circRNA—RNA研究领域升起的新星
867 人阅读发布时间:2021-08-12 16:08
circRNAs(Circular RNAs,环形RNA分子)是一类不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。circRNA是区别于传统线性RNA的一类新型RNA,具有闭合环状结构,大量存在于真核转录组中。大部分的环状RNA是由外显子序列构成,在不同的物种中具有保守性,同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状RNA对核酸酶不敏感,所以比线性RNA更为稳定,这使得环状RNA在作为新型临床诊断标记物的开发应用上具有明显优势。
1. circRNAs形成
circRNA通过非经典剪接方式进行反向剪接形成。一种模型认为pre-RNA 的转录过程中由于RNA发生了部分折叠,拉近了原本非相邻的外显子,从而发生了外显子跳跃( exon skipping ) ,使得被跨越的区域形成了环形RNA中间体,进一步通过套索剪接形成由外显子构成的环形RNA分子。另一种模型认为,位于内含子区域的反向互补序列导致了内含子区域配对介导反向剪接从而形成环形RNA分子。
circRNAs的形成不同于线性RNA的标准剪切模式,是通过backsplicing方式剪切而来。现有的circRNA形成模型主要由以下几种:
(a)“lariat-driven circularization”或者“exon skipping”;
(b)“intron-pairing-driven circularization”或者“direct backsplicing”;
(c)环状内含子RNA(ciRNAs)形成模式;
(d)依赖于RBPs环化模式;
(e)类似于可变剪切的可变环化模式;
图1:circRNAs形成的几种模型
资料格式:
circRNA—RNA研究领域升起的新星.pdf
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