来看一下中国科研人员都在研究啥基因?
GCBI 网站为广大的中国科研用户提供基因检索服务,总共提供 172 176 条基因的检索,物种主要人,小鼠,大鼠。
提供的信息主要包括这 17 万条基因的介绍,其转录本信息,功能信息,参与的信号通路,靶向该基因的所有 miRNA 列表,已有的 SNP 突变位点信息,基因组浏览图,以及该基因相关的文献等。
GCBI 网站一年来,向中国科研用户提供了 32 145 次基因检索服务,共有 23 193 条基因被检索。
那么让我们来看看,最被大家所关注的基因有哪些?
可以看出某些基因是大家较为熟知的基因,但也有部分较新的基因出现在基因检索排名的榜单里,同时对应了基因相关的 pubmed 文献数量,研究越多的基因其所受的关注度未必高,说明中国科研人员并不是一直追逐热点基因,也会选择一些研究较少的基因作为研究对象。
接着,我们挑选了检索排名前 100 的基因列表,对这些基因进行了 GO 和 pathway 分析看这些基因是否集中于某些功能或某些 pathway,以便更全面的挖掘一些信息。
从 pathway 的结果来看,这些基因基本上都集中在多种恶性肿瘤的通路中以及肿瘤发生、转移相关的重要通路中。
从 GO 分析的结果来看,这部分基因的功能大多集中在细胞生长、增殖、凋亡调控的功能,以及免疫调节相关功能,结合 pathway 的结果,这些基因的功能基本都与恶性肿瘤的发生、增殖、转移相关。
紧接着,让我们来看看这 100 个基因之前存在哪些相互作用的关系。
可以看出这些基因存在较为密切的上下游关系,而 MAPK1 作为核心基因,其调控的通路基本都与肿瘤相关。
从以上三个分析结果可见,中国科研用户的研究领域存在着非常集中的特点,结合之前文献检索的数据可以看出,中国科研人员确实在努力集中力量攻克肿瘤研究的难关。