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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
-20
- 保质期:
2年
- 英文名:
Plasmid #55838;DsRed2-Mito-7
- 库存:
100
- 供应商:
上海烜雅生物科技有限公司
- 规格:
干粉/液体
名称:pDsRed2-Mito线粒体定位质粒
别称: Plasmid #55838;DsRed2-Mito-7
| 启动子: | CMV |
|---|---|
| 复制子: | pUC |
| 终止子: | SV40 poly(A) signal |
| 质粒分类: | 哺乳系列质粒;哺乳荧光质粒;哺乳红色质粒 |
| 质粒大小: | 4715bp |
| 质粒标签: | N-DsRed2 |
| 原核抗性: | Kan |
| 筛选标记: | G418 |
| 克隆菌株: | DH5a |
| 培养条件: | 37度 |
| 表达宿主: | 293T等哺乳细胞 |
| 培养条件: | 37℃,5%CO2 |
| 诱导方式: | 无须诱导,瞬时表达 |
| 5'测序引物: | CMV-F(CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG) |
| 3'测序引物: | SV40-polyA-R(GAAATTTGTGATGCTATTGC) |
| 备注: | 哺乳细胞线粒体红色荧光定位质粒 |
质粒属性
| 载体宿主: | 哺乳细胞 |
|---|---|
| 载体用途: | 亚细胞定位 |
| 基因种属: | |
| 基因类型: | |
| 原核抗性: | Kan |
| 真核抗性: | Neo/G418 |
| 荧光蛋白: | 红色 |
质粒简介
pDsRed2-Mito是一个哺乳细胞线粒体定位质粒,含有密码子优化过的红色荧光蛋白基因DsRed2和人细胞色素c氧化酶(Mito)亚基VIII的线粒体靶向序列。
质粒图谱
质粒序列
LOCUS Exported 4715 bp ds-DNA circular SYN 02-8-2017
KEYWORDS pDsRed2-Mito
SOURCE synthetic DNA construct
ORGANISM synthetic DNA construct
REFERENCE 1 (bases 1 to 4715)
TITLE Direct Submission
JOURNAL Exported 2017-8-2 from MiaoLingPlasmid
http://www.miaolingbio.com
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..4715
/organism="synthetic DNA construct"
/mol_type="other DNA"
enhancer 61..364
/note="CMV enhancer"
/note="human cytomegalovirus immediate early enhancer"
promoter 365..568
/note="CMV promoter"
/note="human cytomegalovirus (CMV) immediate early
promoter"
misc_feature 597..683
/note="Mito"
CDS 705..1382
/codon_start=1
/product="improved tetrameric variant of DsRed fluorescent
protein"
/note="DsRed2"
/note="mammalian codon-optimized"
/translation="MASSENVITEFMRFKVRMEGTVNGHEFEIEGEGEGRPYEGHNTVK
LKVTKGGPLPFAWDILSPQFQYGSKVYVKHPADIPDYKKLSFPEGFKWERVMNFEDGGV
ATVTQDSSLQDGCFIYKVKFIGVNFPSDGPVMQKKTMGWEASTERLYPRDGVLKGETHK
ALKLKDGGHYLVEFKSIYMAKKPVQLPGYYYVDAKLDITSHNEDYTIVEQYERTEGRHH
LFL"
polyA_signal 1503..1624
/note="SV40 poly(A) signal"
/note="SV40 polyadenylation signal"
rep_origin complement(1631..2086)
/direction=LEFT
/note="f1 ori"
/note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow
indicates direction of (+) strand synthesis"
promoter 2113..2217
/gene="bla"
/note="AmpR promoter"
promoter 2219..2576
/note="SV40 promoter"
/note="SV40 enhancer and early promoter"
rep_origin 2427..2562
/note="SV40 ori"
/note="SV40 origin of replication"
CDS 2611..3405
/codon_start=1
/gene="aph(3')-II (or nptII)"
/product="aminoglycoside phosphotransferase from Tn5"
/note="NeoR/KanR"
/note="confers resistance to neomycin, kanamycin, and G418
(Geneticin(R))"
/translation="MIEQDGLHAGSPAAWVERLFGYDWAQQTIGCSDAAVFRLSAQGRP
VLFVKTDLSGALNELQDEAARLSWLATTGVPCAAVLDVVTEAGRDWLLLGEVPGQDLLS
SHLAPAEKVSIMADAMRRLHTLDPAT-CPFDHQAKHRIERARTRMEAGLVDQDDLDEEHQ
