厦门大学联合厦门致善生物无偿提供新型冠状病毒假病毒 RNA 标准品

   2020-02-04
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因应对疫情需要,多个新型冠状病毒 RNA 检测试剂盒通过应急通道获批进入临床,如何评价并质控这些试剂盒的性能正成为一个突出问题。为此,厦门大学生命科学学院的李庆阁和张永有两位教授设计出新型冠状病毒(2019-nCoV)假病毒 RNA,委托厦门致善生物科技股份有限公司组织生产,向社会免费提供 10,000 支(规格:108 个假病毒/mL,1 mL/支),受赠对象为医院检验科、疾控中心、临床检验中心和病毒核酸检测试剂生产企业等,以帮助这些单位建立新型冠状病毒 RNA 检测的质量评价体系。

假病毒 RNA 即装甲 RNA,可最大程度模拟 RNA 病毒,又具有绝对的生物安全属性和可靠的稳定性,是理想的 RNA 病毒核酸检测试剂的阳性对照物质,可以全程监控病毒 RNA 提取、逆转录和扩增各步骤,既可用于试剂盒的性能评价,也是厂家制备标准品的关键原材料。此次无偿提供的新型冠状病毒 2019-nCoV 假病毒 RNA 标准品共计 3 种,对应中国疾病预防控制中心(CDC)和世界卫生组织(WHO)推荐的检测体系,适合按照这些体系设计的试剂盒的性能评价和质量控制。3 种假病毒 RNA 的模板序列信息及相应的引物和探针位置如下。

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1. 2019-nCoV ORF1ab(中国 CDC 推荐检测基因区域)

中国 CDC 推荐的 ORF1ab 区的上游引物为 5』-CCCTGTGGGTTTTACACTTAA-3』,下游引物为 5』-ACGATTGTGCATCAGCTGA-3』,检测探针为 5』-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG-BHQ1-3』,扩增子长度 119 bp,围绕扩增子区域的假病毒 RNA 长度 350 nt(见下,其中黄色区域为引物和探针位置)。

5‘-TGGTGCATCGTGTTGTCTGTACTGCCGTTGCCACATAGATCATCCAAATCCTAAAGGATTTTGTGACTTAAAAGGTAAGTATGTACAAATACCTACAACTTGTGCTAATGACCCTGTGGGTTTTACACTTAAAAACACAGTCTGTACCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGGCTGTAGTTGTGATCAACTCCGCGAACCCATGCTTCAGTCAGCTGATGCACAATCGTTTTTAAACGGGTTTGCGGTGTAAGTGCAGCCCGTCTTACACCGTGCGGCACAGGCACTAGTACTGATGTCGTATACAGGGCTTTTGACATCTACAATGATAAAGTAGCTGGTTTTGCTAA-3’

2. 2019-nCoV 核衣壳蛋白基因 N(中国 CDC 推荐检测基因区域)

中国 CDC 推荐的核衣壳蛋白基因 N 的上游引物为 5』-GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT-3』,下游引物为 5』-CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG-3』,检测探针为 5』-FAM-TTGCTGCTGCTTGACAGATT-TAMRA-3』,扩增子长度 99 bp,围绕扩增区域的假病毒 RNA 长度 350 nt(见下,其中黄色区域为引物和探针位置)。

5’-

ATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAAGGGAGCAGAGGCGGCAGTCAAGCCTCTTCTCGTTCCTCATCACGT

GTAGTCGCAACAGTTCAAGAAATTCAACTCCAGGCAGCAGTAGGGGAACTTCTCCTGCTAGAATGGCTGGCAATGGCGGTGATGCTGCTCTTGCTTTGCTGCTGCTTGACAGATTGAACCAGCTTGAGAGCAAAATGTCTGGTAAAGGCCAACAACAACAAGGCCAAACTGTCACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGCTTCTAAGAAGCCTCGGCAAAAACGTACTGCCACTAAAGCATACAATGTAACACAAGCTTTCGGCAGACGTGGTCCAGAACAAACCC-3’

3. 2019-nCoV 包膜蛋白基因 E(欧洲科学家推荐检测区域)

WHO 网站列出的由德国、荷兰和英国数位科学家公开的包膜蛋白基因 E 基因的上游引物为 5-ACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT-3,下游引物为 5-ATATTGCAGCAGTACGCACACA-3,检测探针为 5-FAM-ACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCG-BHQ1-3,  扩增子长度 113 bp,围绕扩增区域的假病毒 RNA 长度 350 nt(见下,其中蓝色区域为引物和探针位置)

5’-

ATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAAGGGAGCAGAGGCGGCAGTCAAGCCTCTTCTCGTTCCTCATCACGT

CAAGCTGATGAGTACGAACTTATGTACTCATTCGTTTCGGAAGAGACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGTACTTCTTTTTCTTGCTTTCGTGGTATTCTTGCTAGTTACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCGATTGTGTGCGTACTGCTGCAATATTGTTAACGTGAGTCTTGTAAAACCTTCTTTTTACGTTTACTCTCGTGTTAAAAATCTGAATTCTTCTAGAGTTCCTGATCTTCTGGTCTAAACGAACTAAATATTATATTAGTTTTTCT-3’

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*免费提供方案将以最大化协同合作伙伴满足疾控疫情防护为目标,致善生物对此保留最终解释权。

需要假病毒的单位,请关注公众号或官网,获取信息填写表。我们也将持续推出更多产品,投入到抵抗疫情的工作中


文章来源:微信公众号「致善生物」  

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编辑: zhuq    来源:致善生物

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