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    ceRNA 芯片

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    • 商家诚信度 
    • 入驻年限  10年
    • 上海市张江高科技园区李冰路151号
      • 服务名称:

        ceRNA 芯片

      • 提供商:

        上海伯豪生物技术有限公司

      SBC ceRNA芯片V1.0自推出以来,一直是伯豪RNA芯片的明星产品,助力众多的伯豪客户完成了相关领域非编码RNA,特别是ceRNA的研究。我们作为该款芯片的开发者和经营者,现在SBC ceRNA芯片V1.0全面升级为SBC ceRNA芯片V2.0啦,V2.0除具有V1.0所有的优势外,还拥有更新更全的数据库注释信息,为广大科研工作站的非编码RNA研究助一臂之力。

      ceRNA芯片三高一低

      1、高稳定性:ceRNA芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,探针长60mer,检出率高,技术重复性高于99%;利用芯片碱基互补杂交的方式,能够更灵敏、稳定地对表达丰度较低的circRNA、lncRNA进行检测;
      2、高性价比:同时覆盖circRNA、lncRNA、mRNA信息,一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息,让您畅游ceRNA调控研究;
      3、高特异性:对于circRNA,采用特异的反向剪接位点探针设计,保证每个探针特异性的检测circRNA,避免与母基因之间的冗余影响。
      4、低样本量:一次实验的起始RNA量仅需200ng,血清血浆及外泌体等微量样本同样适用。


      ceRNA芯片个性化分析
       由于目前circRNA、lncRNA的研究仍处于初级阶段, 大多数circRNA、lncRNA功能有待进一步探究,通常我们是通过与之相关的mRNA功能来推测其功能。ceRNA芯片结果中不仅给出了差异circRNA/lncRNA/mRNA,还给出了差异circRNA的母基因及其功能预测以及差异lncRNA的cis/trans靶基因及其功能预测,这将有助于客户对实验相关的差异circRNA/lncRNA进行进一步的功能机制研究。除此之外我们还提供多种个性化的高级分析,包括基因功能层次网络构建(GO-network)、信号通路调控网络构建(Pathway-network)、lncRNA和mRNA共表达分析以及ceRNA调控分析等。其中ceRNA调控分析基于基因的表达值,通过回归模型分析以及种子序列匹配的方法,建立miRNA的海绵吸附作用的调控网络,找到核心的ceRNA。
      SBC ceRNA芯片自推出以来,助力伯豪客户发表了多篇高分文章。来自天津平津医院的研究团队借助SBC human ceRNA芯片V1.0筛选胶质母细胞瘤(GBM)中特异高表达的circRNA/lncRNA,通过进一步的分子机制及功能研究发现circNT5E能够作为miRNA-422a的海绵吸附体,抑制其活性,进而影响胶质母细胞瘤的肿瘤发生。来自天津的另一研究团队利用SBC human ceRNA芯片V1.0检测胃癌病人血浆外泌体中关键的circRNA,通过一系列的研究发现外泌体中的circRNA ciRS-133可以通过靶向miR-133/PRDM16途径促进白色脂肪褐变。



      产品一 circRNA芯片

      筛选差异表达miRNA,差异miRNA靶基因预测。

      技术特点

      1. circRNA所有探针设计基于国际主流circRNA数据库信息;
      2. 环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计,保证每个探针检测的特异性,避免与母基因之间的冗余影响。

      芯片介绍

      产品二 ceRNA芯片

      一箭三雕,一张芯片同时检测lncRNA、circRNA、mRNA。

      技术特点

      1. 稳定:芯片采用Agilent eArray平台设计,使用Agilent SurePrint技术合成,探针长60mer,检出率高,技术重复性高于99%;利用芯片碱基互补杂交的方式,能够比测序技术更灵敏、稳定地对表达丰度较低的circRNA、lncRNA进行检测;
      2. 超值:芯片覆盖circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息,circRNA和lncRNA作为典型的内源竞争性RNA,此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究;
      3. 特异性高:环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计,保证每个探针检测的特异性,避免与母基因之间的冗余影响。

      芯片介绍

       

      伯豪特色

      1. 成熟的服务平台:稳定而系统的芯片实验全面解决方案,可为客户提供总RNA抽提、样品质检、RNA标记、杂交、洗脱、图像扫描、数据分析。
      2. 多样化的服务内容:提供芯片和测序两种高通量检测技术以及低通量检测技术RT-PCR。
      3. 专业的实验人员:从RNA抽提到芯片杂交均配有专业的实验人员,丰富的芯片操作经验,确保芯片实验顺利完成。
      4. 专业的分析团队:实战经验丰富的分析团队,除能快速完成基础分析外,还能根据客户需求完成个性化分析,提供各类高大上的图表。

       

      ceRNA芯片分析流程

       

      ceRNA芯片技术参数

       

      案例展示

      案例一

      放射治疗是肝癌治疗的有效手段之一,然而放射性肝纤维化是肝癌放射治疗的常见并发症,制约肝癌放疗效果。放射性肝纤维化的发病机制仍未明晰,有待进一步研究。环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛参与多种生物学进程的非编码RNA,在人类多种疾病的发生和发展中发挥重要作用。本研究通过伯豪生物提供的circRNA芯片对正常和接受放疗的肝星状细胞中差异表达的circRNA进行分析,探讨其在放射性肝纤维化发病过程中的作用,并通过生物信息学分析,挖掘出这些差异表达基因的潜在功能和与miRNA的互作网络,为放射性肝纤维化的研究提供新的思路。

       

      该产品被引用文献

      [1] Chen Y, Yuan B, Wu Z, Dong Y, Zhang L, Zeng Z(2017).Microarray profiling of circular RNAs and the potential regulatory role of hsa_circ_0071410 in the activated human hepatic stellate cell induced by irradiation.Gene,2017,629:35-42.
      伯豪客户发表的ceRNA芯片部分文章如下(更多文章可以在伯豪官网查找或咨询小编):
      [2]Liu Chang,Ge Hui-Min,Liu Bai-Hui et al. Targeting pericyte-endothelial cell crosstalk by circular RNA-cPWWP2A inhibition aggravates diabetes-induced microvascular dysfunction.[J] .Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2019, 116: 7455-7464. IF=9.50
      [3]Zhu Haibo,Guo Jing,Shen Yutao et al. Functions and Mechanisms of Tumor Necrosis Factor-α and Noncoding RNAs in Bone-Invasive Pituitary Adenomas.[J] .Clin. Cancer Res., 2018, 24: 5757-5766. IF=9.13
      [4]Renjie Wang, Sai Zhang, Xuyi Chen et al. CircNT5E acts as a sponge of microRNA-422a to promote glioblastoma tumorigenesis. [J] .Clin. Cancer Res., 2018. IF=9.13
      [5]Zhang Haiyang,Zhu Lei,Bai Ming et al. Exosomal circRNA derived from gastric tumor promotes white adipose browning by targeting the miR-133/PRDM16 pathway.[J] .Int. J. Cancer, 2019, 144: 2501-2515. IF=7.36
      [6]Zhang Haiyang,Deng Ting,Ge Shaohua et al. Exosome circRNA secreted from adipocytes promotes the growth of hepatocellular carcinoma by targeting deubiquitination-related USP7.[J] .Oncogene, 2019, 38: 2844-2859. IF=6.85
       

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