转录组和蛋白组联合分析没思路？3种方法让你快速上手！

用散点图展示基因在两个组学中差异倍数取对数后的结果，体现差异倍数的关联性。下图中横轴为基因在转录组中的Log2FC，纵轴为蛋白组的Log2FC，右上角区域的红色点代表在两个组学中皆为上调的差异基因，左下角的深蓝色点代表在两个组学中皆为下调的差异基因，这两个区域点的数量越多，两个组学结果的关联性越强。

用两个组学共有差异基因的表达量绘制相关性热图，下图中的主对角线为相同基因在转录组与蛋白组中表达量的相关性，可以看到颜色都是比较深的红色，表示相关性较高。

筛选出两个组学的差异基因共同富集到的通路，用富集分析得到的Pvalue取-log10对数绘制热图，展示在两个组学中显著富集的通路。