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24rxn
riboPOOL 24 reactions probes (Pan-Pro)
1年
蓝景科信
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原核通用型riboPOOLs核糖体RNA去除
覆盖广泛的原核生物(细菌/古生菌),适合微生物培养物、宏基因组、微生物组群分析
去除目标涵盖 5S, 16S and 23S rRNA
原核通用型 riboPOOL设计依据:
基于76个代表性物种的rRNAs 序列设计的微生物通用型 riboPOOL,适合图中所示的类群(内圈,粗体)和亚群(外圈)所涵盖的细菌和古细菌。
*如果您感兴趣的物种不属于这些类群或亚群,请咨询我们的定制型riboPOOLs产品。
**译注:暂无中文译名
原核通用型 riboPOOL已验证物种(RNA-Seq)
测试结果来自不同的实验室,rRNA去除效率从~50-98%不等,在大多数物种中rRNA去除效率> 70% 。去除效率可能因样品类型和实验条件的不同而不同。高质量的RNA样本中效率最高。推荐的起始RNA投放量为100 ng - 5 μg。
已检测的物种 | 去除效率验证 |
大肠杆菌 | √ |
鼠伤寒 沙门氏菌 | √ |
霍乱弧 菌 | √ |
金黄色 葡萄球菌 | √ |
凯伍热厌氧菌 | √ |
鲍氏不动杆菌 | √ |
恶臭假单胞菌 | √ |
热醋穆尔氏菌 | √ |
紫色杆菌 | √ |
具核梭杆菌 | √ |
幽门螺杆 菌 | √ |
空肠弯曲杆菌 | √ |
艰难梭菌 | √ |
riboPOOLs应用方向:
为了从含有多个物种的样本中去除rRNA,或为便于在包含多个物种的样本中使用一种试剂盒,可以使用组合riboPOOLs。这些可由客户指定以一定比例进行组合,至多可实现四种现成riboPOOLs的混合物。对高质量RNA样本的内部测试显示,组合riboPOOLs(人类/小鼠/泛原核生物)从人类、小鼠和大肠杆菌RNA中去除rRNA的表现与物种特异性 riboPOOLs效果类似。然而,siTOOLs不能确保组合riboPOOLs在所有样品类型中具有相似的去除效率,因为去除效率也高度依赖于样品的质量。
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