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产品介绍
RNA 上的化学修饰对于RNA的结构和功能起到了重要的调控作用，阐明RNA修饰的生物学意义需要能特异性检测、量化修饰核苷进行高灵敏度分析的工具。目前常用的检测方法，主要采用液相色谱与质谱联用(coupling of liquid chromatography to mass spectrometry, LC-MS) 技术。表观生物利用SCIEX Triple Quad 4500质谱平台，可精确检测10种常见的RNA修饰类型在各类样本中的修饰丰度。
仪器信息
液质联用仪：Applied Biosystems
型号：ExionLC AD / SCIEX Triple Quad 4500
离子源：TurbolonSpray
色谱柱：Agilent ZORBAX SB-Aq column（4.6 × 50 mm；填料尺寸1.8 μm）
修饰检测
RNA：m1A、m6A、m5C、pseudoU、4SU、5EU 、m7G、m6Am、N6,N6-mA、ac4C
可单独提供以下DNA修饰类型检测：6mA、5mC、5hmC、5hmU
样品要求
RNA样本，≥ 200 ng/样本（至少3次技术重复数据）
服务周期
20个工作日
结果示例
1. 原始数据：MS intensity-time数据，包括总离子色谱图（TIC）和单离子峰图（XIC）。
2. 样品修饰比例定量：标准曲线数据和样品定量结果。
案例
Mol Cancer：FBW7通过靶向N 6-甲基腺苷结合蛋白YTHDF2抑制卵巢癌的发展[1] 本研究鉴定了FBW7在卵巢癌中的潜在底物，并在体外和体内模型研究FBW7的生物学效应。利用LC/MS检测了卵巢癌组织中的m6A水平，再通过meRIP-seq和RNA-seq评估YTHDF2的下游靶标，综上表明FBW7通过拮抗卵巢癌中的YTHDF2介导的BMF mRNA衰变来抑制肿瘤的生长和进展。
LC-MS/MS检测敲降YTHDF2敲降组与对照组的RNA m6A水平
参考文献
[1] Xu F, Li J, Ni M, et al. FBW7 suppresses ovarian cancer development by targeting the N6-methyladenosine binding protein YTHDF2. Mol Cancer. 2021 Mar 3;20(1):45.
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- 作者
- 内容
- 询问日期
文献和实验[1] Xu F, Li J, Ni M, et al. FBW7 suppresses ovarian cancer development by targeting the N6-methyladenosine binding protein YTHDF2. Mol Cancer. 2021 Mar 3;20(1):45.
色谱 -质谱联用仪(GC-MS)在这类仪器中，由于质谱仪工作原理不同，又有气相色谱-四极质谱仪，气相色谱-飞行时间质谱仪，气相色谱-离子阱质谱仪等。 ② 液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)同样，有液相色谱-四器极质谱仪，液相色谱-离子阱质谱仪，液相色谱-飞行时间质谱仪，以及各种各样的液相色谱-质谱-质谱联用仪。 ③ 其他有机质谱仪，主要有：基质辅助激光解吸飞行时间质谱仪(MALDI-TOFMS)，富立叶变换质谱仪(FT-MS) 无机质谱仪，包括： ① 火花源
%～96%，而微球免疫方法能减少人力和试剂消耗，并缩短检测时间。在定量检测方面，国外也有报道。Dias等建立微球免疫方法，用于定量检测抗人乳头瘤病毒6、11、16和18型中和抗原的抗体，并根据检测结果确定用于临床诊断判定的抗体阈值。Lal等建立微球免疫检测方法，用于同时定量检测抗9种血清型肺炎链球菌的IgG抗体，研究表明，微球免疫液相蛋白芯片方法可用于肺炎链球菌疫苗免疫效果的评估。此外，国外还有报道建立液相蛋白芯片方法用于检测艾滋病病毒抗体、疱疹病毒抗体、麻疹和腮腺炎抗体、弓形虫抗体、呼吸
呈气态，流动相也是气体，与质谱的进样要求相匹配，故最容易将这两种仪器联用，且这种技术适合于低分子化合物，尤其适合于挥发性成份如农药残留、麻醉药品和精神药品的分析。 法医毒物分析有两大难点，难点之一是把要分析检验的毒物或毒品从生物性检材中提取出来，即在检验之前，被分析的生物检材要经过分离、提取和净化。难点之二就是部分被分析的毒物或毒品含量极微，或有的经过体内代谢变成了代谢物，母体毒物残留很少。通过气相色谱可以将微量的待测样品分离，进入质谱进行定性与定量检测，因此气质联用可以部分解决这些难点
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