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- 详细信息
- 文献和实验
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- 保存条件:
Keep in dark place,Sealed in dry,2-8°C
- 保质期:
2年
- 英文名:
1-(5-(Aminomethyl)pyridin-2-yl)pyrrolidin-3-ol
- 库存:
999
- 供应商:
北京康瑞纳生物科技有限公司
- CAS号:
1220036-39-4
- 规格:
1g
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文献和实验, 2001, 47(7): 1183-9.[38]Eads C A, Danenberg K D, Kawakami K, et al. MethyLight: a highthroughput assay to measure DNA methylation [J]. Nucleic Acids Res, 2000, 28: E32.[39]范保星. DNA甲基化检测方法 [J]. 国外医学遗传学分册, 2002, 25(2): 99-101. [40]Yan P S, Chen C M, Shi H
脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变(见图1),行PCR扩增所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶,最后,对PCR产物进行测序并且与未经处理的序列比较,判断是否CpG位点发生甲基化。此方法是一种可靠性及精确度很高的方法,能明确目的片段中每一个CpG位点的甲基化状态,但需要大量的克隆测序,过程较为繁琐、昂贵[27]。 图1:重亚硫酸盐处理过程示意图。DNA经重亚硫酸盐处理后,甲基化的胞嘧啶不变,未甲基化的胞嘧啶转变为尿嘧啶 2.2.3 甲基化特异性的PCR(methylation
数据库,GEO 和 TCGA。下面介绍三种提取注释信息的方法方法一:从 UCSC Xena 下载直接从 UCSC Xena 相应的癌症甲基化数据库里下载对应的文件。可以看到是来自 GPL16304 平台的芯片,其实和下面要介绍的从 GEO 下载注释信息是一样的,不过 TCGA 的探针数可能会少于 45w,大约 39w,因为提前过滤了一些低质量的探针。方法二:从 GEO 下载对应平台的注释文件在 GEO 的官网 platform 下搜索 Illumina HumanMethylation450,可以看到
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