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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
避光/低温保存
- 保质期:
12个月
- 英文名:
肠道病毒C组探针法荧光定量RT-PCR试剂盒
- 库存:
大量
- 供应商:
江西江蓝纯生物试剂有限公司
- 规格:
50次
产品及特点:
肠道病毒(Enterovirus)引起的传染病,临床表现轻者只有倦怠、乏力、低热等,重者可全身感染,脑、脊髓、心、肝等重要器官受损。本类疾病分布于世界各地,在热带和亚热带全年都有,在温带夏季多见,在温暖、潮湿、卫生条件差、人群拥挤的地区发病率高。肠道病毒共含有 71 个血清型。本产品以探针法荧光定量 RT-PCR 技术为基础开发的专门检测肠道病毒 C 组的试剂盒,
它具有下列特点:
1. 即开即用,用户只需要提供样品 RNA 模板。
2. 引物和探针经过优化,灵敏性高。
3. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4. 特异性高,引物是根据肠道病毒C组高度保守区设计,不会跟其他病毒的RNA发生交叉反应。
5. 本产品足够 50 次 20μL 体系的探针法荧光定量 RT-PCR 反应。
6. 本产品由江蓝纯生物提供,不得用于临床诊断。
规格及成分:
| 编号 | 成分 | 规格 |
| 试剂一 | 探针法 qRT-PCR 缓冲液 | 500 μL(蓝盖) |
| 试剂二 | 探针法 qRT-PCR 酶混合液 | 100 μL(红盖) |
| 试剂三 | 荧光 PCR 专用模板稀释液 | 1 mL(黄盖) |
| 试剂四 | 肠道病毒C组探针法qRT-PCR引物混合液 | 100 μL(白盖) |
| 试剂五 | 肠道病毒C组 qRT-PCR 探针 | 50 μL(棕色管) |
| 试剂六 | 肠道病毒C组探针法qRT-PCR阳性对照(1×10E8/μL) | 50 μL(黄盖) |
| 使用手册 | 1 份 | |
低温运输、-20℃保存,有效期一年。
自备试剂:
样品 RNA。
肠道病毒C组探针法荧光定量RT-PCR试剂盒
使用方法:
一、稀释标准曲线样品(以 10E2-10E7 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例):
由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的 DNA 片段作为阳性对照。
1. 标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
2. 用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 RT-PCR 专用模板稀释液,用带芯枪头,下同)。
3. 在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
4. 换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品 RNA 的制备:
7. 如果有 N 个样品,设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照),一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL 阳性对照的 10000倍稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为PC。另外用水作为 NC。
8. 用自选方法纯化样品的 RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒 RNA 提取试剂盒兼容。也可以选购本公司的柱式病毒 RNAout。
三、Probe qRT-PCR 反应(20μL 体系,在样品制备室进行):
9. 如果做定量分析并且只做 1 次重复,则标记 N+9 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1 次重复,则标记 N+4 个 PCR管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),1 个用于 PCR 阳性对照(用第 4 号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
10. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后加):
| 成份 | 样品管 N+2个 |
RT-PCR阴性对照管 | 标准曲线样品管 (2-7管) |
| 探针法 qRT-PCR 缓冲液 | 各 10 μL | 10 μL | 各 10 μL |
| 探针法 qRT-PCR 酶混合液 | 各 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
| 肠道病毒C组 qRT-PCR 探针 | 各 1 μL | 1 μL | 各 1 μL |
| 肠道病毒C组探针qRT-PCR引物混合液 | 各 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
| 待测样品 RNA 模板 | 各 5 μL | -- | -- |
| 超纯水 | -- | 5 μL | -- |
| 第7步所得标准曲线样品稀释液(2-7号) | 不加 | 不加 | 各5 μL (2号样到2号管,3号样到3号管) |
| 过程 | 温度 | 时间 |
| 逆转录 | 50℃ | 30 min |
| 预变性 | 94℃ | 10 min |
| qRT-PCR反应35个循环 | 94℃ | 15 sec |
| 60℃ | 1 min,(采集FAM通道的荧光信号) |
12. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品RNA 浓度的 log 值,再推算出其浓度。
13. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct 必须大于或等于 40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于 30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 40 则为阴性,如果小于或等于 35 则为阳性。如果在 35-40 之间,则重复一次。重复实验的 Ct值如果大于或等于 40 则为阴性,如果小于 40,则为阳性。
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文献和实验性引物。在引物探针设计时就需要特别考虑扩增片段不能太长,否则那些降解的RNA片段无法被检测到,导致得到的结果不准确。 QIAGEN 全新发布的TaqMan引物探针 - QuantiFast Probe Assays就特别考虑到了 另外由于FFPE样品中的核酸高度片段化且相互交联,抽提得到的RNA中有较多的基因组DNA片段残留,这些残留的gDNA也会被扩增出来,严重影响了基因表达分析结果的真实性。 QIAGEN 全新发布的探针法检测试剂盒 -QuantiFast Probe RT-PCR
上还连接有MGB (Minor Groove Binder)修饰基团,可以将探针的Tm值提高10°C左右。因此为了获得同样的Tm值,MGB探针可以比普通TaqMan探针设计得更短,既降低了合成成本,也使得探针设计的成功率大为提高——因为在模板的DNA碱基组成不理想的情况下,短的探针比长的更容易设计。实验证明,TaqMan MGB探针对于富含A/T的模板可以区分得更为理想。 Taqman探针法已经得到广泛使用,不过有人认为这种技术利用了Taq酶5`—3`外切酶活性,一般试剂厂家只给Taq
也大叹“Very expensive, especially for small projects”。 咱们做实验的,对试剂的要求自然是1.质量可靠 + 2.价格相宜,前者保证实验早出结果,出好结果,不要太多折磨,后者则是要老板承受得起,毕竟没有病人替我们买单。因此自行设计定制标记探针就是多数“第三世界”实验室的选择。Taqman探针法的第二大类产品就是不带探针引物的通用探针法定量检测试剂盒——有酶、Buffer、内参等等配套试剂,模版引物探针自备。大家关心的问题不外是:1.哪一家探针合成标记










