原核生物转录组测序
产品简介
原核转录组测序是基于二代高通量测序平台，构建链特异性文库研究原核生物在某个时期或者在某种环境条件下转录出来的所有 mRNA，从基因序列水平和表达水平来获得原核生物在某个时期或者在某种环境条件下所有的序列信息。由于原核生物 mRNA 没有 polyA 尾结构，需要去除 rRNA 来获得 mRNA，安诺基因针对不同的研究物种采取 Ribo-Zero 试剂盒有效的去除 rRNA，保证数据量，并构建链特异性文库来研究原核转录组的结构特征。
信息分析
(1) 对原始数据迚行质控；
(2) 测序评估（比对统计、测序随机性评估、Reads 在基因组上的分布）；
(3) 统计 rRNA 去除效率（rRNA 比例统计）；
(4) 基因表达水平分析；
(5) 基因差异表达分析；
(6) 差异基因的 GO 富集分析；
(7) 差异基因的 KEGG 富集分析；
(8) 蛋白互作网络分析；
(9)SNP 和 InDel 分析；
(10) 预测新转录本及功能注释；
(11)UTR 注释及相兲分析；
(12)Promoter 预测；
(13) 反义转录本预测；
(14)ncRNA 分析。
样本要求
(1) 样品类型：去蛋白并进行 DNase 处理后的完整总 RNA；
(2) 样品需求量：≥ 10 μg；
(3) 样品浓度：≥ 250 ng/μl；
(4) 样品纯度：OD260/280 = 1.8～2.2；OD260/230 = 1.8～2.2；