【新研究】中国2022-2025年猪流行性腹泻病毒（PEDV）分子特征与抗原表位全景分析

· 覆盖全国20个省份，共检测2346份样本，PEDV阳性率达43.3%

· 基因分型显示G2c已成为当前主流亚型

· S蛋白关键中和表位（COE、SS2、SS6、2C10）出现多处突变

· 首次在新疆株中发现新的潜在N-糖基化位点（302位）

· 预测出7个线性与2个构象性抗原表位，为疫苗研发提供新靶点

该研究指出与经典疫苗株CV777相比，当前流行株在S蛋白的核苷酸和氨基酸相似性仅为92.71%-94.99%，提示现有疫苗的保护效果可能正在减弱。病毒在关键抗原区域持续变异，可能导致免疫逃逸现象加剧。

PEDV是危害全球养猪业的重要冠状病毒，能引起各年龄段猪只腹泻、呕吐和脱水，哺乳仔猪致死率极高。自2010年高致病性变异株出现以来，中国疫情防控持续面临挑战。

吉林大学莫晓兵教授与李天增研究员团队联合新疆研究团队完成的新研究，样本量大、覆盖广、机制分析深入，是2025年PEDV领域的重要成果，具有较高学术可信度。

1. 流行态势：

2022-2025年中国PEDV总体阳性率为43.3%，辽宁、安徽、广西等6省份阳性率超60%，新疆、华南及东北地区为高发区域。

图1. 死于腹泻的猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染及其地理分布

(A)条形图表示各省PEDV阳性率，折线图显示95%置信区间的上下限。(B) PEDV的地理分布。颜色由绿到红表示阳性率递增。

2. 基因型特征：

15株测序菌株中，1株为G1c亚型、4株为G2b亚型、10株为G2c亚型，证实G2c已成为主导亚型。

图2. PEDV S基因的系统发育树

红色五角星表示本研究获得的序列。不同颜色代表不同的基因型。

3. 序列变异：

测序菌株与经典疫苗株CV777的S基因核苷酸和氨基酸同源性分别仅为 92.71%-94.83%和92.89%-94.99%，关键中和表位（COE、SS2、SS6、2C10）均出现不同程度突变。

图3.  PEDV S 蛋白关键抗原表位的比较

绿色、橙色、蓝色和黄色区域分别对应于抗原表位COE、SS2、SS6和2C10。

4. 抗原表位与糖基化特征：

预测出31-54aa等7个保守抗原区域，发现PEDV/XinJiang/2株存在302位（NKTI）新N-糖基化位点，部分菌株出现糖基化位点缺失可能与免疫逃逸相关。

图4. 15株PEDV毒株与疫苗株S蛋白中潜在特异性N-糖基化位点的预测结果

纵轴代表毒株名称，横轴代表氨基酸位点。蓝色区域表示相同氨基酸位点上的相同N-糖基化，红色区域表示差异。

图5. S蛋白天然三聚体状态下连续表位保守区域的可视化

(A)预测表位区域中测序毒株和疫苗毒株的氨基酸序列比对。(B–E)保守抗原表位的可视化。蓝色、绿色和白色区域分别代表S蛋白三聚体的A、B和C链。黄色球体表示得分大于0.7的潜在抗原表位区域。(F) S蛋白单体关键氨基酸位点的放大图，其中红色区域表示S蛋白单体的关键氨基酸位点。

图6. S蛋白天然三聚体状态下连续表位保守区域的可视化

(A)预测表位区域中测序毒株和疫苗毒株的氨基酸序列比对。(B–E)保守抗原表位的可视化。蓝色、绿色和白色区域分别代表S蛋白三聚体的A、B和C链。黄色球体表示得分大于0.7的潜在抗原表位区域。(F) S蛋白单体关键氨基酸位点的放大图，其中红色区域表示S蛋白单体的关键氨基酸位点。

该研究不仅更新了2022-2025年中国PEDV的分子流行病学图谱，还揭示了关键抗原表位的变异趋势与免疫逃逸机制。