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高端研讨 顶级培训 | 第二届单细胞测序技术高端研讨会圆满闭幕
2019-07-04 14:30   来源: 博奥晶典生物  点击次数: 关键词: 单细胞测序 研讨会

6 月 29 日,由清华大学医学院、生物芯片北京国家工程研究中心、北京博奥晶典生物技术有限公司主办的「第二届单细胞测序技术高端研讨会」在北京喜来登大酒店成功举办。

大会参会人员合影

本次大会亮点纷呈,11 位单细胞领域权威专家领衔,围绕单细胞测序技术在生殖及早期胚胎发育、肿瘤诊断与个性化治疗、大脑发育及神经干细胞调控、动植物胚胎发育以及单细胞测序数据应用方向进行专题报告。此次大会共有来自北京、天津、河北、上海、河南、山东、江苏、广东、湖南、湖北、四川、黑龙江、辽宁、陕西、新疆 16 个省市,39 家医院、41 所科研院校的近 350 位参会嘉宾出席。

大会现场盛况

现场座无虚席,参会嘉宾热情洋溢,现场讨论气氛高涨,各领域专家学者围绕单细胞测序技术在实际科研中的应用,从样品制备到数据分析挖掘的难点进行了全方面的经验分享;晚间由博奥晶典生物信息工程师彭岩博士为参会学者带来了精彩的单细胞测序数据分析常用软件培训,分享博奥晶典在众多实战项目中的经验及如何更有效的进行大规模数据信息挖掘和数据整理的方法。

生物芯片北京国家工程研究中心常务副主任、博奥生物集团有限公司高级副总裁兼技术总监、北京博奥晶典生物技术有限公司总裁邢婉丽教授进行开幕式致辞

生物芯片北京国家工程研究中心常务副主任、博奥生物集团有限公司高级副总裁兼技术总监、北京博奥晶典生物技术有限公司总裁邢婉丽教授为本次会议进行了开幕式致辞。邢婉丽教授表示单细胞测序技术在生命科学和医学研究领域的应用日益受到关注,本次研讨会旨在对单细胞高质量研究成果的关键环节,如环境与质量控制、单细胞样本制备、单细胞扩增、海量数据挖掘、应用科学命题等内容进行信息分享,与大家共同探讨单细胞测序技术的最新研究进展,分享科研成果和应用经验。

大会报告精彩回顾

乔杰 院士

中国工程院院士、北京大学第三医院院长、国家妇产疾病临床医学研究中心主任乔杰院士作了题为《生殖及早期胚胎发育》的专题报告,并详细介绍了如何利用单细胞测序技术对胚胎及其发育过程进行研究。报告通过对单精子细胞的全基因组分析,揭示了精子发生中细胞命运的顺序转变及染色体交叉互换等精彩过程。此外,单细胞水平的基因组、转录组、DNA 甲基化和染色质可及性等多组学分析方法还应用到了对卵母细胞及卵泡发育过程的研究。乔院士表示单细胞测序技术的研究成果为生殖中心产前诊断提供了依据,将科学研究与临床紧密联系在一起,并对单细胞测序技术服务于基础研究和临床应用做了展望。

白凡 研究员

北京大学生命科学学院白凡研究员在大会上做了题为《单细胞组学在癌症研究中的应用》的专题报告。白凡研究员课题组通过对 CTC(循环肿瘤细胞)进行单细胞测序,发现胃癌、肺癌、乳腺癌、前列腺癌及非小细胞肺癌的转移位,获得肿瘤突变信息。此外,课题组通过单细胞测序对肿瘤病理形态进行研究,构建了混合型肝癌基因图谱并发现肿瘤克隆起源,为癌症研究提供了新的思路。

吴青峰 研究员

中国科学院遗传与发育生物学研究所吴青峰研究员做了题为《Application of scRNA-seq to decode the potential of somatic stem cells》的专题报告。吴青峰研究员为我们详细介绍了其应用单细胞测序技术进行的下丘脑干细胞研究的相关成果。研究表明,下丘脑干细胞在内环境稳态过程中是静止的,且缺乏食物诱导可塑性。通过研究下丘脑干细胞谱系,发现下丘脑干细胞对于组织修复损伤起着至关重要的作用以及 IGF1R 信号通路是维持稳态的重要通路。在病理学环境下,下丘脑干细胞具有再生和肿瘤生成的潜力。



蔡涛 研究员

北京生命科学研究所测序中心蔡涛研究员做了题为《Small RNA transcriptome analysis by parallel single cell small RNA sequencing (PSCSR-seq)》的专题报告。蔡涛研究员对本课题组自主开发的单细胞 small RNA 测序技术(PSCSR-seq)进行了阐述,对 PSCSR-seq 的技术原理及 small RNA 常用检测技术的比较进行了具体说明。课题组通过 PSCSR-seq 技术对癌细胞、PBMC 等样本的测试验证了 PSCSR-seq 技术较好的重复性,并表示 PSCSR-seq 技术应用于癌症和常规生命科学研究将成为可能。


