动植物基因组测序
产品简介
De novo 测序即对被测基因组进行从头测序及拼接、组装，从而获得全基因组单碱基精度序列图谱。相对于全基因组重测序，De novo 测序能够获得参考基因组序列中没有包含的个体基因组「新序列」，能够对个体基因组进行更完整的解读，采用全基因组 De novo 组装及信息分析可以更好地帮助了解个体遗传特征。全基因组序列图谱完成后，可以构建该物种的基因组数据库；为该物种的后基因组学研究搭建一个高效的平台；为后续的基因挖掘、功能验证提供 DNA 序列信息。
信息分析
（1）基因组组装：
i 组装；
ii GC-Depth 分布分析；
iii GC 含量分布分析；
iv 测序深度分析；
v 常染色体区域覆盖度评估（需要客户提供 BAC 或者 Fosmid 序列）；
vi 基因区覆盖度评估（需要客户提供 EST 或者转录组序列）。
（2）基因组注释：
i repeat 注释；
ii 基因预测；
iii 基因功能注释；
iv ncRNA 注释。
（3）进化分析：
i 基因家族鉴定（动物 TreeFam，植物 OrthoMCL）；
ii b）系统进化树构建；
iii 物种分歧时间估算（需要标定时间信息）；
iv 基因组共线性分析；
v 全基因组复制分析（动物 WGAC；植物 WGD）