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Interaction Research Kit
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武汉金开瑞生物工程有限公司
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1 凝胶迁移或电泳迁移率检测(EMSA)
凝胶迁移或电泳迁移率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay,EMSA)是一种检测蛋白质和DNA 序列相互结合的技术,可用于定性和定量分析。目前已用于研究DNA 结合蛋白和特定的DNA 序列的相互作用,是转录因子研究的经典方法。
2 染色质免疫共沉淀技术(ChIP-qPCR)
ChIP染色体免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是用来研究蛋白质与DNA是否在体内存在相互作用,这项技术帮助研究者判断在细胞核中基因组的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰。利用抗体抗原特异性结合,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来,能够真实地反映结合在DNA序列上的调控蛋白。
3 DNA pull down
DNA pull down是用于分析蛋白质与DNA互作的一种分析技术。一般来说,该实验首先需要针对待研究目的基因的调控区域设计并制备特异性探针(以脱硫生物素标记为主流);同时,制备细胞核提取物;将探针和核提取物共同孵育,DNA结合蛋白就会和靶向序列特异性结合;然后,通过亲和素磁珠纯化蛋白质DNA复合物;最后针对获得的蛋白,使用WB验证或者质谱方式鉴定蛋白质类型。
应用:寻找已知的启动子序列所结合的未知蛋白(转录因子)
4 酵母单杂交(Y1H)
酵母单杂交技术是在酵母双杂基础上发展而来的一种研究核酸-蛋白相互作用的工具,被广泛用于研究真核细胞内基因的表达调控,如鉴别DNA结合位点发现潜在的结合蛋白基因、分析DNA结合结构域信息等。
5 RNA pull down
蛋白质与RNA 的相互作用是许多细胞功能的核心,如蛋白质合成、mRNA 组装、病毒复制、细胞发育调控等。使用体外转录法标记生物素RNA 探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过WB 实验检测特定的RNA 结合蛋白是否与RNA 相互作用。若待检测目的蛋白明确,选择WB鉴定;若不明确,则可选择质谱鉴定。
金开瑞现提供RNA pull down 检测技术服务, 使用特异性二抗进行检测,能有效避免抗体重链对结果的信号干扰。并且金开瑞配套自己的质谱平台,能显著提升检测效果。
6 RNA 结合蛋白免疫沉淀(RIP)
RIP 技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 结合蛋白免疫沉淀)主要是运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA 进行q-PCR验证或者测序分析。RIP 是研究细胞内RNA 与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,可以帮助我们发现miRNA 的调节靶点。
根据客户需求,金开瑞可以提供RNA/蛋白、RNA/RNA互作验证RIP技术服务。
7 GST pull down
利用带有标签的已知蛋白作为诱饵蛋白(最常用的是GST标签,即谷胱甘肽巯基转移酶,glutathione S-transferase),诱饵蛋白特异性结合谷胱甘肽亲和树脂,当目的蛋白溶液过柱时,将诱饵蛋白及其相互作用的蛋白复合物捕获。复合物洗脱后,通过蛋白凝胶电泳分析两种蛋白间的相互作用,或者筛选相应的目的蛋白。
8 CO-IP
免疫共沉淀技术(co-Immunoprecipitation, co-IP)是一种研究两种蛋白在体内是否存在相互作用的有效方法,通过抗体和已知蛋白结合,从而捕获整个已知蛋白复合物,进而研究复合物中与已知蛋白存在相互作用的蛋白。
9 酵母双杂交
酵母双杂交及系统是一种鉴定和检测蛋白质相互作用的研究方法,因其具有灵敏性高、功能强大、适用范围广等特点,现已被应用于多个研究领域。
金开瑞可提供酵母杂交文库构建、核酵母双杂交筛选、膜酵母双杂交筛选、酵母单/双杂交验证服务。
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文献和实验浅析染色质免疫沉淀(ChIP)技术在 DNA 与蛋白质相互作用研究中的重要性
染色质免疫沉淀(ChIP)是研究蛋白质-DNA 相互作用的一项强大技术,广泛用于多个领域的染色质相关蛋白的研究(如组蛋白及其异构体,转录因子等),特别适用于已知启动子序列或整个基因位点的组蛋白修饰分析研究。这项技术采用特定抗体来富集存在组蛋白修饰或者转录调控的 DNA 片段,通过多种下游检测技术(定量 PCR ,芯片,测序等)来检测此富集片段的 DNA 序列。 ChIP 技术自诞生之后,已成功的应用于人或动物细胞和组织 [1] 、植物组织 [2] 、酵母 [3] 以及细菌、质粒
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)【1】是一种研究蛋白质-DNA 相互作用的新技术。与传统的染色质免疫沉淀(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)相比,CUT&Tag 具有信噪比高、可重复性好、实验周期短(1 天实现从细胞到文库构建)、细胞投入量低等显著优势。该方法一经问世,便受到广大科研工作者的青睐。 在过去的一年时间里,科研工作者在动物、植物细胞中成功应用 CUT&Tag
蛋白表达系统在表达膜蛋白、有毒蛋白、二硫键蛋白、抗体片段等方面具有独特优势。由于可以使用线性模板,利用PCR方法就可以轻松实现在目的基因两侧加入需要的转录和翻译所需的因子,不需要繁琐的载体构建过程。线性模板的使用还可以实现蛋白的高通量合成和筛选。 ALiCE® Kit无细胞蛋白质表达试剂盒 (植物细胞裂解液) (Sigma货号:AL0103000) ALiCE®无细胞蛋白质表达试剂盒是一种独创的真核无细胞系统,可利用植物细胞裂解物在批量处理模式下将蛋白质产量提升到前所未有的3mg/mL。ALiCE®
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