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    外显子组测序

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    外显子组测序

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      人外显子测序是指利用探针杂交富集全基因组外显子区域的DNA序列,通过高通量测序后进行基因组分析的方法。外显子组测序分析是针对外显子变异检测的靶向测序,外显子组(人类基因组的蛋白编码区域)代表不到2%的人类基因组,却包含约85%的已知致病变异。外显子组测序能高效地鉴定变异,适合广泛的应用,包括癌症、遗传病和群体遗传学研究。与全基因组重测序相比,数据准确性更高,并且更加经济、高效。

      主要优势:
      1. 鉴定癌症中的编码突变:癌症外显子组的测序提供了有关促成肿瘤发展的编码突变的有用信息。外显子组测序让癌症研究人员能够只评估编码区域,因为它们最有可能含有影响肿瘤发展的突变:
      2. 对单基因病以及复杂疾病的潜在致病突变进行筛查。
      技术路线:

      技术参数:
      样本类型:基因组DNA,样本总量≥2 μg,样本浓度:≥20 ng/μL
      测序策略:HiSeq X ten PE150,推荐测序深度:50~100X
      ●  单基因病,复杂疾病建议外显子组测序深度50X以上
      ●  肿瘤建议外显子组测序深度建议100X以上
      捕获平台:Agilent
      项目周期:35个工作日


      生物信息分析内容:
      1、数据质控;
      2、与参考基因组比对(统计测序深度及覆盖度);
      3、SNP/ InDel检测、注释及统计;
      4、Somatic SNV/ InDel检测、注释及统计(肿瘤成对样本)


      主要研究策略:
      1.收集某一疾病,同一家系或者不同家系的样本;
      2.对家系中的患者进行全外显子分析,找出突变基因;
      3.通过数据比对过滤,筛选出候选致病基因;
      4.在其他样本中验证,确定该疾病的致病基因。




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