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Circular RNA Sy
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碧云天生产的Circular RNA Synthesis Kit,即环状RNA合成试剂盒,是一种非常便捷和高效的通过酶学方法将单链RNA (ssRNA)转化成环状RNA (circRNA)的试剂盒。合成的circRNA可以用于转染细胞研究circRNA的生物学功能等。
环状RNA是一种通过典型的5’-3’磷酸二酯键形成的环状结构的RNA分子,这种结构特征使得其不受RNA外切酶的影响,表达更稳定,不易降解。circRNA是生物体内源存在的一种通常为单链的环状RNA,可以在内含子反向剪接(trans-splicing)等过程中产生。
环状RNA的研究可以采用质粒或病毒表达的方式,通过反向剪接等产生circRNA。但通过质粒或病毒等产生circRNA的过程中涉及反向剪接等辅助性的过程,有可能会干扰研究结果。如果能直接转染合成的circRNA,就能更直接地研究circRNA的生物学功能。
本试剂盒进行单链RNA的环化反应的原理是,通过RNA环化酶(RNA Cyclase)环化5’磷酸化3’羟基的单链RNA。
本试剂盒环化效率高,操作便捷。环化效率通常可以达到95%以上,且操作仅需一步孵育即可完成。通常本试剂盒能将95%以上的5’磷酸化3’羟基的单链RNA (ssRNA)转化成环状RNA (circRNA),因此环化产物可以不需要切胶纯化,仅需热失活环化酶后通过乙醇沉淀即可用于后续实验。
本试剂盒催化5’磷酸化3’羟基的单链RNA分子环化连接生成环状RNA的效果参见图1。
图1. 使用碧云天生产的Circular RNA Synthesis Kit制备环状RNA (circular RNA, circRNA)的效果图。反应体系为20μl,单链RNA的终浓度为0.5μM,反应条件为37℃孵育30min,反应完毕后在65℃孵育15min终止反应,随后取样用15%尿素(7M)变性PAG在冰水浴中进行电泳,最终进行核酸染色和荧光成像分析。如图所示,本试剂盒在30min内就可以将95%以上的5’磷酸化3’羟基的单链RNA转化为环状RNA。
本试剂盒如果用于20μl的反应体系,分别可以用于20次和100次的circRNA合成反应。
-20℃保存,至少一年有效。
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