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1年
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性能正常
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上海实维实验仪器技术有限公司
NextSeq 500:
台高通量的台式测序仪
NextSeq 500测序系统带来了高通量测序的通量以及台式NGS(新一代测序)系统的快速、简约和经济。这个快速、完整、从样品到结果的流程实现了许多测序应用 – 包括外显子组、全基因组和转录组 – 只需单次运行。这个NGS系统可无缝融入研究实验室,而无需专门的设备。如今,研究人员可开展高和低通量的测序应用组合,以推进他们的研究。
灵活扩展的NGS系统,适合所有应用
有了NextSeq 500系统,研究人员可在一个平台上开展多个测序应用。NextSeq 500系统是一台能够在单次运行中以高覆盖度(30倍)对人类全基因组测序的NGS系统。它也为多个流行的测序应用带来了周转时间。研究人员只需按一下按钮,就能在两种配置间转换,在需要时开展较低通量的测序应用或处理较小的样品批量。
全基因组测序
NextSeq 500系统凭借行业的Illumina测序技术,带来了的覆盖度,可整个基因组中的变异。通过一键式的测序和极少的手工操作,NextSeq全基因组测序解决方案让研究人员可分析任何基因组,从微生物到人类。
外显子组测序
NextSeq 500系统提供了一种简单、的外显子组测序方法,以真正的编码变异,成功测序困难的基因组区域。Illumina的外显子组测序方案包括完整的文库制备和外显子组富集、一键式测序和简单的数据分析。通过极少的手工操作,研究人员可更准确、地拷问更多外显子组。
转录组测序
RNA测序让研究人员能够更深入地了解基因表达,并用于转录本亚型、新的转录本和基因融合。NextSeq RNA测序解决方案凭借行业的Illumina技术,带来了整个转录组的详细快照。这种解决方案让研究人员能够定制他们的研究,从基因表达到复杂的全转录组图谱分析。
快速轻松的流程
为缩短设置时间而设计,NextSeq 500系统特有上样即运行的流程和直观的用户界面。用户只需上样流动槽和试剂夹盒,然后按下按钮,即可测序。无需额外的设备,NextSeq 500系统将簇生成、边合成边测序和和碱基检出整合在单台NGS系统中。在运行过程中,研究人员可通过仪器或在任何位置***运行表现。为了简化运行管理、下游分析和数据共享,NextSeq 500系统提供了连接到BaseSpace的选项,这是Illumina的基因组学计算环境,有云端和现场软件包可供选择。
一个完全集成的测序生态系统
NextSeq 500测序系统设有一个特殊的用户界面和上样即运行的流程。NextSeq 500系统将簇生成和测序整合在单台仪器中,实时地产生碱基检出和质量指标。测序是自动且快速的,可在1天内产生数据。数据自动转移到BaseSpace环境中,进行简化的分析、存储和共享。
成熟的Illumina技术
Illumina的边合成边测序(SBS)原理是世界上成功且广泛采用的NGS技术。NextSeq 500系统与Illumina所有的NGS系统一样,采用成熟的可逆终止子SBS技术,并融合近期在缩短循环和数据处理时间上的创新。这种技术实现了大规模并行测序,并带来了行业的测序准确性。
成熟的动力
NextSeq 500测序系统利用Illumina边合成边测序(SBS)原理的进展 – 这一成熟、高度准确的可逆终止子技术被Illumina所有测序平台所使用。
简化的信息学
有了Illumina的信息学解决方案,研究人员无需生物信息学知识,也能从样品到发表。NextSeq 500系统的软件旨在限度地减少设置时间和用户错误的风险,让研究人员能够在任何时候从任何地方查看实时数据和性能指标。可选的BaseSpace解决方案有云端和现场环境可供选择,为准备运行、跟踪样品以及存储、分析和共享基因组数据提供了一种轻松而经济的方式。
端对端的科学支持
当NextSeq 500系统发货时,Illumina的技术支持即开始行动,Illumina的科学家和工程师会协助系统的安装和设置,以及实验室人员的培训。除了现场支持,我们还提供培训课程,让实验室人员快速走上正轨。Illumina的科学家全年无休地解答每个步骤中的问题,让研究人员能够专注于下一个突破性的发现。



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文献和实验对某文库全部片段进行末端序列测定中未测到的碱基数,即缺口(gap),与已测定的总碱基数相关。随着已测定碱基数的增加,缺口的总碱基数目会按照泊松公式的一个推论(P=e-m )迅速减小。其中P为中某个碱基未被测定的概率,m为所测定的碱基数与大小相比的倍数。m越大P值越小。当m值达到5(即随机测定的碱基数达到5倍时),基因组中未测定的碱基数为总碱基数的0.67%(e-5 =0.0067)。对流感嗜血杆菌这样大的(1.83Mb),可能留有128个平均长度为100bp的缺口。全鸟枪法测序的主要步骤
。 简而言之,RNA-Seq 使我们能够以前所未有的灵敏度评估整个转录组,并在特定于所研究主题的条件和时间点下生成转录组的快照。尽管这是对更广泛的 RNA-Seq 领域的非常合适和简短的总结,但仍有许多类型的 RNA-Seq 可供尝试。 短读长测序是 RNA-seq 的常用方式。测序通常从样本材料中生成的较短的插入片段,长度在 50 – 500 bp 之间,然后在下游数据分析中重新组装或计数。长读长测序经常在 DNA-Seq 和 RNA-Seq 中以高容量确定手头样本的序列,例如,一次 10,000 –
打开峰图文件,依据图形初步判定测序质量,SAP酶纯化后的头峰杂度比较大,至少前50bp序列一般不可信,后续峰形如果还不错,主峰高、噪峰低、未见干扰峰,测序结果应该可信。一个正常的成功反应,能保证测序峰形清晰的长度为500 Bases (实际600 —800 Bases)。 在进行DNA测序时,紧接引物的10 — 30 Bases有时不一定能完全读清楚。 由于DNA结构上的原因,有时会出现反应中途无法进行之情况。如:G/C rich; G/C Cluster;Poly A、 Poly T的连续
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