刘鹏 研究员

清华大学医学院刘鹏研究员为我们带来了《表型与基因型相结合的高通量细胞分析平台》的专题报告。刘鹏研究员介绍了其课题组开发的一款基于超疏水原理的微孔阵列芯片,此芯片可与超分辨成像系统相结合,实现高通量超高内涵细胞成像分析。此外,该平台能够对多细胞和单细胞样本进行基因表达谱测序,将细胞表型与全基因组表达深度融合,实现高通量精准药物筛选,为单细胞测序研究提供了更多的科研选择。

王建斌 研究员

清华大学生命科学学院王建斌研究员做了题为《高通量单细胞技术的开发与评测》的专题报告。王建斌研究员带我们回顾了单细胞测序技术的发展历程,并为我们介绍了其课题组在单细胞测序技术方面取得的进展并将多平台技术方法进行了对比。课题组基于之前液滴高通量单细胞转录组测序技术的系统性分析,深入分析了各个系统的技术特征,并进一步在 10x Genomics 系统进行转录组测序检测的同时,针对其他分子特征的标记分析,这些分析结果将进一步帮助我们理解相关技术的本质,为今后的科研选择提供更多思路。

钱文峰 研究员

中国科学院遗传与发育生物学研究所钱文峰研究员做了题为《Dissecting the transcription regulation of abiotic stress response in rice at the single-cell resolution》的专题报告。钱文峰研究员针对植物单细胞测序做了详细报告,其课题组利用单细胞测序技术研究水稻叶肉细胞,发现等位基因表达普遍存在于水稻叶肉细胞中;利用单细胞转录组技术研究细胞分化过程,重构了细胞分化轨迹;在单细胞水平研究水稻对非生物胁迫的响应及细胞分化受非生物胁迫的响应,使水稻对非生物胁迫的响应研究有了新的突破。



文路 副研究员

北京大学生物动态光学成像中心文路副研究员为我们带来了《胃肠道癌的单细胞组学测序研究》的专题报告。文路博士介绍了一种单细胞三重组学测序技术(scTrio-Seq),该技术能够在单个细胞中同时对基因组拷贝数变异、DNA 甲基化组和转录组进行高通量测序分析。分享了其对结直肠癌的研究,系统解析了肿瘤细胞亚克隆的 DNA 甲基化异质性及其与转录组的关系。为各位老师开展单细胞多组学研究提供了新的方法。

吴凤英 副教授

同济大学附属上海市肺科医院吴凤英副教授为我们带来了《单细胞测序在肿瘤精准医疗中的意义》的专题报告。吴凤英副教授利用单细胞测序技术对肺癌患者进行研究,发现不同病理分型鳞癌和腺癌的肿瘤细胞异质性差异明显,不同患者免疫微环境存在显著差异。肿瘤异质性影响后续治疗效果,不同免疫微环境状态与免疫疗效相关。单细胞测序为实现从精准诊断到精准医疗的全程管理和复发检测提供了新的方法和途径。


赵琳琳 10x Genomics

来自 10x Genomics 的赵琳琳女士为我们带来了《Biology at True Resolution: Resolving Complex Biology with 10x Genomics》的专题报告。赵琳琳女士介绍了在单细胞分辨率下发现表观遗传异质性的技术(scATAC-seq),以及对同一个细胞进行 4 重分析来揭示免疫系统复杂性的方法及其应用研究。此外,介绍了空间转录组学与单细胞转录组学联合分析的研究思路,为单细胞领域研究者提供了更多的实验工具。

田瑜 Miltenyi Biotec

来自 Miltenyi Biotec 的田瑜博士为我们带来了《Sample Preparation in Single Cell Profiling of Solid Tumors and Mouse Brain》的专题报告。田瑜博士表示单细胞样本制备难度高已成为限制单细胞测序技术的重要因素。通过乳腺癌肿瘤异质性研究、免疫系统研究、小鼠神经系统研究等具体案例,分享了单细胞悬液制备的更多可能性。并表示从组织保存、组织消化到悬液优化,MACS™ technology 将有助于获得高活力、零碎片的单细胞样品,提高测序数据的一致性、文库的复杂度、细胞回复比例。


数据分析培训班精彩呈现

单细胞测序后往往拿到每个样品几百 G 的数据量,如何从这些大规模的数据中更有效的挖掘数据,整理数据十分重要。来自博奥晶典的生物信息工程师彭岩博士对单细胞测序技术在实际科研中的应用以及在实验开展期间数据分析和挖掘过程中的难点问题进行了全方面经验分享与实操展示,参会嘉宾对培训内容的分享表示高度认可。

博奥晶典生物信息分析工程师彭岩博士


会议持续到晚上 9 点,参会嘉宾的热情依然高涨。

培训班的火爆现场

会议精彩瞬间

至此,第二届单细胞测序技术高端研讨会圆满结束,感谢仁科生物的鼎力赞助,以及新格元生物、艾力特生物、倍辉生物、美天旎生物的大力支持。期待明年您与博奥的再次相聚!

编辑: wu一帆

 

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