常见问题 FAQ Q:如何看懂一个载体的质粒图谱? A :1)首先明确载体的功能是克隆载体还是表达载体,表达载体含有启动子、终止等序列,原核表达载体常用T7启动子、真核表达载体载体常用CMV启动子。2)明确多克隆位点(MCS)有哪些酶切位点可用,插在该区域的外源基因可以像载体中的正常序列一样进行复制和扩增。3)方便的筛选标记,原核抗性如氨、卡那,真核抗性如新霉素、嘌呤霉素。4)有哪些荧光标记或蛋白标签序列。5)注意是否有其他功能元件。
Q :方便追踪目标基因表达的GFP的常见真核表达载体有哪几种,各有说明区别? A :可以提供pEGFP-C1和pIES2-EGFP三种载体选择(EGFP中E代表Enhanced即经过改造的GFP,荧光强度得到加强,表达效率更高)。前两种为EGFP的融合表达载体,分别在目的基因的N端和C端进行融合表达,后一种为目的基因与EGFP共表达的载体。
Q :酶切连接有哪些种类?
酶切连接分类
要求
连接结果
粘性末端连接
双酶切连接
对酶切片段切胶回收
外原片段可定向插入,阳性克隆率高
单酶切连接
载体线性化后需磷酸酶脱磷出来
外源片段会以正反两个方向插入载体,可能出现串联拷贝
平末端连接
采用高浓度的连接酶,注意载体和目标片段的比例,可加入PEG4000等凝聚剂
可能出现串联拷贝,连接效率低,注意增加连接酶量和连接时间
Q :plRES2-EGFP载体中的IRES序列的作用是什么? A :IRES序列的全称是内部核糖体进入位点序列(Internal Ribosome Entry Site),一般真核mRNA的翻译都需要5‘帽子来介导核糖体结合。微小RNA病毒家族则外例外,这类病毒在其mRNA前没有帽子位点,但却有600-1200bp的5‘非翻译区,其中含有多个非起始AUG,这段长的非翻译区即叫做IRES序列。IRES能招募核糖体对mRNA进行翻译。在同一启动子下,将目的基因(注意要加终止子)后加IRES及EGFP序列,IRES后的EGFP就能独立地起始翻译,可与目的基因共表达的作用,但表达量要低于目的基因,GFP荧光剂有可能会较弱。
Q :重组克隆的筛选鉴定方法有哪些?
鉴定名称
具体方案
抗性筛选
采用含氨苄、卡那抗性的平板或培养基培养
菌落PCR
以少量菌液作为模板采用特定引物扩增检测是否能够扩增到目标片段
酶切鉴定
电池判断酶切获得目的的片段大小
测序鉴定
确定序列中每一个碱基与预期一致
参考文献 1. J e a n Pe c c o u d. G e n e S y n t h e s i s: M e t h o d s and Protocols. Humana Press,2012. 2. Benjamin Lewin. Genes IX [M]. Pearson Education,2007.