pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherr

产品简介：
pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherry-Puro&Zeocin是碧云天自行研发的用于方便地插入靶向目的基因的sgRNA (Single guide RNA)并使用CRISPR/Cas9基因编辑(Gene editing)系统进行基因编辑的质粒。本质粒表达mCherry便于观察转染效率或感染效果，同时携带了Puro抗性和Zeocin抗性(Bleo抗性)，方便后续进行多克隆或单克隆稳定细胞株的筛选。本质粒在插入靶向目的基因的sgRNA后，可以直接转染细胞进行基因编辑，也可以用于包装慢病毒后感染细胞或组织进行基因编辑。

慢病毒(Lentivirus)是以HIV-1 (人类免疫缺陷1型病毒)为基础发展起来的病毒载体系统。它能高效地将目的基因(蛋白质编码序列或小RNA)导入动物或人的原代细胞或细胞系。慢病毒的宿主范围广，对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力，可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上，从而达到持久性表达，被广泛应用到各种细胞系的基因过表达、RNA干扰、microRNA研究以及活体动物实验中[1-3]。本慢病毒载体进行了多方面的改造，删除了慢病毒绝大部分的致病基因，并使包装后的病毒失去了自我复制能力，安全性大大提升，并能有效提高外源基因的表达效果。本质粒可以和pCMV-VSV-G (D8215)以及pCAG-dR8.9 (D8216)配合使用进行慢病毒的包装。

本质粒经过BsmBⅠ (CGTCTC(1/5)^)限制性核酸内切酶消化后，切除图谱中标示的filler，把设计好的靶向特定基因的sgRNA序列经退火后形成的双链寡核苷酸片段连接到载体中，就能构建成相应的用于基因编辑的质粒了。

本质粒中使用了人源化脓性链球菌Cas9 (Humanized S. pyogenes Cas9, hSpCas9)。hSpCas9是一种能在sgRNA的引导下切割双链DNA的核酸内切酶。在sgRNA的引导下，Cas9剪切基因靶位点产生双链DNA断裂，随后在细胞DNA修复过程中会导致基因靶位点处的插入、删除或替换，从而可能产生移码突变，导致目的基因的缺失突变。当设计的sgRNA的基因靶位点相对比较靠近5'端的时候，就能导致通常所说的基因敲除。本质粒中在hSpCas9的C端添加了核定位信号(Nuclear localization signal, NLS)，能够有效确保hSpCas9定位在细胞核，从而有效提高基因编辑效率。

本质粒表达的Cas9带有Flag标签，可通过Flag抗体(AF0036/AF5051/AF519)检测Cas9的表达。同时本质粒中Cas9-Flag和mCherry之间通过P2A连接。mCherry与Cas9-Flag同时翻译，可以呈现很强的红色荧光，可以在荧光显微镜下非常便捷地观察到本质粒的表达情况(图1)，并且也方便使用流式细胞仪分选阳性细胞。P2A是一个可以被理解为含有19个氨基酸残基(ATNFSLLKQAGDVEENPGP)的“自剪切”小肽。但实际的过程并不是发生自剪切，而是使核糖体跳过P2A等2A元件C端的甘氨酸和脯氨酸肽键的合成而发挥作用，最终导致2A序列末端和下游产物分离。上游Cas-Flag的C端将会添加一些额外的P2A残基(GSGATNFSLLKQAGDVEENPG)，而下游蛋白的N端将会有额外的脯氨酸。在P2A肽的N端加入GSG序列，可提高剪切效率。

图1.碧云天pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherry-Puro&Zeocin质粒使用Lipo8000™转染试剂(C0533)转染293T细胞后的表达效果图。左侧为明场照片，右侧为荧光照片。

本质粒为氨苄青霉素(Ampicillin)、嘌呤霉素(Puromycin)和博莱霉素(Bleomycin)抗性。在大肠杆菌中呈现氨苄青霉素抗性。本质粒转染哺乳动物细胞后，可使用Puromycin Dihydrochloride (嘌呤霉素) (ST551)或者Zeocin (博莱霉素) (ST1450)筛选多克隆或单克隆细胞株。

pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherry-Puro&Zeocin质粒的主要信息如下：

