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上海生物芯片有限公司
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生信实用小工具——不一样的热图
149 人阅读发布时间：2025-06-12 10:11
在展示多样本数据分布时，除了箱型图和小提琴图，密度热图也是一个不错的选择。下面我们就来了解一下ComplexHeatmap包绘制出的密度热图。
01 密度热图介绍
密度热图中每列为一个样本，颜色体现密度，越接近深红色密度越高，深蓝色为密度低。五条黑色虚线分别对应了五个分位，红色虚线为均值。
02 参数调整
修改y轴范围
修改色阶
样本聚类
添加列注释
下图在上方添加了颜色条，用于区分样本分组，下方添加了散点图注释。
03 添加为热图列注释
密度热图不仅可以添加列注释，也可以作为列注释添加在常规热图的上方或下方。下图添加了两个列注释，第一个是密度热图，用于展示样本表达值的分布情况；第二个是柱状图，用于展示每个样本中某指标的高低。
