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大牛的高颜值科研图片竟是用 PPT 做的
2018-04-16 10:55   来源: 丁香园  点击次数: 关键词: 高颜值 科研 PPT 攻略

大家读论文或者听报告的时候,经常会发现,论文里或者大牛的 PPT 里的图,不仅看起来赏心悦目,而且还能明确地说明科学问题。反观自己平时的作图,发现,差距不是一点点。


于是很多同学都吐槽 PPT 不够高级,画不了高级的图。应该是用别的软件,比如 Illustrator,Graphic 等。但我不这么觉得,PPT 是一款非常实用且功能强大的软件,即使用 PPT 也能画出一张赏心悦目,且明确反应科学问题的图。


那么,作为一个科研汪,如何用这款强大的软件画一张能放在 paper 里、比较高大上的图呢?


古人云:不积跬步无以至千里,不积小流无以成江海。说的是一点一滴的坚持,终会成就大业。我想说的是,再高大上的图,也都是由最基本的图形,一点点累积起来的。

1

有时候你需要的可能只是一些耐心


PPT 中插入的图形只是一些标准图形。比如,三角形,正方形等等。这些图形可以满足一些基本需求。但有时候,我们需要的不仅仅是基本图形。


比如,我需要一篇叶子,一颗植物,一个形状怪异的蛋白质亚基。这时候,标准图形就显得很无力。


我们需要一些改变。好在,PPT 中提供了这样一项功能。插入标准图形后,右击鼠标你会发现有个「编辑顶点」的功能。



我们可以利用这项功能,去画一片叶子,一株植物,一个形状奇特的蛋白亚基。于是,我画了几片叶子,用这几片叶子组装成一株拟南芥。


PPT 作图之画拟南芥


这是比较简单的应用。如果能把通过绘图把实验数据可视化,那么,这个方法做出来的图,将会显得更高级。


比如,有一段时间,我得到一批 RNA-seq 数据,里面有许多差异化表达的基因,通过分析发现许多差异化表达的基因编码的蛋白都用来组装光系统蛋白。常用的 RNA-seq 数据可视化的方法是 Heatmap(热图)。于是,我做了一个热图。


Heatmap(热图)表示的基因差异化表达


然而,我总觉得缺少了什么。要不我就画一张光系统的图吧。因为,组成光系统的蛋白亚基是分别由叶绿体基因和细胞核基因编码的。在这张图中,


我需要:


1. 在这张图里面先分别标注哪些蛋白质是叶绿体基因编码的,哪些蛋白是细胞核基因编码的;


2. 标注出实验中观察到的,叶绿体基因和细胞核基因的差异化表达。



利用这个「编辑顶点」功能,我首先可以画一个磷脂酸双分子层的膜结构,以及一堆蛋白质亚基:


磷脂双分子层



接着,你可以把这些组装起来(绿色的部分,就是由叶绿体基因编码的蛋白亚基)



植物叶绿体中的光系统,绿色为光合作用相关的叶绿体基因。


最后,把这些图精修一下,加上自己的实验数据(每个编码每个亚基的基因表达水平)就可以了。


(LHC: Light harvest complex protein(光吸收复合体); PhANGs: photosynthesis associated nuclear genes(光合作用相关细胞核基因); PhAPGs: photosynthesis associated plastid genes(光合作用相关的质体基因))


这样,比起 Heatmap,我将基因差异化表达更加实体化,数据一目了然。利用简单的「编辑顶点」的功能,我们从简单的画一片叶子,到画一个比较复杂的图,把基因表达数据可视化,用简单的功能,做出比较高级的图。


2

有时候,你可能需要一点技术


上述操作,可以说是一个非常庞大的工程了。但,其实可以不用那么麻烦。


这时候,你就需要一些运气和技巧。


需要的运气就是,如果你上网搜,刚好能搜到某些蛋白或者细胞结构的「矢量图」(后缀为「.eps」)。学植物分子生物学的我,运气并不好,并没有搜到光系统的矢量图。不过,学动物分子生物学的运气就好一些。比如,你可能需要画一颗心(脏)。于是,我在网上找到了这样一张完美的心脏。



然而,你只想要的只是一个大心脏啊。怎么办?不用怕。


下载这个图像,用 Adobe Illustrator 打开,然后点击 File export As (Enhanced Metafile (emf)) 格式的文件。



打开 PPT,把这个文件拖到 PPT 里选择图片,在工具栏找到「组合」选项,右击并选择「取消组合」。PPT 会出现以下弹窗,选择「是(Y)」,你就会惊奇地发现,这张图上的每个元件以及每个小图形,都变成了可编辑的图形选项。


移开那些暂时不需要的图标(也可以存一个备份,以备不时之需),留下一个完美的心脏。为了表示,这个方法确实可行,我把下面一些血管的颜色变成了亮粉色。


最后,总结一下就是:


1. 可以通过「编辑顶点」这一功能,耐心地把 PPT 里的标准图形,改成所需要的不规则图形。可以满足日常绘图的需求。通过与实验数据结合,可以画出更高级的图,将数据可视化。


2. 可以下载后缀为「.eps」的矢量图,用 Illustrator 输出为「.emf」的文件,导入到 PPT 中。


养成良好的习惯,遇到一些好看的以及常用的图,及时储存在一个文件夹里,日后需要的时候随时取出。随着时间的慢慢积累,就可以用 PPT 做出非常高大上的图了。


编辑: dxy_tofpvaaq

 

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