注意:使用前请先在漂洗液中加入无水⼄醇,加⼊体积请参照瓶体上的标签。溶液YP1在使用前先加入RNaseA(将试剂盒中提供的RNaseA全部加入),混匀,置于2-8℃保存。
1、酵母双杂交技术适用于多个研究领域,包括但不限于以下方面:
● 蛋白质相互作用研究:酵母双杂交技术广泛应用于研究蛋白质之间的相互作用网络。通过识别和验证蛋白质间的相互作用关系,可以揭示蛋白质复合物的组成和结构,从而深入了解细胞信号传导、转录调控、代谢途径等生物过程。
● 蛋白质功能研究:通过酵母双杂交技术,可以研究蛋白质的功能和调控机制。例如,通过识别蛋白质与转录因子、核酸结合蛋白等的相互作用,可以了解蛋白质在基因调控中的作用,以及调控网络的建立和维持。
● 药物研发:酵母双杂交技术可应用于药物研发领域。通过筛选药物分子与靶蛋白之间的相互作用,可以评估药物的潜在效果和副作用,优化药物设计,加速药物发现过程。
● 疾病研究:酵母双杂交技术可用于研究与疾病相关的蛋白质相互作用。通过筛选与疾病相关基因的相互作用蛋白质,可以揭示疾病的发生机制,寻找潜在的治疗靶点。
● 进化生物学研究:酵母双杂交技术可以用于研究物种间的蛋白质相互作用。通过比较不同物种中的相互作用网络,可以了解蛋白质相互作用的进化变化,探究物种适应性和进化的基础。
总而言之,酵母双杂交技术在多个研究领域具有广泛的应用。它为研究蛋白质相互作用、揭示蛋白质功能和调控机制、药物研发和疾病研究等提供了有力的实验工具和方法。
2、酵母诱饵该选择全长还是核心区域?
(1)全长:
优点:更接近于自然条件下的环境;
缺点:有时候过于长,导致构建具有一定的难度,更可能的产生自激活现象。
(2)预测的核心元件(<20bp):
优点:核心元件用于后续的EMSA验证试验,对核心位点进行突变验证启动效果是否减弱,相对全长启动子而言突变的区域较少操作更为方便;
缺点:核心元件虽然是启动的核心区域,但是启动子的其他区域也可能是作为辅助元件而存在的,如果缺少这些部分就是非自然条件下的环境,可能产生假阴性。
(3)蛋白结构功能域:
优点:能准确的研究出这部分区域是否在全长中行使重要的功能,为同一类型的功能研究具有重要的意义;
缺点:不确定其他功能域是否与它一起行使其他功能,或者需要二者之间的搭配才能行使某一项功能,可能会产生假阴性。
3、酵母杂交发生假阳性的原因及解决方式
产生原因:
(1)由于BD融合诱饵蛋白有单独激活作用,或者其激活作用被外来蛋白激活。
(2)AD融合靶蛋白如果有DNA的特异性结合,也可以单独激活报告基因的表达。
(3)BD和AD在文库中会有随机碰撞导致空间上的接近,以致下游报告基因的表达。
解决方法:
(1)对于点对点验证来说,可同时将诱饵和猎物进行自激活验证,减少假阳性的判定,但是一旦诱饵和猎物均产生自激活,后续自激活的处理方式(截短)会浪费较多的时间;(我们一般不采取这种解决方式)
(2)由于每个报告基因上游的调控区各不相同,因此用不同的报告基因验证阳性,可用于排除或减少假阳性;(我们主要采用这种解决方式)
(3)单杂启动子,我们主要采用将报告基因整合到酵母的染色体上,可以使基因表达水平文档,消除了由于质粒拷贝数变化引起的基因表达水平的波动而造成的假阳性。