关键词: 冷冻电镜 图像处理 技术培训
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近日,一个国际冷冻电镜图像处理技术培训班在中科院 生物物理所成功举办,来自各国的学员参加并听取介绍了演示。
培训班的重点在于让学员深入学习和了解冷冻电镜图像处理技术,并培训学员学习使用低温电镜单颗粒分析软件(EMAN2、Xmipp、RELION),从电镜照片中提取样品结构信息,重构样品三维结构。EMAN2的开发者——美国Baylor医学院的Steven Ludtke教授,以及中科院上海生化与细胞生物学研究所的丛尧研究员进行了EMAN2的培训和讲座。Xmipp的培训是由其开发团队——西班牙国家生物技术中心的Jose Maria Carazo教授以及他的团队成员Roberto MarABI ni博士和Carlos-Oscar Sanchez Sorzano博士来完成的。英国MRC实验室的Sjors Scheres教授和白晓辰博士不仅就其开发的软件包RELION进行讲解还给参会者详细讲解了最大概然统计分析理论和贝叶斯理论在电镜图像分析和三维重构中的重要应用,为我国三维电镜领域带来了最前沿的理论。
来自全国各地以及多个国家和地区(美国、英国、韩国、日本、台湾、新加坡)的学员参加了此次培训活动。培训班包括了讲座(上午)、上机实习(下午)和讨论会(晚上)三个部分,给学员充足的时间和空间与各位主讲者进行交流。7月10日晚的第一堂课由Steven Ludtke教授概述了低温电镜技术的要点和最新进展。随后的三天由各位主讲们分别就低温电镜图像处理中的基础知识、关键问题和前沿发展 进行了详细的讲解,并对各自开发的软件EMAN2、Xmipp、RELION的特点和使用流程进行了介绍和演示。
近年来冷冻电镜三维重构技术进入快速发展期,国内外的生物医学研究领域对其需求很大,然与其配套的图像处理技术还未被足够数量的国内研究者所掌握,因此制约了这一技术在我国的应用。此次培训班系统全面地将最新的冷冻电镜图像处理技术和软件带给了国内的相关研究人员,特别是从事大分子复合体结构功能研究方面的研究人员,这将极大促进我国低温电镜和结构生物学领域的发展。
此次培训班依托中国生物物理学会和中国电子显微学会,由中国生物物理学会、中国科学院生物物理研究所和中国科学院蛋白质科学研究平台生物成像中心承办,得到了国家自然科学基金委员会、FEI公司、北京华泰长润科技发展有限公司、曙光公司和浪潮公司的赞助和支持。培训班的学员差旅奖由国际纯粹与应用生物物理学会(IUPAB)提供。此次培训班组织委员会主席是清华大学隋森芳院士,执行主席是生物物理所孙飞研究员以及北京大学尹长城教授。培训班组织委员会成员由全国从事冷冻电镜及三维重构领域工作的各研究组组长组成。
与本次培训班相关的活动还有——7月8日在生物物理所举办的北京地区Xmipp软件使用培训班,7月16日在清华大学举行的冷冻电镜学术研讨会,以及7月17日在生物物理所举办的北京地区EMAN2补充培训班。
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