove Binder)修饰基团,可以将探针的Tm值提高10°C左右。因此为了获得同样的Tm值,MGB探针可以比普通TaqMan探针设计得更短,既降低了合成成本,也使得探针设计的成功率大为提高——因为在模板的DNA碱基组成不理想的情况下,短的探针比长的更容易设计。实验证明,TaqMan MGB探针对于富含A/T的模板可以区分得更为理想。 Taqman探针法已经得到广泛使用,不过有人认为这种技术利用了Taq酶5`—3`外切酶活性,一般试剂厂家只给Taq
。 2、若 NTC 出现的扩增曲线是由引物二聚体造成的,其长度往往较短(一般引物二聚体的长度大约为 50 - 60bp), 低于目的片段的长度(目的片段长度一般为 80 - 200bp),所以引物二聚体的 Tm 值小于目的片段的 Tm 值,引物二聚体形成的融解曲线的峰形与目的基因的峰形不重叠。 3. CT 值很大怎么办? 造成 CT 值偏大的因素较多,主要分为以下两大类情况: (1)相同体系,前期实验 CT 值正常,本次实验,所有基因扩增 CT 值皆偏大。 这种情况下,需要排查 RNA 是否存在降解
如何获得高质量、高可信度的荧光定量PCR结果--高质量cDNA标准
跨内含子设计引物的方法来避免基因组DNA及假基因(Pseudogenes)的影响。如分别在相邻的两个外显子上设计qPCR引物,这样基因组DNA的扩增片段与cDNA扩增片段相比就增加了一个较大的内含子,而荧光定量PCR的延伸时间很短,很难扩增出大片段,如果使用SYBR Green方式检测,一旦有来源于基因组的扩增片段出现也可以在分析溶解曲线时发现。而对于原核生物,必须经过DNase I消化去除基因组DNA;但是,很多实验者发现,跨内含子设计引物有时的实验结果不佳,原因可能是基因组DNA增加了模板的复杂
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