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一项发表于《自然-生物技术》的研究通过系统性的“逆向工程”，为明星基因编辑工具ABE成功“瘦身”，在提升效率的同时，实现了精准与安全性的兼得。

无需核酸模板，细菌防御系统竟靠蛋白质“雕刻”特定序列DNA。

基因编辑领域迎来新突破：科学家从宏基因组中挖掘出一款超紧凑型Cas12f编辑器，不仅解决了大尺寸Cas9难以装入AAV载体的难题，更通过结构解析与工程化改造，实现了在哺乳动物细胞中的高效、广谱编辑。

本研究系统评估50种RNA引导核酸酶的效率、脱靶效应及细胞毒性。AsCas12a-Ultra等效率优于SpCas9，enOsCas12f1适合体内递送；AsCpf1-YH脱靶最低，Cas12j-SF05易位风险最小；enRhCas12f1毒性最低。构建了多维评估框架指导精准编辑工具选择。

重磅突破，耶鲁大学可爱龙教授团队发文深化了对于cas9进化过程的理解，为开发稳健、高效的小型化单链基因编辑工具提供了关键的结构依据和理论指导。

中国科学家团队在《自然》杂志上宣布，利用新型“变形金刚”碱基编辑器（tBE）成功治愈了5名输血依赖型β-地贫患者，所有患者均在治疗后快速摆脱输血，且长期有效。

该研究开发INSTALL技术，利用免疫逃逸的环状单链DNA（cssDNA）作为供体，结合重组酶实现千碱基级人类基因组精准写入。该技术显著降低先天免疫反应与细胞毒性，在免疫细胞及小鼠体内均实现高效、安全的非病毒基因整合，为基因治疗提供了新策略。

研究发现，在TnpB蛋白及其指导RNA上均存在能显著增强其DNA切割活性的“激活突变”。通过组合这些突变，研究团队成功开发出两种工程化增强变体（eTnpB）。这些变体在人类细胞、本氏烟草、辣椒和水稻中实现了高效的基因组编辑，在本氏烟草中的编辑效率最高可达55%，比野生型TnpB提升约50倍。这项工作不仅揭示了调控TnpB活性的分子基础，也为植物等需要小型编辑器的应用提供了强大的新工具。

研究发现，Cas12a3在被靶RNA激活后，会特异性切割tRNA的3‘端CCA尾巴，从而抑制翻译并执行抗噬菌体免疫功能。该发现揭示了一种不依赖DNA损伤的新型细菌免疫策略。

研究者发现，来自Citrobacter rodentium的ISCro4重组酶在人类细胞中具有高活性。通过将指导RNA设计为独立的靶标结合环（TBL）和供体结合环（DBL），该系统可高效介导 kilobase级别的DNA删除、倒位，并能以超过6%的效率在基因组特定位点（如AAVS1安全港）插入长达3.5 kb的外源DNA片段。这项工作为无需DNA双链断裂和同源重组的大片段基因组编辑提供了新平台。

这项研究开发了一种名为 “RNA引导的桥接重组酶”​ 的新型基因组编辑平台。研究人员筛选出 ISCro4​ 重组酶，并通过 “拆分桥接RNA”​ 策略优化，使其在人类细胞中高效工作。该系统能够在不造成DNA双链断裂的情况下，实现超过3.5 kb的大片段DNA精准插入、删除和倒位，编辑效率可超过6%。这项技术解决了现有基因编辑工具难以进行高效、无疤痕大片段编辑的难题，为遗传病基因治疗和基因组工程提供了一个强大且通用的新工具

本研究提出了一种创新的基因治疗策略，将先导编辑与工程化抑制性tRNA相结合。其核心是利用高精度的先导编辑技术，将抑制性tRNA基因永久整合到基因组的“安全港”位点。这种方法旨在纠正一类由“无义突变”引起的多种遗传疾病，而非针对单一病症，因而具有疾病普适性。该策略有望实现一次治疗、终身受益，为治疗众多因提前出现终止密码子而导致的遗传病提供了通用型平台技术的新方向。

研究首次揭示，神经轴突退化的关键执行蛋白SARM1是一种新型的DNA免疫传感器。它通过其TIR结构域感知细胞质中异常存在的双链DNA（dsDNA），并以序列非依赖性的方式被激活。激活的SARM1迅速降解细胞内的关键代谢物NAD⁺，从而触发细胞死亡。该机制直接解释了化疗诱导的周围神经病变（CIN）​ 的成因——化疗药物损伤DNA产生的dsDNA激活了SARM1通路。研究进一步证实，敲除SARM1可完全阻断小鼠的CIN症状，这为开发针对此类副作用的新疗法提供了关键靶点

CRISPR-Cas系统已成为基因组编辑的强大工具。除了广泛使用的Cas9和Cas12a，Type V-I 系统的Cas12i亚家族因其蛋白尺寸较小而备受关注。然而，许多天然的Cas12i核酸酶在人类细胞中的编辑效率较低，限制了其应用。本研究的目标是优化一个未被充分表征的Cas12i成员——Cas12i3，提升其活性、拓宽其PAM识别范围，并降低其脱靶效应，从而创建一个强大的通用型编辑平台。

科学家们开发出一种名为“桥接重组酶”的革命性基因编辑工具，首次实现了对人类基因组进行兆碱基尺度的精准重排。通过对ISCro4酶及其指导RNA进行系统性工程改造，该技术不仅能高效插入基因，还能无疤痕地精准倒转或切除长达近百万碱基的DNA片段。研究团队揭示了其独特的作用机制，并通过深度突变扫描进一步优化了酶活性。这项技术为解析复杂疾病遗传基础、开发染色体级基因疗法（如切除致病重复序列）开辟了全新道路，标志着基因组编程迈入了前所未有的宏大尺度。

研究开发了一种名为ABE-NW1的新型基因编辑工具，成功解决了当前碱基编辑器存在的“旁观者编辑”这一核心难题。通过将天然蛋白质的精准结合模块嵌入编辑器核心，研究人员将编辑窗口从10个碱基大幅缩窄至4个碱基，从而能高度精准地修改目标碱基，避免误伤周边区域。实验证明，ABE-NW1在保持高效编辑的同时，显著降低了脱靶风险。在囊性纤维化疾病模型中，它成功实现了对致病突变的高精度、高效率纠正，为安全有效的基因疗法开发铺平了道路。

通过AI驱动的结构预测与理性设计，对天然Cas12i3核酸酶进行优化，开发出高效变体Cas-SF01。该工具在动物和植物中均展现卓越编辑能力：在哺乳动物细胞中编辑效率达80%，优于SpCas9和AsCas12a Ultra；PAM识别范围扩展至NTTN、NATN及TTVN；通过D876R突变进一步衍生出高保真版本Cas-SF01HiFi

研究团队在李斯特菌中发现11种新型抗CRISPR蛋白，其中三种直接源自Cas基因“劫持”，为理解病毒宿主军备竞赛提供全新范式

研究发现Panoptes系统以抑制性信号分子c-di-AMP作“安全栓”，病毒为逃逸CBASS免疫而清除该信号时，将触发细胞自毁，高效阻断噬菌体传播