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MHC捕获测序技术分析策略

   2013-10-30
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MHC捕获测序信息分析内容

1、标准信息分析

1)去除接头污染和低质量数据

2)使用比对软件将clean reads比对到人基因组上,并统计产出数据(基于第1条)

3)SNP检测,注释和统计(基于第1、2条)

4)InDel检测,注释和统计(基于第1、2条)

5)26个基因的HLA分型(基于第1、2条)

2、高级信息分析

1)SNP,InDel与疾病的关联分析(基于第3、4条、基于群体)

2)26个基因的HLA型别与疾病的关联分析(基于第5条、基于群体)

信息分析内容正在升级中,敬请期待!我们也可结合客户的需求,协商定制化信息分析内容。

 

编辑: gaowei2010    来源:丁香园

深圳华大基因科技服务有限公司(简称华大科技)成立于2012年4月,是全球最大的基因组学研究机构—华大基因旗下的子公司,秉承 “科技合作与服务”的产业理念,致力于成为全球科研工作者的首选科技合作伙伴。

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