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    ​Goldengate自定义SNP分型芯片

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    ​Goldengate自定义SNP分型芯片

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    • 入驻年限  3年
    • 北京昌平区中东路400号院

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    • 提供商: 北京晶典生物科技有限公司
      服务名称: ​Goldengate自定义SNP分型芯片
      Goldengate自定义SNP分型芯片
      服务简介
      Illumina公司的Goldengate定制芯片平台是理想的中等通量自定义芯片技术平台,可根据客户提供的单核苷酸多态性位点SNP的rs号、基因名称、序列或要研究的区域的位置进行生物信息学分析,挑选SNP位点并进行位点实验成功率评分,评分结果返回用户处后和用户沟通一起来确定要进行研究的SNP位点,以合成探针组(OPA),进行基因分型的研究。一个样本可以同时进行几十上百个SNP位点的研究,可以满足不同研究对低、中通量或者多重基因分型的要求。
       
      Goldengate自定义SNP分型芯片技术流程
      (1)DNA激活。DNA样本首先要进行激活,以便结合到顺磁颗粒(生物素或链亲和素)上。
      (2)杂交。寡核苷酸、杂交缓冲液和顺磁粒子结合到激活的DNA上。杂交之后,进行多次洗脱,去掉多余或未杂交的寡核苷酸,降低噪音。
      (3)延伸连接。正确匹配的ASO进而延伸,与LSO延伸的产物连接。
      (4)连接产物作为模板,可用通用PCR引物(p1,p2,p3)进行扩增。P1和p2用Cy3- 、 Cy5-标记。
      (5)单链下游延伸。
      (6)通过特异的序列,带有染料标记的DNA与互补的微珠结合。
      (7)洗脱,干燥。
      (8)用BeadArray Reader读取芯片上的荧光信号,软件依次分析,自动得出基因型。
       
      技术特点
      (1)低成本的中等通量基因分型解决方案。
      (2)每张芯片可进行最低48重、最高1536重SNP位点反应,可同时进行96样本的SNP检验,定制灵活。
      (3)方法经典可靠,检测重复性>99%,准确性高。
       
      服务内容
          本公司根据客户提供的SNP列表、基因列表或者感兴趣区域,设计和定制个性化的Goldengate芯片进行SNP分型。
       
      样本要求
      总量:1-100个位点,≥1μg DNA;超过100个位点,≥2 μg DNA;
      浓度:≥50 ng/μL;
      纯度:OD260/280=1.8-2.0,OD260/230=1.0-3.0

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