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一般描述
试剂盒用于通过SP6和T7聚合酶进行的体外转录而实现基于UTP的RNA标记。通过这种方法,已知长度的单链RNA探针被生成,而这可用于多种杂交技术中。我们致力于为您提供更环保的替代产品,以符合“绿色化学的12项原则”的一项或多项原则要求。该产品为一种安全的化学品。 DIG系统是灵敏且具有成本效益的方案,可替代放射性标记和放射法检测核酸。有许多已发表论文证明了DIG系统的通用性,因此,使用放射性标记不再是标记用于杂交的DNA的唯一选择。
检测时间:145分钟
样品材料
- 线性化质粒DNA
- PCR产物
DIG RNA标记试剂盒可产生已知长度的DIG标记单链RNA 探针。SP6或T7 RNA聚合酶都可在体外对来自模板DNA(在UTP存在情况下)对这些探针进行转录。
RNA标记通过体外转录完成
待转录的DNA被克隆至含有SP6及T7 RNA聚合酶的合适转录载体的多接头位点(如pSPT 18或19)。相邻的模板DNA在合适的位点进行线性化而RNA聚合酶用于生成“流失的”转录本。DIG-UTP被插入至转录本中。新合成RNA的每个第20至25个核苷酸都是DIG-UTP。由于核苷酸的浓度在标准转录反应中并不会成为限制,该反应可生成大量的标记RNA。
特异性
灵敏度及特异性DIG标记的RNA探针可在最低至1 μg的哺乳动物DNA中按照以下的检测条件进行单拷贝基因的检测:该杂交混合液包含20至100 ng标记探针/ml,而结合的探针可通过抗DIG-AP进行检测并通过化学发光底物CDP-Star进行可视化。
热灭活:添加 2 μl 0.2 M EDTA (pH 8.0) 终止反应。
应用
用于利用SP6及T7 DNA聚合酶通过体外转录而使用DIG-11-UTP进行RNA标记。DIG标记的“流失”转录本是以高效率进行合成的,并用于多种杂交技术:- Northern blots
- Southern blots
- 原位杂交
- 菌斑或克隆提升
- RNase保护试验
注意:由于DIG和UTP之间的连接对于碱具有抗性,DIG标记的RNA可通过碱处理进行片段化。略微降低DIG标记的RNA探针的大小可能会使其更为适合于原位杂交中的特定应用。
包装
1个试剂盒包含12种组分。质量
检测原理:待转录的DNA模板将会被克隆至含有SP6及(或)T7 RNA聚合酶启动子的合适转录载体的多接头位点。当在合适位点进行线性化后,RNA在DIG-UTP的存在下进行了转录。在标准条件下,来自1μg 模板的约10μg的全长DIG标记RNA被转录。其他说明
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文献和实验相关实验
包括pSP64和pSP65,它们具有不同的启动子在多克隆位点的各侧。Psp64和pSP65在sP6启动子的多克隆位点的方向是不同的。通过改变外源基因的插入方向或选用不同的RNA聚合酶,可以控制RNA的转录方向,即以哪条DNA链为模反转录RNA。从而可以得到与mRNA同序列的同义RNA探针(Sense probe)和与mRNA互补的反义RNA探针(antisense probe),又称互补RNA探针(complementary RNA probe , cRNA)。通常用同义RNA探针做为反义RNA
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DIG RNA标记试剂盒(SP6/T7) 11175025910 现货特价
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