原位肿瘤模型建立与AHR配体处理
验证CSE和TCDD对PDAC肿瘤进展的影响
将7940b或MT3细胞注入同系小鼠胰腺,腹腔注射CSE或TCDD,测量肿瘤重量和体积,检测AHR激活标志物Cyp1a1。
Aryl Hydrocarbon Receptor Ligands Drive Pancreatic Cancer Initiation and Progression through Protumorigenic T-cell Polarization
涉及体外T细胞极化、同系原位肿瘤模型、自发肿瘤模型、免疫缺陷小鼠、细胞与分子验证、单细胞测序及人类样本分析,包含功能与机制验证。
小鼠原位胰腺癌模型(7940b细胞系) 小鼠原位胰腺癌模型(MT3细胞系) KC自发胰腺癌模型(KrasLSL-G12D/+;p48Cre/+) 人胰腺组织样本(器官捐献者及PDAC患者)
TCDD剂量:10 μg/kg,每周腹腔注射 CSE剂量:2 mg,每周三次腹腔注射 AHR抑制剂CH-223191剂量:200 μg,每周三次腹腔注射 Treg耗竭:FoxP3-DTR小鼠,DT 50 ng/g腹腔注射 CD4-Cre AHR敲除小鼠:他莫昔芬处理(4 mg/天,5天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CSE和TCDD对PDAC肿瘤进展的影响
将7940b或MT3细胞注入同系小鼠胰腺,腹腔注射CSE或TCDD,测量肿瘤重量和体积,检测AHR激活标志物Cyp1a1。
确定AHR配体效应是否依赖免疫系统
在NSG小鼠中重复原位模型,TCDD处理,测量肿瘤重量和体积,检测Cyp1a1表达。
检测CSE和TCDD对CD4+ T细胞IL22产生的影响
纯化小鼠或人naïve CD4+ T细胞,在Th0、Th1、Th22条件下培养,添加CSE、TCDD或AHR抑制剂,检测Il22 mRNA和蛋白表达。
验证TCDD诱导的IL22对肿瘤细胞STAT3信号的影响
用极化T细胞的条件培养基处理7940b细胞,通过Western blot检测pSTAT3水平,并使用IL22结合蛋白中和IL22。
确定胰腺内IL22的主要细胞来源
使用IL22报告小鼠,经TCDD处理后,通过mfIHC和流式细胞术检测十二指肠和胰腺中IL22+细胞。
确定IL22在AHR介导肿瘤生长中的作用
在IL22−/−小鼠中建立原位肿瘤模型,TCDD处理,比较肿瘤大小。
验证Treg在AHR介导肿瘤生长中的作用
通过mfIHC和流式细胞术分析肿瘤中Treg浸润;在FoxP3-DTR小鼠中耗竭Treg,观察肿瘤生长变化。
验证CD4+ T细胞AHR信号在肿瘤进展中的作用
生成CD4-Cre AHR−/−小鼠,在TCDD处理下进行原位肿瘤模型,比较肿瘤大小和免疫浸润。
验证AHR抑制对TCDD诱导肿瘤生长的阻断效果
在原位模型中,WT小鼠接受AHR抑制剂CH-223191处理,测量肿瘤大小。
分析AHR激活对肿瘤免疫微环境的影响
从TCDD或vehicle处理的肿瘤中制备单细胞悬液,进行scRNA-seq,分析T细胞亚群和基因表达。
评估AHR激活对肿瘤起始的影响
对KC小鼠(19周龄)每周给予TCDD处理3周,分析胰腺组织学,评估腺泡-导管化生和PanIN病变。
验证吸烟者胰腺和肿瘤中AHR激活和免疫浸润差异
对器官捐献者胰腺组织进行qPCR检测AHR靶基因表达;对PDAC患者肿瘤组织进行mfIHC分析Treg浸润。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 10569-010 |
| 胎牛血清 | Corning | 35-011-CV | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 动物实验 | 香烟烟雾提取物 | Murty Pharmaceuticals | -- |
| CH-223191 | Millipore Sigma | C8124 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma | D2650 | |
| 白喉毒素 | Enzo Life Science | BML-G135-0001 | |
| 他莫昔芬 | Millipore Sigma | T5648 | |
| 他莫昔芬饲料 | Teklad | TD.130850 | |
| 组织处理 | 中性缓冲福尔马林 | Epredia | 5725 |
| 免疫组织化学 | AR6缓冲液 | Akoya | AR600250ML |
| 过氧化氢 | Thermo Fisher Scientific | H325-100 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | A9647 | |
| 磷酸盐缓冲液 | Gibco | 10010-023 | |
| 抗AHR抗体 | Invitrogen | MA1-514 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Vector | MP-7452 | |
| ABC溶液 | Vector | PK-6100 | |
| DAB底物 | Vector | SK-4100 | |
| 封片剂 | Epredia | 23-244256 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| RT-qPCR | 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 |
| SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | 4385612 | |
| 体外T细胞极化 | naïve CD4+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-453 |
| 人naïve CD4+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-094-131 | |
| Iscove改良Dulbecco培养基 | Gibco | 12440-053 | |
| β-巯基乙醇 | Bio-Rad | 1610710 | |
| 抗CD3抗体 | BioLegend | 317326 | |
| 抗CD28抗体 | BioLegend | 302934 | |
| 白细胞介素2 | BioLegend | 575402 | |
| 白细胞介素12 | BioLegend | 577004 | |
| 白细胞介素6 | BioLegend | 570802 | |
| 白细胞介素1β | BioLegend | 579402 | |
