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功能分型PCR芯片
云序生物
美国SABioscience公司针对不同的信号通路和疾病设计了150多款功能分型PCR芯片。这些功能分型PCR芯片专注于某个特定的信号通路,采用表达分析的“金标准”—实时定量PCR技术对信号通路中的基因表达水平进行检测。与传统的高密度表达芯片相比,功能分型PCR芯片具有对性更强、灵敏度更高、准确性更好等优点,能够帮助客户快速的剖析某类疾病与特定信号通路的关系,或者是寻找特定疾病的分子标志物(biomarker)。
按照针对的疾病类型,功能分型PCR芯片产品可以分为以下几大类:癌症、心血管疾病、神经系统疾病、免疫系统疾病、传染性疾病、代谢疾病。每一大类下都对应着几十款与该疾病密切相关的,信号通路特异性的PCR芯片产品。此外,还有多款针对miRNA和LncRNA的功能分型PCR芯片供客户选择。
云序优势信号通路特异性
聚焦于与特定信号通路或疾病状态相关的一组基因;
高灵敏度
每张芯片最少只需25 ng RNA;
重复性好
采用成熟、稳定的实时定量PCR技术进行检测,技术重复性好 (R2>0.99);
高特异性
精心优化的PCR体系,避免了非特异性扩增现象;
均一的PCR扩增效率
合理的引物设计,芯片上不同基因都具有相同的扩增效率;
线性动态范围广
线性范围高达106,可同时检测表达水平差异大的基因。
样本要求样品类型:
细胞、新鲜组织,体液或RNA样品。其它类型样品请详询。
样品量:
a)细胞:5×106
b)组织:5 mg
c)体液:2-3 mL (全血、血清、血浆、尿液等)
d)RNA:2 μg(OD260/280:1.6-2.3;浓度≥ 500 ng/μL;RNA无明显降解 )
样品运输及保存:
样品运输:样品置于1.5 mL管中,封口膜封好,干冰运输
样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~5 mg的小块),用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。RNA样品溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
PCR功能芯片产品种类 癌症 |
|
Androgen Receptor Signaling Targets |
雄激素受体信号通路靶基因 |
Angiogenesis |
血管生成 |
Apoptosis |
细胞凋亡 |
Brain Cancer |
脑癌 |
Breast Cancer |
乳腺癌 |
Cancer Drug Targets |
癌症药物靶标 |
Cancer Inflammation & Immunity Crosstalk |
癌症相关的炎症与免疫反应 |
Cancer Pathway Finder |
癌症通路发现者 |
Cancer PathwayFinder 384HC |
癌症通路发现者(384孔) |
Cancer Stem Cells |
肿瘤干细胞 |
Cell Cycle |
细胞周期 |
Cell Motility |
细胞运动 |
DNA Damage Signaling Pathway |
DNA损伤信号通路 |
DNA Repair |
DNA修复 |
Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT) |
上皮间质转化(EMT) |
Hippo Signaling Pathway |
Hippo信号通路 |
PI3K-AKT Signaling Pathway |
PI3K-AKT信号通路 |
Leukemia |
白血病 |
Liver Cancer |
肝癌 |
Lung Cancer |
肺癌 |
Lymphoma |
淋巴瘤 |
MYC Targets |
MYC靶基因 |
Ovarian Cancer |
卵巢癌 |
Prostate Cancer |
前列腺癌 |
Telomeres & Telomerase |
端粒与端粒酶 |
Tumor Metastasis |
肿瘤转移 |
Tyrosine Kinases |
络氨酸激酶 |
Serum & Plasma |
血清与血浆miRNA |
miFinder |
miRNA发现者 |
miRNome |
miRNA组 |
心血管疾病 |
|
Adherens Junctions |
粘附连接 |
Adipogenesis |
脂肪细胞分化 |
Aging |
老化 |
AMPK Signaling |
AMPK信号通路 |
Angiogenesis |
血管生成 |
Atherosclerosis |
动脉粥样硬化 |
Cardiovascular Disease |
心血管疾病 |
Cell Junction PathwayFinder |
细胞结的信号探究 |
Cellular Senescence |
细胞衰老 |
Chemokines & Receptors |
趋化因子受体 |
Circadian Rhythms |
昼夜节律 |
Common Cytokines |
常见的细胞因子 |
Cytokines & Chemokines |
细胞因子和趋化因子 |
Diabetes |
糖尿病 |
Embryonic Stem Cell |
胚胎干细胞 |
Endothelial Cell Biology |
内皮细胞生物学 |
Extracellular Matrix & Adhesion Molecules |
细胞外基质粘附分子 |
Fatty Acid Metabolism |
脂肪酸代谢 |
Fatty Liver |
脂肪肝 |
Fibrosis |
纤维化 |
Gap Junctions |
缝隙连接 |
Glucose Metabolism |
葡萄糖代谢 |
Hypertension |
高血压 |
IL6/STAT3 Signaling Pathway |
IL6/STAT3信号通路 |
Induced Pluripotent Stem Cells |
诱导性多能干细胞 |
Inflammatory Cytokines & Receptors |
炎性细胞因子及受体 |
Insulin Resistance |
胰岛素抵抗 |
Insulin Signaling Pathway |
胰岛素信号通路 |
Lipoprotein Signaling & Cholesterol Metabolism |
脂蛋白信号和胆固醇代谢 |
Necrosis |
细胞坏死 |
Neurological Development & Disease |
神经发育与疾病 |
Obesity |
肥胖 |
Osteoporosis |
骨质疏松 |
Oxidative Stress |
氧化应激 |
PI3K-AKT Signaling Pathway |
PI3K-AKT信号通路 |
Polycystic Kidney Disease |
多囊肾病 |
PPAR Targets |
