急性白血病的快速表观基因组分类

急性白血病需要精确的分子分型和紧急治疗。然而，标准诊断检测耗时较长，且无法全面捕捉急性白血病的异质性。本研究开发了一种利用全基因组DNA甲基化谱对急性白血病进行分类的框架。我们首先构建了一个综合性参考队列（n = 2,540样本），并定义了38种甲基化亚型。在多数病例中，基于甲基化的分类与标准病理学分型结果一致，同时揭示了遗传学分类未能涵盖的异质性特征。基于此参考体系，我们开发了神经网络模型MARLIN（甲基化与人工智能引导的白血病亚型快速推断系统），可通过稀疏DNA甲基化谱实现急性白血病分类。在纳米孔测序回顾性队列中，26例病例中有25例的高置信度预测结果与传统诊断相符。对疑似急性白血病患者进行的实时MARLIN分类中，5例病例均实现准确预测，通常在样本接收后2小时内即可生成结果。综上所述，我们提出了一个快速急性白血病分类框架，该体系能够补充并增强现有标准诊断方法。