| 白细胞介素23 | BioLegend | 574102 | |
| 加尼舍替布 | Tocris | 6956 | |
| ELISA | 小鼠IL22 DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY582 |
| Western blot | IL22结合蛋白 | R&D Biosystems | 1087-BP |
| 白细胞介素22 | R&D Systems | 582-ML-010 | |
| 细胞裂解缓冲液 | Invitrogen | FNN0011 | |
| Halt蛋白酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | 78425 | |
| Pierce BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| Tris缓冲盐溶液 | Bio-Rad | 1706435 | |
| 吐温-20 | Thermo Fisher Scientific | BP-337 | |
| 抗pSTAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔二抗 | Vector Laboratory | PI-1000 | |
| West PICO Plus化学发光试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 34577 | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 多重荧光免疫组化 | Opal平台和6重手动检测试剂盒 | Akoya | NEL861001KT |
| pH 9抗原修复缓冲液 | Akoya Biosciences | -- | |
| pH 6抗原修复缓冲液 | Akoya Biosciences | -- | |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | -- | -- | |
| Vectra Polaris显微镜 | -- | -- | |
| InForm软件 | Akoya Biosciences | -- | |
| 流式细胞术 | 胶原酶 | Millipore Sigma | C9263 |
| Hank's平衡盐溶液 | Gibco | 14025-092 | |
| Percoll | GE Healthcare | -- | |
| PMA和离子霉素 | eBioscience | -- | |
| 布雷菲德菌素A | -- | -- | |
| Bio-Rad ZE5细胞分析仪 | Bio-Rad | -- | |
| BD LSRFortessa细胞分析仪 | BD Biosciences | -- | |
| FlowJo软件 | BD Biosciences | -- | |
| 单细胞RNA测序 | NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| CD4+ TIL分离 | CD4 (TIL) 磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-116-475 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 原位肿瘤模型 | 细胞系(7940b或MT3)、细胞数(3×10^4)、注射体积(25 μL DMEM+25 μL Matrigel)、小鼠品系(C57BL6/J或NSG)、处理(CSE 2 mg i.p. 每周三次或TCDD 10 μg/kg i.p. 每周一次)、处理时间(19天) 阅读提示:Methods: Animal Experiments; Figure 1A, 1F, 1M |
| 体外T细胞极化 | 细胞来源(小鼠脾脏或人供体脾脏)、分离试剂盒、刺激(anti-CD3 2 μg/mL, anti-CD28 0.5 μg/mL)、细胞密度(2×10^6/mL)、培养时间(5天)、细胞因子浓度(IL2 5 ng/mL, IL12 10 ng/mL, IL6 30 ng/mL, IL1β 10 ng/mL, IL23 20 ng/mL, galunisertib 10 μmol/L)、TCDD浓度(1 nmol/L)、CH-223191浓度(10 μmol/L) 阅读提示:Methods: In vitro Naïve CD4+ T-cell Polarization; Figure 2A, 2B, 2D, 2E |
| AHR抑制剂处理 | 给药剂量(200 μg i.p. 每周三次)、给药频率、处理时间(19天) 阅读提示:Methods: Animal Experiments; Figure 4I, 4J |
| Treg耗竭实验 | 小鼠品系(FoxP3-DTR)、DT剂量(50 ng/g)、给药方式(i.p.)、耗竭起始时间(肿瘤植入后1周)、处理时间(16天) 阅读提示:Methods: Animal Experiments; Figure 3J |
| CD4-Cre AHR敲除实验 | 基因型(AHRfl/fl;CD4Cre-ERT/+)、他莫昔芬给药方案(4 mg/天,5天,在肿瘤植入前1周)、维持饲料(400 mg/kg他莫昔芬饲料)、TCDD处理(10 μg/kg i.p. 每周一次)、处理时间(19天) 阅读提示:Methods: Animal Experiments; Figure 4B, 4D, 4E |
| 自发PDAC模型 | 小鼠品系(KC)、年龄(19周开始处理)、TCDD剂量(10 μg/kg i.p. 每周一次)、处理时间(3周)、分析时间(22周) 阅读提示:Methods: Animal Experiments; Figure 6A, 6B |
| 流式细胞术 | 组织消化酶(胶原酶 1 mg/mL)、消化时间(健康胰腺15分钟,肿瘤30分钟)、Percoll梯度离心(40%/80%)、表面染色时间(30分钟)、胞内染色时间(1小时)、再刺激(PMA/离子霉素,存在布雷菲德菌素A) 阅读提示:Methods: Flow Cytometry; Supplementary Figure S3A, S3D |
| scRNA-seq | 样本量(每组2个肿瘤)、测序平台(NovaSeq 6000)、测序深度(100,000 reads)、分析参数(Cell Ranger count 6.0,初始期望细胞数10,000) 阅读提示:Methods: scRNA-seq Dataset and Analysis; Figure 5A |