急性白血病的快速表观基因组分类

急性白血病需要精确的分子分型和紧急治疗。然而，标准护理诊断测试耗时较长，且未涵盖急性白血病异质性的全部范围。在此，我们开发了一个使用全基因组DNA甲基化谱对急性白血病进行分类的框架。我们首先组装了一个全面的参考队列（n = 2,540个样本），并定义了38个甲基化类别。基于甲基化的分类在大多数情况下与标准病理谱系分类一致，并揭示了遗传类别之外额外的异质性。利用该参考，我们开发了一个神经网络（MARLIN；甲基化和人工智能引导的快速白血病亚型推断），用于从稀疏的DNA甲基化谱中分类急性白血病。在通过纳米孔测序分析的回顾性队列中，高置信度预测在26例中有25例与常规诊断一致。对疑似急性白血病患者的实时MARLIN分类在5例中提供了准确预测，通常在样本接收后2小时内生成。总之，我们提出了一个快速急性白血病分类的框架，补充并增强了标准护理诊断。