苏州安可济联合 Twist Bioscience 助力新型冠状病毒基因检测

   2020-02-21
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2019 年 12 月下旬,中国武汉报道了因不明微生物病原体导致的病毒性肺炎患者。一种新型冠状病毒随后被确定为致病病原体,被命名为 2019- nCoV(最新命名为 SARS-CoV-2)。截至 2020 年 2 月 18 日,已有 7 万多例 2019-nCoV(SARS-CoV-2)感染病例得到确诊,疫情的形势依然严峻,能为疫情助力成为我们的期盼。苏州安可济积极响应国家号召,密切关注疫情形势,联合 Twist Bioscience,推出基于杂交捕获的呼吸系统病毒检测试剂盒-Respiratory Viral Panel,可有效鉴别多种冠状病毒和流感/副流感病毒,并可得到病毒全长基因组序列。本次推出的检测试剂盒囊括 2019-nCoV(SARS-CoV-2)在内的 13 种冠状病毒,以及 8 种流感病毒、5 种副流感病毒。

  • 捕获平台:Respiratory Viral Panel

  • 病毒种类:覆盖 13 种冠状病毒、8 种流感病毒、5 种副流感病毒

  • 测序平台:Illumina 测序平台

  • 测序需求:<1M reads

  • 测序读长:2x150bp、2x100bp 或 2x75bp

  • 样本类型:多种样本类型,包括咽拭子、鼻咽拭子、肺泡灌洗液、痰液、呼吸道洗液、呼吸道分泌物、血浆等


覆盖多种呼吸系统病毒

根据国家新冠病毒诊疗指南对呼吸道病毒辨别诊断的需求,专门针对呼吸系统已知的可引起严重疫情的病毒进行设计,包含了冠状病毒和流感/副流感病毒两大类共 26 种病毒:

  • 冠状病毒 

已知的可感染人类的 7 种冠状病毒基因组全长:229E、OC43、NL63、HKU1、MERS、SARS、2019-nCoV(SARS-CoV-2);

其它几种冠状病毒 (α、β、γ、δ四个属),并包括蝙蝠的冠状病毒。

  • 流感病毒及副流感病毒  

8 种流感病毒,包括 6 种 A 型及 B 型、C 型各 1 种;

5 种副流感病毒。

高效的检测方法

相较于宏基因组检测的方法,使用杂交捕获法进行病毒检测有如下多个优势:• 因为有靶向富集过程,检测灵敏度高;• 可以检测低比例的突变株;• 无需分离病毒株,可针对临床样本直接进行检测;•所需测序量少,每个样本< 1M reads,适用于 iSeq/MiniSeq/MiSeq(Dx)/NextSeq(Dx) 等多种测序仪;• 可复原全长基因组序列,并用于突变、 耐药、传播与进化分析;• 数据分析简单、快速 。

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图 1. Respiratory Viral Panel 的检测流程

优越的性能指标

Twist 探针独特的 NGS 质控,对每一批合成的探针,都会做 NGS 质控,以保证所有的探针都成功合成,同时合成的探针浓度在正常范围内。

苏州安可济的 Respiratory Viral Panel 受益于 Twist 高性能的杂交捕获体系,可以得到业内领先的高中靶率、高均一性、低重复率的数据。

基于该产品检测范围广、灵敏度高,且可以复原目标病原体基因组全长的技术特点,在当期疫情发展阶段可用于直接对临床样品开展检测,实时动态监测病毒基因组的突变情况;在疫情过后,也可以用于日常的呼吸道感染鉴别,提升严重呼吸道疾病的检测准确度。 

注:Twist Bioscience 产品仅用于科研 (www.twistbioscience.com/tos)

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苏州安可济生物科技有限公司成立于 2016 年,并于 2019 年成为上海东人投资管理有限公司的全资子公司。公司生产及研发场地位于苏州工业园区星湖街 218 号生物纳米园,占地面积超过 2000m2。公司专注于体外诊断产品的研发、生产并提供相关技术咨询服务。目前公司已经利用独有的专利技术开发出成熟的基于扩增子 NGS 方法的肺癌、结直肠癌-cfDNA 突变检测试剂盒产品,以及基于 Twist 杂交捕获技术的 NGS 大 panel 肿瘤检测试剂盒,并将继续推进全外显子组检测产品的研发。同时,公司也基于市场需求,开发了基于杂交捕获的 NGS 微生物检测产品线,如呼吸系统病毒检测、结核检测、消化系统病原微生物检测、血液系统病原微生物检测等。苏州安可济生物科技有限公司致力于不断为临床市场提供可靠、及时的临床检测解决方案,为抗击疫情贡献一份力量。 

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Twist Bioscience 为致力于让世界变得更好的客户服务。在医疗、农业、化工、数据存储等领域,客户正使用我们的合成 DNA 工具来开发改善生活和提高地球可持续性的方法。我们的客户越快成功,对我们大家越有益。而 Twist Bioscience 具有独特的优势,能帮助他们加快步伐。

我们的创新型硅基 DNA 合成平台为客户提供更高的精度。我们的平台技术解决了低效率问题,可实现经济高效、快速精确的高通量合成和测序,提供充足的优质工具来帮助客户迅速发现未来机遇。有关产品和服务的详细信息,请浏览 www.twistbioscience.com。


来源:测序中国

文章来源:微信公众号「Twist Bioscience 拓唯思特」  

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编辑: zhuq    来源:Twist Bioscience 拓唯思特

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