PPAR靶基因 |
Pre-Eclampsia |
先兆子痫 |
Protease Activated Receptor Signaling |
蛋白酶激活受体信号 |
Serum & Plasma |
血清与血浆miRNA |
Skeletal Muscle: Myogenesis & Myopathy |
骨骼肌成肌病 |
Stress & Toxicity PathwayFinder |
压力与毒理信号通路发现者 |
TGFß / BMP Signaling Pathway |
转化生长因子-β/骨形态发生蛋白信号通路 |
TGFß Signaling Targets |
转化生长因子-β信号的目标 |
Tight Junctions |
紧密连接 |
Transplant Rejection |
移植排斥 |
神经系统疾病 |
|
Aging |
老化 |
Alzheimer’s Disease |
阿尔茨海默氏病 |
Amino Acid Metabolism I |
氨基酸代谢I |
Amino Acid Metabolism II |
氨基酸代谢II |
Autism Spectrum Disorders |
自闭症 |
Autophagy |
自噬 |
Brain Cancer |
脑癌 |
Circadian Rhythms |
昼夜节律 |
Dopamine & Serotonin Pathway |
多巴胺和5 - 羟色胺途径 |
Embryonic Stem Cell |
胚胎干细胞 |
GABA & Glutamate |
γ-氨基丁酸和谷氨酸 |
Glucocorticoid Signaling |
糖皮质激素信号 |
Huntington's Disease |
亨廷顿氏病 |
Induced Pluripotent Stem Cells |
诱导性多能干细胞 |
Inflammatory Response & Autoimmunity |
炎症反应和自身免疫 |
Mitochondria |
线粒体 |
Mitochondrial Energy Metabolism |
线粒体能量代谢 |
Multiple Sclerosis |
多发性硬化症 |
Neurogenesis |
神经再生 |
Neurological Development & Disease |
神经发育与疾病 |
Neuronal Ion Channels |
神经细胞的离子通道 |
Neurotransmitter Receptors |
神经递质受体 |
Neurotrophins & Receptors |
神经营养因子及受体 |
Osmotic Stress |
渗透胁迫 |
Pain: Neuropathic & Inflammatory |
神经性疼痛和炎症 |
Parkinson's Disease |
帕金森氏病 |
Primary Cilia |
初级纤毛 |
Schizophrenia |
精神分裂症 |
Stress & Toxicity PathwayFinder |
压力与毒理信号通路发现者 |
Synaptic Plasticity |
突触可塑性 |
Th17 Response |
辅助T细胞17细胞响应 |
Unfolded Protein Response |
折叠蛋白反应 |
免疫系统疾病 |
|
Allergy & Asthma |
过敏与气喘 |
Amino Acid Metabolism I |
氨基酸代谢I |
Antibacterial Response |
抗菌响应 |
Antifungal Response |
抗真菌响应 |
Antiviral Response |
抗病毒反应 |
Cancer Inflammation & Immunity Crosstalk |
癌症相关的炎症与免疫反应 |
Cellular Senescence |
细胞衰老 |
Chemokines & Receptors |
趋化因子受体 |
Common Cytokines |
常见的细胞因子 |
Crohn’s Disease |
克罗恩病 |
Cytokines & Chemokines |
细胞因子和趋化因子 |
Dendritic & Antigen Presenting Cell |
树突状抗原呈递细胞 |
Glucocorticoid Signaling |
糖皮质激素信号 |
IL6/STAT3 Signaling Pathway |
IL6/STAT3信号通路 |
Immunopathology |
免疫病理损伤 |
Immunotoxicity |
免疫毒性 |
Inflammasomes |
炎性体 |
Inflammatory Cytokines & Receptors |
炎性细胞因子及受体 |
Inflammatory Response & Autoimmunity |
炎症反应和自身免疫 |
Innate & Adaptive Immune Responses |
先天免疫和适应性免疫应答 |
Interferons & Receptors |
干扰素受体 |
JAK / STAT Signaling Pathway |
JAK-STAT信号通路 |
Multiple Sclerosis |
多发性硬化症 |
NFkB Signaling Pathway |
核转录因子信号通路 |
NFkB Signaling Targets |
核转录因子信号的目标 |
Phagocytosis |
吞噬作用 |
Retinoic Acid Signaling |
视黄酸信号通路 |
案例解析
案例:MicroRNA-182调控Sirt1诱导的糖尿病性角膜神经再生(云序客户文章)
原文:microRNA-182 Mediates Sirt1-Induced Diabetic Corneal Nerve Regeneration
期刊:Diabetes 影响因子: 7.27
糖尿病性角膜神经病变是一种潜在的致盲性病变,47%-64%的糖尿病患者在其一生中有原发性角膜病变。糖尿病对角膜各层组织结构、代谢及功能均有重要影响。本文就糖尿病性角膜神经再生的基因水平分子机制展开研究。Sirt1是参与神经保护和损伤修复的关键基因。在三叉感觉神经中,Sirt1结合miR-182的启动子,促进了miR-182的表达,进而促进神经突分支并能克服高糖的负作用。通过靶基因预测和荧光素酶报告基因实验,鉴定出miR-182的靶基因---NOX4。利用美国SABiosciences的小鼠氧化应激&抗氧化PCR芯片,进一步发现NOX4在糖尿病性三叉神经细胞中高表达,从而为糖尿病性感觉神经再生和糖尿病性角膜病的治疗提供了潜在靶点。该研究成果发表于糖尿病权威期刊。
云序生物提供PCR芯片实验及后续的数据分析
图1. 使用小鼠氧化应激&抗氧化PCR芯片在糖尿病性三叉神经节细胞检测84个相关基因的表达;
在糖尿病性三叉神经节细胞中,NOX4的表达水平升高10.11倍
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