GLAPAELFARLKASMPDGEDLVVTHGDACLPNIMVENGRFSGFIDCGRLGVADRYQDIA
LATRDIAEELGGEWADRFLVLYGIAAPDSQRIAFYRLLDEFF"
polyA_signal 3637..3684
/note="HSV TK poly(A) signal"
/note="herpes simplex virus thymidine kinase
polyadenylation signal (Cole and Stacy, 1985)"
rep_origin 4013..4601
/direction=RIGHT
/note="ori"
/note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of
replication"
ORIGIN
1 tagttattaa tagtaatcaa ttacggggtc attagttcat agcccatata tggagttccg
61 cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt
121 gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca
181 atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc
241 aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta
301 catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca tcgctattac
361 catggtgatg cggttttggc agtacatcaa tgggcgtgga tagcggtttg actcacgggg
421 atttccaagt ctccacccca ttgacgtcaa tgggagtttg ttttggcacc aaaatcaacg
481 ggactttcca aaatgtcgta acaactccgc cccattgacg caaatgggcg gtaggcgtgt
541 acggtgggag gtctatataa gcagagctgg tttagtgaac cgtcagatcc gctagcatgt
601 ccgtcctgac gccgctgctg ctgcggggct tgacaggctc ggcccggcgg ctcccagtgc
661 cgcgcgccaa gatccattcg ttgggggatc caccggtcgc caccatggcc tcctccgaga
721 acgtcatcac cgagttcatg cgcttcaagg tgcgcatgga gggcaccgtg aacggccacg
781 agttcgagat cgagggcgag ggcgagggcc gcccctacga gggccacaac accgtgaagc
841 tgaaggtgac caagggcggc cccctgccct tcgcctggga catcctgtcc ccccagttcc
901 agtacggctc caaggtgtac gtgaagcacc ccgccgacat ccccgactac aagaagctgt
961 ccttccccga gggcttcaag tgggagcgcg tgatgaactt cgaggacggc ggcgtggcga
1021 ccgtgaccca ggactcctcc ctgcaggacg gctgcttcat ctacaaggtg aagttcatcg
1081 gcgtgaactt cccctccgac ggccccgtga tgcagaagaa gaccatgggc tgggaggcct
1141 ccaccgagcg cctgtacccc cgcgacggcg tgctgaaggg cgagacccac aaggccctga
1201 agctgaagga cggcggccac tacctggtgg agttcaagtc catctacatg gccaagaagc
1261 ccgtgcagct gcccggctac tactacgtgg acgccaagct ggacatcacc tcccacaacg
1321 aggactacac catcgtggag cagtacgagc gcaccgaggg ccgccaccac ctgttcctgt
1381 agcggccgcg actctagatc ataatcagcc ataccacatt tgtagaggtt ttacttgctt
1441 taaaaaacct cccacacctc cccctgaacc tgaaacataa aatgaatgca attgttgttg
1501 ttaacttgtt tattgcagct tataatggtt acaaataaag caatagcatc acaaatttca
1561 caaataaagc atttttttca ctgcattcta gttgtggttt gtccaaactc atcaatgtat
1621 cttaaggcgt aaattgtaag cgttaatatt ttgttaaaat tcgcgttaaa tttttgttaa
1681 atcagctcat tttttaacca ataggccgaa atcggcaaaa tcccttataa atcaaaagaa
1741 tagaccgaga tagggttgag tgttgttcca gtttggaaca agagtccact attaaagaac
1801 gtggactcca acgtcaaagg gcgaaaaacc gtctatcagg gcgatggccc actacgtgaa
1861 ccatcaccct aatcaagttt tttggggtcg aggtgccgta aagcactaaa tcggaaccct
1921 aaagggagcc cccgatttag agcttgacgg ggaaagccgg cgaacgtggc gagaaaggaa
1981 gggaagaaag cgaaaggagc gggcgctagg gcgctggcaa gtgtagcggt cacgctgcgc
2041 gtaaccacca cacccgccgc gcttaatgcg ccgctacagg gcgcgtcagg tggcactttt