Feature Nucleotide	Position
CMV promoter	1-199
5' LTR (truncated)	217-397
HIV-1 Ψ	444-569
RRE	1062-1295
cPPT/CTS	1822-1939
U6 promoter	1990-2230
filler	2235-4119
gRNA scaffold	4120-4195
EF-1α core promoter	4257-4468
Kozak sequence	4487-4496
Cas9	4493-8596
nucleoplasmin NLS	8597-8644
FLAG	8645-8668
P2A	8678-8734
mCherry	8735-9442
PuroR	9443-10039
WPRE	10055-10643
Factor Xa site	10526-10537
3' LTR (ΔU3)	10715-10948
bGH poly(A) signal	10980-11204
f1 ori	11250-11678
SV40 promoter	11692-12021
SV40 ori	11872-12007
EM7 promoter	12069-12116
BleoR	12135-12509
SV40 poly(A) signal	12639-12760
M13 rev	12809-12825
lac operator	12833-12849
lac promoter	12857-12887
CAP binding site	12902-12923
ori	13211-13799
AmpR	13970-14830
AmpR promoter	14831-14935
CMV enhancer	15201-15580

pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherry-Puro&Zeocin质粒(15581bp)的图谱如下：

pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherry-Puro&Zeocin的详细图谱见说明书

pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherry-Puro&Zeocin中没有的酶切位点包括：

AarI	AbsI	AscI	AsiSI	AxyI	BoxI	B-se21I
BstHPI	BstPAI	Bsu36I	Eco81I	FspAI	HpaI	I-CeuI
I-PpoI	I-SceI	KspAI	MreI	PaeR7I	PalAI	PI-PspI
PI-SceI	PshAI	PspXI	RgaI	SfaAI	SfiI	Sfr274I
SgfI	SgsI	SlaI	SrfI	XhoI

pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherry-Puro&Zeocin中的单酶切位点包括：

Acc65I	G`GTAC,C	1984	KpnI	G,GTAC`C	1988
AfeI	AGC|GCT	4483	MauBI	CG`CGCG,CG	12171
AgeI	A`CCGG,T	4470	NheI	G`CTAG,C	4208
AvrII	C`CTAG,G	12006	NotI	GC`GGCC,GC	907
BamHI	G`GATC,C	8669	PacI	TTA,AT`TAA	1980
BmtI	G,CTAG`C	4212	PflFI	GAC,NGTC	9482
BsiWI	C`GTAC,G	9496	PmeI	GTTT|AAAC	10958
BspDI	AT`CG,AT	3277	PvuI	CG,AT`CG	14413
BsrGI	T`GTAC,A	9435	RsrII	CG`GWC,CG	9556
BstBI	TT`CG,AA	2849	SbfI	CC,TGCA`GG	9090
BstZ17I	GTA|TAC	12771	SgrDI	CG`TCGA,CG	14964
ClaI	AT`CG,AT	3277	SnaBI	TAC|GTA	15556
EcoRI	G`AATT,C	4202	SpeI	A`CTAG,T	15215
EcoRV	GAT|ATC	6346	SwaI	ATTT|AAAT	3632
FseI	GG,CCGG`CC	12411	Tth111I	GAC,NGTC	9482
FspI	TGC|GCA	14265	XbaI	T`CTAG,A	4476

pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherry-Puro&Zeocin质粒可使用的测序引物序列如下：

sgRNA的测序引物hU6-F primer: 5'-GAGGGCCTATTTCCCATGATT-3'

pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherry-Puro&Zeocin的全序列信息:D8304 pLenti-U6-gRNA-Cas9-P2A-mCherry-Puro&Zeocin序列.txt

保存条件：

-20℃保存。

注意事项：

本质粒未经碧云天书面许可不得用于任何商业用途，也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。

本产品仅限于专业人员的科学研究用，不得用于临床诊断或治疗，不得用于食品或药品，不得存放于普通住宅内。

为了您的安全和健康，请穿实验服并戴一次性手套操作。