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一般描述
T7 RNA 聚合酶通常用于转录DNA,这些 DNA 已经克隆到具有两个相反方向的噬菌体启动子的载体中。可以使用不同的聚合酶,从插入 DNA 的任一链,选择性地合成 RNA。使用该系统可以产生同源标记的单链 RNA。转录物可以用生物素或 DIG-11-UTP 进行非放射性标记,或用 [α-32P] 或 [α-35S] 标记的核苷酸放射性标记至高比活性。杂交探针的合成:T7 RNA 聚合酶能高效生产均一标记的 RNA。该标记的 RNA 可用作 Southern、Northern 和斑点印迹中的杂交探针,以及原位杂交。
合适的标记:转录物可以用生物素-16-UTP 或 DIG-11-UTP 进行非放射性标记。它们也可以用 [α-32P]- 或 [α-35S] 标记的核苷酸放射性标记为高比活性。
特异性
启动子特异性T7 RNA 聚合酶具有极高的启动子特异性,仅转录噬菌体 T7 DNA 或克隆到T7 启动子下游的 DNA。尽管 T7 和 T3 启动子序列仅相差 3bp,但 T7 RNA 聚合酶仅转录克隆到其启动子下游的DNA。
热灭火:通过加入 2 μl 0.2MEDTA(pH8.0)和/或加热至 65℃ 来终止反应。
应用
- T7 RNA 聚合酶可以转录来自 T7 启动子下游的克隆 DNA 模板的 RNA。可以用标记的 NTP 进行合成以产生高度标记的 RNA。合成的 RNA 有多种应用,包括:RNA 或 DNA 印迹技术
- 原位杂交
- RNA 酶保护研究:由酶合成的转录物可用作 RNA 剪接和加工研究的前体 RNA。
- 通过在转录反应期间加入 m7GpppG 或 m7GpppA 超过 GTP 或 ATP,以在体外合成加帽的 RNA。可以将产生的反义 RNA 引入细胞中,以抑制相应基因的表达。
- 微阵列靶标合成
包装
1个试剂盒包含2个组分单位定义
一个单位是在 + 37°C 下,60 分钟内,在酸可沉淀的 RNA 产物中掺入 1nmol CMP的酶活性。体积活性:≥20 U/μl
制备说明
激活剂:T7 RNA 聚合酶被 BSA 或亚精胺强烈激活。其他说明
测试缓冲液40mM Tris-HCl,pH 8.0(+ 20℃),6mM MgCl 2,10mM 二硫苏糖醇,2mM 亚精胺,pH 约 8.0(+ 20℃)。
缺乏内切核酸酶
1。将 1 μg DNA 与 T7 RNA 聚合酶在 + 37℃ 下,在 25 μl 测试缓冲液中孵育 4 小时。显示没有 λDNA 降解的酶单位数 >100 U。
2。将 1 μg Eco RI/Hind III 片段的 λDNA 与 T7 RNA 聚合酶在 + 37℃ 下,在 25 μl 测试缓冲液中孵育 4 小时。显示条带图案没有改变的酶单位数 >100 U。
缺乏切割活性
1 μg pBR322DNA 与 T7 RNA 聚合酶,在 + 37℃ 下,在 25 μl 测试缓冲液中孵育 4 小时。显示没有松弛超螺旋结构的酶单位的数量 >100 U。
缺少 RNA 酶
4 μg MS2 RNA 与 T7 RNA 聚合酶,在 + 37℃ 下,在 50 μl 测试缓冲液中孵育 4 小时。显示没有 MS2 RNA 降解的酶单位数 >100 U。
转录实验中的性能
T7 RNA 聚合酶在 SP6/T7 转录试剂盒(目录编号 10 999 644 001)。使用Eco RI和50mCi [alpha-32P] CTP,[400 Ci/mmol(15 TBq/mmol)] 线性化的 0.5 μg pSPT19neo DNA 的标准测定中的掺入率,在20分钟内,产生 >50% 的输入放射性。
仅用于生命科学研究。不适用于诊断程序。
Roche 公司有 10x 浓缩 RNA 标记混合物,专为 DIG-或生物素标记而设计。这些混合物可以与 T7 RNA 聚合酶很好地联合使用。
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文献和实验一般是指 DNA依存性 RNA聚合酶。是催化以 DNA为模板( template)、三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成 RNA的酶。因为在细胞内与基因 DNA的遗传信息转录为 RNA有关,所以也称转录酶。反应以下式示: n1 -n4 表示各个模板的 DNA链的胸腺嘧啶、胞嘧啶、鸟嘧啶、腺嘌呤的碱基数。通过特异的碱基配对的形成,合成具有与模板 DNA链完全互补的碱基排列的 RNA。反应是由( 1) DNA与酶的结合
,则可计算其直径约为100A,即约为双链DNA的30bp节段的长度。然而全酶可结合约60个核苷酸 ,提示其形状应为椭圆球形。 结构 为什么细菌 的RNA聚合酶需要这么大和复杂的分子结构呢?而某些噬菌体特有的RNA聚合酶则要小得多,仅由一条多肽链组成。这证明RNA合成所需的机构可以远比宿主的酶小。这种情况说明,噬菌体内的转录仅需一条"最小"的机构。然而这种酶只能识别噬菌体本身所有的少数几个启动子;它们不能识别其他启动子。例如噬菌体T3和T7的RNA聚合酶分子很相似
来提高灵敏度。 小分子RNA探针的制备 方法其实很简单:只需要准备目的基因的一小段寡核苷酸序列,3'端另外增加8个和T7启动子互补的碱基,将这段寡核苷酸和T7启动子引物退火,用Klenow大片断补齐得到双链的转录模版,然后用T7RNA聚合酶、rNTP和标记物混合,体外转录得到标记的小分子RNA探针。这种方法可以快速制备各种标记(同位素、非放射性标记均可)的小于100nt的小分子RNA探针,适用于包括RPAs,Northerns和原位杂交等各种方法检测小分子核仁RNA(small nuclear
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