中药的有效成分是其药理作用的基础,运用现代科学技术和手段研究、揭示中药的多成分、多分子效应机制,是当今中药学研究和发展的基本方向。通过研究中药有效成分与生物大分子之间的关系,有助于中药药理作用机制的研究和药物筛选,更有利于疾病的检测预防和靶向治疗。近年来,基于生物层干涉技术(Biolayer Interferometry,BLI)的 Octet®非标记分子互作分析系统在中药调节信号通路传导、中药靶向治疗等方面的应用有了快速的发展 [1]。 ➤ 中药有效成分靶点互作研究 [2] 南京中医药大学
通过亲和层析筛选与人参皂苷主要成分相互作用的蛋白,鉴定出 14 - 3 - 3ζ蛋白为人参皂苷在脑组织中的潜在靶点。使用 Octet®鉴定了 20(S)- prototopanaxadiol (PPD,人参皂苷的代谢物) 与 14 - 3 - 3ζ 蛋白的直接相互作用(图 1)。14 - 3 - 3ζ蛋白-PPD 复合物的共晶体结构表明,14 - 3 - 3ζ蛋白的 R56、R127 和 Y128 氨基酸残基参与与 PPD 互作,其中任何一个残基突变都会导致 PPD 与 14 - 3 - 3ζ蛋白的亲和力显著降低。该研究结果有助于更好地了解人参调节神经元活性的作用机制,为基于人参皂苷结构开发与 14 - 3 - 3ζ结合的小分子化合物奠定基础。
图 1. 上半部分为中药新靶点发现与鉴定的技术路线:BLI(Octet®)主要用于鉴定靶点(14 - 3 - 3 ζ蛋白)与人参皂苷的结合;下半部分表格为靶点突变体与人参皂苷的亲和力测定。 ➤ 用靶点垂钓有效成分 [3] 西南医科大学
BLI 生物层干涉技术与高分辨质谱联合使用,并以 Aβ作为诱饵来垂钓中药开心散(由远志、人参、茯苓和石菖蒲这 4 味中药组成)中可以与 Aβ相互结合的潜在小分子抑制剂。
1. 将 Aβ结合在 Octet®传感器上,然后将开心散提取液与传感器上的 Aβ进行结合并解离;
2. 将收集到的解离液应用高分辨质谱进行分析并鉴定,发现去氢土莫酸(DTA)、猪苓酸 C(PPAC)和土莫酸(TA)三个化合物与 Aβ有着最强的结合力;
3. 通过色谱分离制备出这三个化合物后,然后在 AD 的细胞和线虫模型上对这些化合物的抑制 Aβ纤维形成的活性进行了评价;
4. 研究发现,这些化合物在体内外均有很好的抑制 Aβ纤维形成的活性(图 2): 图 2. 纯化的 TA 与 Aβ的亲和力检测 ➤ 天然产物构效关系研究 [4] 中国药科大学
CDC37 是一种新的肿瘤治疗靶点,天然产物雷公藤红素(celastrol)能够很好的抑制该靶点活性。现在从 celastrol 的基本结构(三萜)出发,合成了一系列化合物,用 Octet®测定了所有化合物与药物靶点 CDC37 相互作用。
1#化合物替换了 A 环的酮基,11#化合物改变了 A 环的羟基极性,BLI 亲和力测试发现,1#的亲和力为 90 μM,而 11#化合物则无法与蛋白结合。说明 A 环的羟基极性对保持其活性是非常重要的(图 3)。
图 3. 左边为 Octet® Red 96 测定的 Celastrol 衍生物与 CDC37 的亲和力,右边为根据 BLI 结果得出的化合物构效关系 ➤ 天然化合物库筛选和小分子竞争实验 [5] 澳门科技大学
基于分子对接并结合 Octet®互作仪在天然化合物中筛选潜在 SARS-CoV- 2 抑制剂。一些天然化合物抑制 SARS-CoV- 2 诱导的 Vero E6 细胞的病变效应和斑块形成,使其丧失明显的动物毒性并具有 SARS-CoV- 2 假病毒突变体(D614 G、N501Y、N439K 和 Y453F)的抗病毒效果。通过 Octet®还发现,一些天然产物,比如 EGCG、Bkc 和 Ibvc 还与 ACE2 受体结合,体现与 RBD 和 ACE2 双重结合。Octet®还可以进行小分子之间的竞争实验,对小分子在蛋白靶点上的结合位点进行分组(图 4)。
与 RBD 结合的一系列天然化合物 图 4. Octet®小分子竞争实验: 绿色为相互不竞争,红色为相互竞争
BLI 技术在中药开发及研究领域的应用优势:
节约样品:只需要μg 级的蛋白量和μM 级的小分子量;
避免损失:没有复杂的流路系统,也没有泵和进样系统,减少样品的损失;
经济高效:实验后还可将剩余样品进行回收,减少了前期纯化样品的工作量;
快速便捷:耗时短,同时可以检测多种样品,实时监控检测结果,在前期中药筛选阶段,可以提高效率,节约宝贵时间。
BLI 技术被广泛应用于中药研究中,成为中药分子机制研究的主流技术,为中医药走向世界提供有力的支持与保障。 Download
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-参考文献-
《生物膜干涉技术在中药研究的应用》. 中国商品学会第五届全国中药商品学术大会
Identification and confirmation of 14 - 3 - 3 ζ as a novel target of ginsenosides in brain tissues,Journal of Ginseng Research,2020,1226 - 8453
High-throughput screening for amyloid-β binding natural small-molecules based on the combinational use of biolayer interferometry and UHPLCLDAD-Q/TOF-MS/MS. Acta Pharmaceutica Sinica B. 2021.
Betulinic acid acetate, an antiproliferative natural product, suppresses client proteins of heat shock protein pathways through a CDC37 -binding mechanism。RSC Adv., 2016, 6, 42537
Identification of natural compounds as SARS-CoV- 2 entry inhibitors by molecular docking-based virtual screening with bio-layer interferometry. Pharmacological Research 172 (2021) 105820 |