hsa-miR-625 和hsa-miR-625*
这2个第一个你应该清楚吧,hsa-miR-625*表示和前面那个互补的miRNA,于是就用了一个*号标记。
hsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3p
其实和上面也没有太大的差别,hsa-mir-532-5p就是在茎环结构的5‘端,而hsa-miR-532-3p是在茎环结构的3‘端,并且他们是互补的。且是同一基因转录出来的。
hsa-mir-34a 和 hsa-mir-34b These names have been remapped to miR-34c (MI0000403 ), miR-34b (MI0000404 ) and miR-34a (MI0000584 ) to clarify homology with human sequences.
hsa-let-7a-2 和 hsa-let-7a-1 (分布不同??)
其实这2个就是他们的前体不一样,而最后成熟体一致的,都是hsa-let-7a。
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对于你的这个问题,其实我也是一直存在这种想法的,就是没有去探究而已,经你这样一说,我又看了一下mirbase数据库,感觉他们的确没有什么差异的,记得第一次看见hsa-miR-625*这样标记的是在plosone杂志上,上面说了是hsa-miR-625的互补序列。但是在用到像hsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3p标记时,是实验室的一个同学构建miRNA表达质粒上遇到的,所以也就略知一二。但是他们之间到底有什么差异,我看了一些,没有找到,因为好像有的是用的hsa-miR-625 和hsa-miR-625*,而另外一些是用的hsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3p,而在一些文献上没有特别的说明,比如现在mirbase数据库上的hsa-miR-17用的是hsa-miR-17和hsa-miR-17*,但是在一篇最新(09.5.4)的gene development上一篇文章(The miR-200 family determines the epithelial phenotype of cancer cells by targeting the E-cadherin repressors ZEB1 and ZEB2)中用到的是hsa-miR-17-3p,呵呵,这个到底有没有差异我想应该是没有的。应该最后会统一的吧,或者说他们真正的有差别,但是我不知道,呵呵。希望有知道一起分享一下。但是现在比较流行用hsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3p,可能这也是最后的版本吧。