- 询价
- 2026年04月24日
企业认证
万千商家帮你免费找货
0 人在求购买到急需产品
- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
微生物基因组组装测序服务是一种专门针对微生物进行全基因组测序的服务，它不依赖于任何参考序列信息，使用生物信息学方法进行序列拼接获得该物种的基因组序列图谱，并进行基因组结构注释、功能注释、比较基因组学分析等一系列的后续分析。这项技术为研究物种起源进化及特定环境适应性提供了基础，广泛应用于农林鱼牧医药及海洋等各个方面。
实验流程
1. DNA样品提取：从材料中提取DNA。
2. 文库构建：将提取的DNA进行片段化，末端修复，接头连接，以及PCR扩增等步骤，构建适合测序的文库。
3. 高通量测序：使用高通量测序平台进行测序。
4. 数据分析：对测序数据进行质量控制、序列拼接组装、基因组注释、比较基因组分析等。
分析内容
1. 基因组de novo组装：利用测序数据组装基因组序列。
2. 基因组注释：对基因组中的基因、重复序列等进行注释。
3. 比较基因组分析：分析不同物种间的基因组差异，研究进化关系。
4. 共线性 /WGD分析：研究基因组的共线性关系和全基因组复制事件。
5. 基因组+重测序+代谢组+转录组/甲基化联合分析：整合多组学数据，研究性状调控机制。
应用方向
1. 微生物分类与鉴定：对微生物进行分类和鉴定，了解其在生态系统中的作用。
2. 进化研究：研究微生物的进化历史，了解其适应性和进化机制。
3. 功能基因挖掘：挖掘微生物中的功能基因，为生物技术应用提供资源。
4. 环境适应性分析：分析微生物对环境变化的适应性，了解其在环境变化中的作用。
5. 疾病机理研究：研究病原微生物的致病机理，为疾病防治提供科学依据。
6. 生物技术应用：利用微生物的功能基因开发新的生物技术产品，如酶制剂、生物肥料等。
风险提示：丁香通仅作为第三方平台，为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全，合理判断，谨慎选购商品，商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品，请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
文献和实验[1] Zhang Z, Xiao J, Wang H, Yang C, Huang Y, Yue Z, Chen Y, Han L, Yin K, Lyu A, Fang X, Zhang L. Exploring high-quality microbial genomes by assembling short-reads with long-range connectivity. Nat Commun. 2024 May 31;15(1):4631. doi: 10.1038/s41467-024-49060-z. Erratum in: Nat Commun. 2024 Aug 29;15(1):7493. doi: 10.1038/s41467-024-51890-w. PMID: 38821971; PMCID: PMC11143213.
[2] Bittleston LS, Gralka M, Leventhal GE, Mizrahi I, Cordero OX. Context-dependent dynamics lead to the assembly of functionally distinct microbial communities. Nat Commun. 2020 Mar 18;11(1):1440. doi: 10.1038/s41467-020-15169-0. PMID: 32188849; PMCID: PMC7080782.
相关专题 近日，美国麻省大学医学院(UMMS)的研究人员利用DNA互作频率数据，新研发出一种更快更准确的基因组装配方法。他们利用这一方法，给人类基因组的未完成区域补上了65个DNA片段。相关文章发表于2013年11月24日的《Nature Biotechnology》杂志上。 Nature子刊：UMMS研发新基因组 装配方法并成功将其应用复杂基因组 Job Dekker博士及其同事通过这项研究展示
基因组序列组装完整的和草图式的基因组测序 一旦鸟枪法测序阶段完成，所有的序列必须依据单一序列之间的相似性组装成连续序列。基因组中的重复区对于组装软件是重要的挑战。为协助解决这一问题，TIGR组装器(Sutton等，1995；Pop，Salzberg和Shumway，2002)确定了要进行组装的一组序列中的全部重复区，并且利用从单一克隆插入片段两端获得的正向和反向序列信息。如果重复区较克隆插入片段短，这个信号将与插入片段大小分布的信息共同指导以正确组装重复
Nature：2000 年前的 8 坨粪便，揭示肠道微生物进化与慢性病发展间的联系
样本和当代墨西哥来源粪便样本进行了从头基因组组装分析。从这些古粪便样本中，研究人员重建了 498 个微生物基因组，有 181 个显示了来自古人类肠道微生物的有力证据，其中 61 个是先前从未被描述过的，这表明在古代存在着不同于现代种群的微生物物种。 图片来源：Nature 微生物基因组功能学分析 最后，研究人员对微生物基因组进行了功能学注释分析，结果发现，相对于工业化样本，古粪便样本和非工业化样本中均富含转座酶。不过，与古粪便相比，工业化和非工业化样本中富含抗生素耐药基因 (其中许多是四环素耐药
技术资料暂无技术资料 索取技术资料
