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      miRNA测序
      外泌体(Exosome)是活细胞分泌的来源于晚期核内体(也称为多囊泡体)的膜性囊泡,存在于体液中,包括血液、唾液、尿液、母乳、羊水等多种体液中,并携带有母细胞的多种蛋白质、脂类、RNA等重要信息,能作为信号分子传递给其他细胞从而改变其他细胞的功能,是细胞和细胞间信息传递的重要方式。

      研究意义:体液中外泌体 RNA(特别是 miRNA 等非编码 RNA)在健康与癌症中存在明显 的表达差异。因此外泌体里的 miRNA 常常成为某些疾病的 biomarker。

      承启特色:
      1.Exosome捕获率高,样本需求量低。承启协同SBI公司开发了目前世界上主流的 Exosome提取试剂盒之一SBI ExoQuickTM,实现了稳定的高纯度Exosome提取。

      2.专利超微量小片段核酸建库测序方法,灵敏度领先世界。传统微量miRNA建库方法一般需要1μg total RNA,承启通过改进建库方法,能对更低量的miRNA进行建库,并有效降低序列偏好性,使数据能够更真实地产出。
      3.全流程服务:提供从外泌体分离、RNA抽提、文库构建、测序到生物信息学分析整套服务。

      服务内容:
      1、外泌体的提取与外泌体miRNA测序分析;

      2、数据产出统计和质量评估;reads与参考序列比对;
      3、表达丰度统计以及表达水平分析,差异表达miRNA筛选;
      5、差异miRNA靶基因预测以及靶基因GO富集分析;
      6、差异miRNA靶基因Pathway富集分析。

      服务周全:从送样到结果交付,有专人负责协助解决客户面临的各种问题, 同时协助客户将分析结果以专利、SCI 文章、基金项目申请书的形式呈现出来。

      主要成果:
      专利:目前已协助客户完成 5 项外泌体相关的专利申请,目前均已进入实审公布阶段;
      SCI 文章:Sets of serum exosomal microRNAs as candidate diagnostic biomarkers for Kawasaki disease. 发表在 Scientific RepoRts, DOI: 10.1038/srep44706
      该研究是在完全不用知晓疾病的任何背景信息即可筛选出高灵敏度和高特异性的 Exosome miRNA,找到了4种Exosome miRNA 作为川崎病的分子标志物,在200多例临床样本及多中心单盲实验中取得了近乎100%的灵敏度和特异性,远远优于其他各种分子标志物。


       
      LncRNA测序
      主要研究策略:
      1.编码蛋白的基因上游启动子区转录,干扰下游基因的表达;
      2.抑制RNA聚合酶Ⅱ或介导染色质重构以及组蛋白修饰,影响下游基因(蓝色)的表达;
      3.与编码蛋白基因的转录本形成互补双链,干扰mRNA的剪切,形成不同的剪切形式;
      4..与编码蛋白基因的转录本形成互补双链,在Dicer酶的作用下产生内源性siRNA;
      5.与特定蛋白质结合,lncRNA转录本可调节相应蛋白的活性;
      6.作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体;
      7.结合到特定蛋白质上,改变该蛋白质的细胞定位:
      8.作为小分子RNA(如miRNA、piRNA)的前体分子。


      主要分析内容:
      1. 数据产出统计和质量评估;
      2. 序列比对与拼接;
      3. lncRNA表达丰度统计与表达水平分析;
      4. 差异性lncRNA的筛选及验证;
      5. 预测结合的mRNA;
      6. GO富集及KEGG分析。
      技术参数:
      1.样本类型:组织、细胞、全血等;
      2.测序策略:HiSep PE 150



      外泌体提取
      承启协同SBI公司开发了目前世界上主流的 Exosome提取试剂盒之一SBI ExoQuickTM,实现了稳定的高纯度Exosome提取。


      分析内容:

      1.详细的实验数据;
      2.完整的实验报告



      外泌体鉴定(透射电镜/NTA/WB)

      检测内容:

      1、透射电镜检测外泌体形态;
      2、NTA检测外泌体粒径大小;
      3、WB检测外泌体biomarker.

      分析内容:

      1.详细的实验数据;
      2.完整的实验报告。



       

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