结论: 作者利用2014年11月从14个污水处理厂收集的废水样本的宏基因组数据,对纽约市(NYC)废水中的病毒群落进行了分析。研究发现噬菌体是污水样本中最主要的病毒成分,特定的病毒群落与采样行政区内的当地环境条件有关。绝大多数病毒序列在公共数据库中没有检测到同源匹配序列,平均获得1700个独特的病毒簇(假定属)。研究通过modular-nested模式构建了感染网络,网络表明噬菌体具备宿主特异性。研究还在病毒群落中鉴定了参与碳和硫循环的基因,表明病毒在废水环境中的循环途径和基因功能的重要性。此外,研究鉴定了一系列病毒噬菌体的基因以及一个新病毒噬菌体基因组的近完成图。这些发现有助于了解纽约市废水中噬菌体的丰度和多样性,并进一步研究城市环境中噬菌体-宿主关联的地理模式。 参考文献: Gulino K, Rahman J, Badri M, Morton J, Bonneau R, Ghedin E. Initial Mapping of the New York City Wastewater Virome. mSystems. 2020 Jun 16;5(3) pii: 5/3/e00876-19. doi: 10.1128/mSystems.00876-19.