2101 cggggaaatg tgcgcggaac ccctatttgt ttatttttct aaatacattc aaatatgtat
2161 ccgctcatga gacaataacc ctgataaatg cttcaataat attgaaaaag gaagagtcct
2221 gaggcggaaa gaaccagctg tggaatgtgt gtcagttagg gtgtggaaag tccccaggct
2281 ccccagcagg cagaagtatg caaagcatgc atctcaatta gtcagcaacc aggtgtggaa
2341 agtccccagg ctccccagca ggcagaagta tgcaaagcat gcatctcaat tagtcagcaa
2401 ccatagtccc gcccctaact ccgcccatcc cgcccctaac tccgcccagt tccgcccatt
2461 ctccgcccca tggctgacta atttttttta tttatgcaga ggccgaggcc gcctcggcct
2521 ctgagctatt ccagaagtag tgaggaggct tttttggagg cctaggcttt tgcaaagatc
2581 gatcaagaga caggatgagg atcgtttcgc atgattgaac aagatggatt gcacgcaggt
2641 tctccggccg cttgggtgga gaggctattc ggctatgact gggcacaaca gacaatcggc
2701 tgctctgatg ccgccgtgtt ccggctgtca gcgcaggggc gcccggttct ttttgtcaag
2761 accgacctgt ccggtgccct gaatgaactg caagacgagg cagcgcggct atcgtggctg
2821 gccacgacgg gcgttccttg cgcagctgtg ctcgacgttg tcactgaagc gggaagggac
2881 tggctgctat tgggcgaagt gccggggcag gatctcctgt catctcacct tgctcctgcc
2941 gagaaagtat ccatcatggc tgatgcaatg cggcggctgc atacgcttga tccggctacc
3001 tgcccattcg accaccaagc gaaacatcgc atcgagcgag cacgtactcg gatggaagcc
3061 ggtcttgtcg atcaggatga tctggacgaa gagcatcagg ggctcgcgcc agccgaactg
3121 ttcgccaggc tcaaggcgag catgcccgac ggcgaggatc tcgtcgtgac ccatggcgat
3181 gcctgcttgc cgaatatcat ggtggaaaat ggccgctttt ctggattcat cgactgtggc
3241 cggctgggtg tggcggaccg ctatcaggac atagcgttgg ctacccgtga tattgctgaa
3301 gagcttggcg gcgaatgggc tgaccgcttc ctcgtgcttt acggtatcgc cgctcccgat
3361 tcgcagcgca tcgccttcta tcgccttctt gacgagttct tctgagcggg actctggggt
3421 tcgaaatgac cgaccaagcg acgcccaacc tgccatcacg agatttcgat tccaccgccg
3481 ccttctatga aaggttgggc ttcggaatcg ttttccggga cgccggctgg atgatcctcc
3541 agcgcgggga tctcatgctg gagttcttcg cccaccctag ggggaggcta actgaaacac
3601 ggaaggagac aataccggaa ggaacccgcg ctatgacggc aataaaaaga cagaataaaa
3661 cgcacggtgt tgggtcgttt gttcataaac gcggggttcg gtcccagggc tggcactctg
3721 tcgatacccc accgagaccc cattggggcc aatacgcccg cgtttcttcc ttttccccac
3781 cccacccccc aagttcgggt gaaggcccag ggctcgcagc caacgtcggg gcggcaggcc
3841 ctgccatagc ctcaggttac tcatatatac tttagattga tttaaaactt catttttaat
3901 ttaaaaggat ctaggtgaag atcctttttg ataatctcat gaccaaaatc ccttaacgtg
3961 agttttcgtt ccactgagcg tcagaccccg tagaaaagat caaaggatct tcttgagatc
4021 ctttttttct gcgcgtaatc tgctgcttgc aaacaaaaaa accaccgcta ccagcggtgg
4081 tttgtttgcc ggatcaagag ctaccaactc tttttccgaa ggtaactggc ttcagcagag
4141 cgcagatacc aaatactgtt cttctagtgt agccgtagtt aggccaccac ttcaagaact
4201 ctgtagcacc gcctacatac ctcgctctgc taatcctgtt accagtggct gctgccagtg
4261 gcgataagtc gtgtcttacc gggttggact caagacgata gttaccggat aaggcgcagc
4321 ggtcgggctg aacggggggt tcgtgcacac agcccagctt ggagcgaacg acctacaccg
4381 aactgagata cctacagcgt gagctatgag aaagcgccac gcttcccgaa gggagaaagg
