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文献和实验杂交测序(sequencing by hybridization,SBH)
上特定位点的碱基特征。所以在实际操作中,杂交必须保证能够区分完全匹配和不完全匹配的探针。如果芯片 上包含72个碱基长度的寡核苷酸探针的所有可能组合和未知的检测DNA序列杂交,理论上,检测核酸任意,1个连续碱基区段都能找到互补的固定探针并与之杂交,称之为完全匹配杂交。其杂交信号比含错配DNA的杂交信号强,根据完全匹配杂交探针的重叠序列排列,重组探针,再现检测核酸的序列,这种方法就是杂交测序。 SBH所选择探针的碱基个数受杂交技术的发展限制,也和所检测的核酸复杂度有关。选择的长度至少必须有一定
,虽然起步较晚,但行动较快。以中国科学院大连化物所林炳承课题组研制出了准商品化的激光诱导荧光芯片分析仪和电化学芯片分析仪和相关的塑料分析芯片,浙江大学亦推出了玻璃分析芯片等为代表的一些研究单位已进行了卓有成效的研究,但是企业尚未真正投入到此行业中来。三、芯片实验室的要素与基本特点 1.芯片实验室的要素 按照目前的理解,芯片实验室是富有一定功能的,功能化芯片实验室大体包括三个部分:一是芯片;二是分析仪,包括驱动源和信号检测装置;三是包含有实现芯片功能化方法和试剂盒。 芯片本身涉及到两个方面:一是尺寸
,分析、推断有毒物质对不同生物的毒性可比性。如果不同类型的有毒物质所对应的基因表达诺有特征性的规律,那么,通过比较对照样品和有毒物质的基因表达谱,便可对各种不同的有毒物质进行分类,在此基础上通过进一步建立合适的生物模型系统,便可通过基因表达港变化来反映药物对人体的毒性。 已经有不少研究工作表明,利用DNA芯片预测化合物毒性和对毒性物质进行分类是可行的。 Waring等用15种已知的肝毒性化合物处理大鼠。这些毒物将对肝细胞造成多种伤害,如DNA 损伤、肝硬化、肝坏死和诱发肝癌等。从大鼠肝脏中
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