单细胞组学分析策略详解:单细胞样本制备技巧与 RNA 测序技术要素

细胞生物学
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俞珺璟
中科院分子细胞科学卓越创新中心 细胞分析技术平台流式主管 ◇◇ 个人背景: 2004-2009 中国科学院生物物理研究所获博士学位; 2007-2009 年美国密苏里州 Stowers Institute for Medical Research 访问学者; 2010-2018 在中国科学院生物物理所感染与免疫重点实验室从事细胞生物学及天然免疫学相关研究,相关研究发表于 Nature Microbiology、Cell Host & Microbe 等国际期刊。 2018 年 9 月加入中科院生物化学和细胞生物学研究所细胞分析平台担任流式部门主管,主要负责流式平台仪器运维、大型仪器理论及实操培训,承担流式相关功能开发研制项目,并作为特邀主编,编撰《流式细胞术实验手册》,已在线发表于 Bio-Protocol。
宗亮
华大科技 技术优化高级工程师 ◇◇ 个人背景: 华大科技技术优化高级工程师。组建基于 Smart-seq2 的单管测序方法和基于 10x Genomics 的高通量测序方法,负责 RNA 测序技术的工艺优化及 Troubleshooting、自主测序平台的技术转移和技术支持。著有 SCI 文献 2 篇,发明专利 6 件。
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随着单细胞测序技术的兴起,科研人员可以精准分辨单个细胞间的生物学差异,为基础科研和临床研究提供了更加开阔深入的视野。流式细胞分选作为单细胞测序的上游方法,是获取目标活细胞的主要技术手段之一,分选后细胞可直接用于基因组学、转录组学和蛋白组学的研究,也可直接进行体外培养和功能实验、体内回输实验等。 为详解单细胞分选以及转录组学研究的相关内容,本课程邀请到中科院与华大科技的两位资深老师,从多种复杂样本的解离方法出发,结合单细胞分选条件优化、建库技术和 RNA 测序平台的选择,为相关领域的研究者提供全面而细致的方法和经验,以期实现预期的实验结果。 · 样本前处理技术特点 · 细胞系样本制备 · 免疫细胞样本制备 · 干细胞样本制备 · 多种器官组织样本制备 · 建库技术发展 · RNA 测序方法选择