4441 cggacaggta tccggtaagc ggcagggtcg gaacaggaga gcgcacgagg gagcttccag
4501 ggggaaacgc ctggtatctt tatagtcctg tcgggtttcg ccacctctga cttgagcgtc
4561 gatttttgtg atgctcgtca ggggggcgga gcctatggaa aaacgccagc aacgcggcct
4621 ttttacggtt cctggccttt tgctggcctt ttgctcacat gttctttcct gcgttatccc
4681 ctgattctgt ggataaccgt attaccgcca tgcat
//
质粒菌株产品操作说明书
一、扩增流程
收到产品后,请先根据产品管壁标签来判断产品形式,并在扩增前准确查找该质粒菌株的抗性、感受态和培养温度。
1、质粒干粉(常温运输,存于-20度,90天保质期,请务必转化挑单克隆培养,不要直接使用和测序)
①收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min,再加入20μl ddH2O去离子水溶解质粒;
②取1支100μl 感受态于冰上解冻10min,加入2μl质粒,再冰浴30min后,42℃热激60s,不要搅动,再冰浴2min;(从第二步开始均要在超净工作台中无菌操作)
③加入900μl无抗的LB液体培养基,180rpm震荡37℃培养45min;
④6000rpm离心5min,仅留100μl上清液重悬细菌沉淀,并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;(可使用本平台的平板涂布专用玻璃珠进行涂布,可以比传统涂布方法获得更多转化子)
⑤将平板正向培养1h,再倒置37℃培养14h。如果要求是30度则培养20h;
(菌落过多则将质粒稀释后再转化。没有菌落则加入10μl质粒转化。另不要直接转表达感受态,要先转克隆感受态,重提质粒后再导入表达感受态)
⑥挑取单菌落至LB液体培养基中,加入对应抗生素,220rpm震荡培养14h,根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。
2、甘油菌种(冰袋运输,存于-80℃,保质期90天,请务必划线挑单克隆培养)
四区划线后挑单菌落培养,酵母菌需要先液体复苏再四区划线,再挑单菌落液体培养。
3、穿刺菌种(冰袋运输,存于4℃,保质期7天)
穿刺接种,液体培养后四区划线,再挑单菌落液体培养。
4、菌落平板(冰袋运输,存于4℃,保质期7天)
直接挑取单菌落至液体培养基中。
5、液体质粒(冰袋运输,存于-20℃,保质期90天)
单独提取的液体质粒收到后可直接使用。
6、滤纸质粒(常温运输,存于-20度,90天保质期,请务必转化挑单克隆培养,不要直接使用和测序)
收到货后将滤纸画圈部分剪下放入EP管中,加100ul无菌水将滤纸浸湿并浸泡5min,吸取5ul质粒转化,离心全涂。
二、转化图片
| P2771/pENTR223-MRPL37人源基因质粒 |
| P2772/pENTR223-SPATA6L(有突变)人源基因质粒 |
| P2773/pENTR223-DDI1(有突变)人源基因质粒 |
| P2774/pENTR223-GNAT2(1同义突变)人源基因质粒 |
| P2775/pENTR223-ZNF24(2点突变)人源基因质粒 |
| P2776/pENTR223-B3GNT2人源基因质粒 |
| P2777/pENTR223-SPATA17(1同义突变)人源基因质粒 |
| P2778/pENTR223-ACTRT2(缺失和2同义突变)人源基因质粒 |
| P2779/pENTR223-ATP6V1C1-G3T人源基因质粒 |
| P2780/pENTR223-RCL1人源基因质粒 |
| P2781/pENTR223-THUMPD1人源基因质粒 |
| P2782/pENTR223-AFF4(1-1087bp)人源基因质粒 |
风险提示:丁香通仅作为第三方平台,为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全,合理判断,谨慎选购商品,商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品,请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
文献和实验所有酸性液泡。pDsRed2-mito:载体,转染后表达一个融合蛋白(红色荧光蛋白+线粒体基质定位信号),可用来检测线粒体被自噬掉的程度(Mitophagy)。MitoTraker 探针:特异性显示活的线粒体,荧光在经过固定后还能保留。Hsp60:定位与线粒体基质,细胞死亡时不会被释放。Calreticulin(钙网织蛋白):内质网腔。 Note:这些蛋白均为胞浆蛋白,爬片或胰酶消化的细胞在做免疫荧光前需先透膜(permeablize),可采用 0.1% SDS 处理。 参考文献:
就如上新手进阶要点总结之后,笔者总结了一下免疫荧光需要特别关注的细节,以期作出更完美的图片效果。1、了解及预测蛋白的定位例如:下图使用肺动脉内皮细胞( BPAE)观察线粒体的显色,采用 405nm,488nm,561nm 的激光,100x NA 1.49 的物镜对细胞内线粒体的分布进行简单的观察,此图可见,单纯的 mito-tracker 并不能清晰看见线粒体内部的结构和蛋白相关关系,因此,明确蛋白定位,根据所需分辨率选择显微镜、相应的荧光蛋白和探针非常重要。比如研究者应大致预测观察目标是存在
重大突破!甘波谊团队 Nature 首次报道第三种铁死亡抑制机制,提供抗癌新思路
4 可使 DHODH 抑制剂诱导脂质过氧化和铁死亡的发生。 图片来源:Nature机制探究:DHODH 是如何抑制铁死亡的?DHODH 是一种位于线粒体内膜外表面的酶。在 DHODH 敲除的 HT-1080 细胞中回转(restoration)野生型 DHODH,可降低 GPX4 抑制引起的铁死亡,然而回转 DHODH 催化活性突变体或线粒体定位缺陷突变体则没有这一作用。此外,在敲除 HT-1080 细胞的 GPX4 后,回转线粒体定位的 GPX4(GPX4mito)可降低 DHODH 抑制引起的铁











