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254 人阅读发布时间:2025-04-10 10:53
微生物生物膜(Biofilm)是由细菌、真菌等微生物聚集形成的结构化群落,表面包裹着胞外聚合物(EPS)。它们广泛存在于自然界(如水体、土壤)和人工环境(如医疗器械、管道内壁)中,具有强耐药性和环境适应性,是导致慢性感染、工业腐蚀等问题的重要原因。
传统检测方法的局限:
培养法:仅能检测约1%的可培养微生物,且破坏生物膜原始结构。
高通量测序:提供物种组成但无法定位微生物的空间分布。
FISH技术的优势:
荧光原位杂交(Fluorescence in situ Hybridization, FISH)通过荧光标记的核酸探针与目标微生物的rRNA结合,实现:
✅ 原位检测:保持生物膜三维结构,直观观察菌群空间排列。
✅ 高特异性:针对16S/23S rRNA设计探针,精准识别目标菌。
✅ 多重分析:不同颜色荧光标记同步检测多种微生物。
固定:采用4%多聚甲醛或乙醇固定,维持生物膜形态。
脱水:梯度乙醇处理避免结构坍塌。
切片(可选):对厚生物膜(>50μm)进行冷冻/石蜡切片。
探针选择:
通用探针(如EUB338靶向大多数细菌)。
特异探针(如PAO642针对聚磷菌)。
杂交条件:46℃孵育2-4小时,严格洗脱未结合探针。
共聚焦显微镜:获取Z轴堆叠图像,重构3D生物膜结构。
定量软件(如ImageJ、Daime):计算菌群比例、空间共定位系数。
医疗器械相关感染:定位导管、人工关节表面的耐药菌生物膜。
口腔微生物组:分析牙菌斑中致病菌的空间共生关系。
水处理系统:监测活性污泥功能菌群分布,预警系统失效。
食品加工管道:检测李斯特菌等致病菌生物膜形成风险。
多组学关联:结合宏基因组数据验证功能基因表达位置。
动态观测:时间序列FISH追踪生物膜发育过程。
文献资料参考:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6275336/
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