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Illumina 甲基化芯片服务
| Illumina DNA甲基化芯片服务 |
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Illumina Human 甲基化450K芯片服务
一、芯片介绍 1. 覆盖位点：
Illumina Human甲基化450K芯片覆盖约450,000多个甲基化位点。
2.实验流程：
在亚硫酸氢盐的处理下，没有甲基化的胞嘧啶（C）转化为尿嘧啶（U）；甲基化的胞嘧啶则不受影响。
3.Illumina Human 甲基化450K芯片的优势：
4.芯片原理（探针设计）： Illumina Human 甲基化450K芯片采用Illumina BeadArrayTM Infinium技术，特异性的识别甲基化位点。在甲基化450K芯片中，同时采用了Infinium Ⅰ 和Infinium Ⅱ 探针设计，从而使得检测范围最大化。
（1）Infinium Ⅰ 探针设计
对于每个甲基化位点，都对应设计有两种探针：M型磁珠、U型磁珠。M型磁珠尾部为G，用来检测甲基化位点。U型磁珠尾部为A，用来检测未甲基化位点。 基因组上的某一位点，如果被甲基化了，那么在亚硫酸氢盐的处理下，GC仍为GC，与M型磁珠配对，荧光标记的核苷酸掺入后能被检测到荧光信号。M型磁珠发光。反之，如果没有被甲基化，那么在亚硫酸氢盐的处理下，GC变为GT，与U型磁珠配对，延伸后U型磁珠发光。
（2）Infinium Ⅱ 探针设计
Infinium Ⅱ 探针只使用一种磁珠，探针末端为C。配对后只掺入单个碱基（ ddNTP-BioT， ddNTP-DNP）。根据荧光类型判断掺入的碱基类型，从而判断是否被甲基化。
样品要求：
三、我们能给您提供：
四、DNA甲基化芯片数据分析方案 1. 差异甲基化的筛选
列表示样本，行表示CpG位点，颜色代表甲基化水平 从0到1的变化（红色为低甲基化，蓝色为高甲基化）
3. 差异甲基化基因的功能分析
4. 差异甲基化基因的pathway分析
5. 转录因子预测分析
6. 甲基化的染色体分布图 甲基化在各个染色体的分布情况。
7. 甲基化芯片与表达谱芯片联合分析
图中横轴是甲基化，纵轴是表达谱，分别用delta-beta（diffscore）和foldchange来体现上下调，所以左上或者右下象限的是理论上的负相关的点。
五、应用案例：基因芯片研究肾上腺皮质肿瘤甲基化谱
甲基化芯片结果聚类分析
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科研机构,生产厂商
2020.12.28-2021.01.31
2021.01.18-2021.01.31
2020.12.17-2021.02.10
