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    mRNA测序-转录组

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    mRNA测序-转录组

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      mRNA
      主要研究策略:
      1.收集癌组织以及癌旁组织,并提取其mRNA;2.将癌旁和癌组织中的mRNA进行对比,筛选两组之间的差异表达基因mRNA;3.通过生物信息学如GO功能分析了解差异基因富集在某种生物学功能、途径以及其定位;KEGG pathway分析差异mRNA其在癌症通路中的相关通路;4.找到mRNA分子作为肿瘤的致癌基因或抑癌基因;5.优点:与临床相结合,科研成果对药物研究如抑制剂的开发具有指导作用,易发文章。


      主要分析内容:
      1. 测序数据过滤以及参考基因组对比;
      2. 新转录本预测以及差异表达基因检测;
      3. 差异表达基因维恩图分析、层次聚类分析;
      4. 差异表达基因GO功能分析、 Pathway功能分析。

      技术参数:
      1. 样本类型:组织、细胞、血液等;
      2. 测序策略:HiSep PE 150

      *20例样本起

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