应用实例12：多波长细胞分类计数（Multi Wavelength Cell Scoring）
在药物筛选过程中，常常需要对细胞内的特异性标记进行分析。当细胞内有多种特异性标记物时，确切分析每一种Marker在细胞内分布和表达的情况时，就会使分析过程变得异常的困难和繁琐，需要很多的时间和人力。MWCS就是针对多种细胞内Marker定量分析的一种解决方法，该分析模块能够检测、定量分析和计算多达7中Marker在细胞内的分布情况，该方法操作简单，对于细胞的处理简单。多达7中的Marker可为胞核或胞浆内的任意Marker，无需特定试剂盒，分析后能够获得如细胞数量、各种Marker阳性和阴性细胞的数量和比例、各种Marker在细胞内的荧光总强度、平均强度，及Marker在细胞内分布的面积等。
细胞经Hochest 33342和FITC标记的微管蛋白抗体标记后，放入ImageXpress Micro中移20X成像，经MWCS分析，可见软件准确辨认细胞核细胞的边缘（左下图），其中绿色细胞为细胞面积大于某个特定阈值（用户设定）的细胞，灰色细胞为细胞面积小于特定阈值的细胞。软件能够得到每个细胞的多个参数（右下图），包括细胞的大小、面积等，及每个细胞内FITC的荧光强度。