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肿瘤发生、发展、治疗靶标专题研究

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肿瘤发生、发展、治疗靶标专题研究
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  • 关注肿瘤的发生、进展,并筛选相关的诊断和治疗分子靶标是肿瘤基础研究中的重要命题,常规的研究策略起始于一定样本数的差异表达谱分析(基因芯片),从肿瘤与对照癌旁或正常组织之间基因表达的差异,寻找肿瘤发生的分子因素,并确定候选靶标。 一般而言,基因表达谱分析获得的数据量极为庞大,差异基因数以千计,无法一一验证,随着分子生物学技术的进展,尤其是RNAi文库以及高内涵筛选(High content screening,HCS)技术的应用,高通量地一次验证成千上万个基因的表型成为了可能。在基因芯片筛选获得差异表达的候选分子后,制备在肿瘤中特异性高表达基因的RNAi慢病毒载体,并在细胞水平平行沉默候选靶基因,通过细胞生长、克隆形成、迁移运动能力等表型筛选,确认对肿瘤的典型生物学特征具有贡献的功能分子,从而确定未来的应用型靶标分子。 一个靶标,即构成了一个富有研究价值的课题资源,在大规模的临床样本中,回顾性验证靶标分子与临床病理的相关性,同时深入探讨其作用的分子机制,能够具有纵深地开展与肿瘤发生、进展分子基础相关的研究工作,获得富有价值的科研成果。
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  • 提供商: 上海吉凯基因化学技术有限公司
    服务名称: 肿瘤发生、发展、治疗靶标专题研究

    肿瘤发生、发展、治疗靶标专题研究

     

     

    简介

    1. 关注肿瘤的发生、进展,并筛选相关的诊断和治疗分子靶标是肿瘤基础研究中的重要命题,常规的研究策略起始于一定样本数的差异表达谱分析(基因芯片),从肿瘤与对照癌旁或正常组织之间基因表达的差异,寻找肿瘤发生的分子因素,并确定候选靶标。
    2. 一般而言,基因表达谱分析获得的数据量极为庞大,差异基因数以千计,无法一一验证,随着分子生物学技术的进展,尤其是RNAi文库以及高内涵筛选(High content screening,HCS)技术的应用,高通量地一次验证成千上万个基因的表型成为了可能。在基因芯片筛选获得差异表达的候选分子后,制备在肿瘤中特异性高表达基因的RNAi慢病毒载体,并在细胞水平平行沉默候选靶基因,通过细胞生长、克隆形成、迁移运动能力等表型筛选,确认对肿瘤的典型生物学特征具有贡献的功能分子,从而确定未来的应用型靶标分子。
    3. 一个靶标,即构成了一个富有研究价值的课题资源,在大规模的临床样本中,回顾性验证靶标分子与临床病理的相关性,同时深入探讨其作用的分子机制,能够具有纵深地开展与肿瘤发生、进展分子基础相关的研究工作,获得富有价值的科研成果。

    技术特点

    A. 从新鲜的临床组织样本分析正常与病理状态之间基因表达的差异
        分类清晰,带有明确临床问题的新鲜组织样本,抽提RNA后进行表达谱芯片检测,结合强大的生物信息学分析,能够获得正常与病理状态之间差异表达基因的信息,筛选与疾病发生、进展相关的功能分子,确定治疗靶标的候选范围。
    B. 利用RNAi文库资源对肿瘤的癌基因进行Loss-of-function研究
        吉凯基因拥有全基因组的RNAi慢病毒文库,针对芯片筛选获得的差异表达分子,从文库中选取相应的靶向shRNA慢病毒感染细胞,能够稳定、高效地沉默靶标基因,验证其功能表型改变,解析其在肿瘤发生、发展过程中的作用。
    C. 通过高内涵筛选(High content screening,HCS)技术高通量进行功能鉴定
        高内涵筛选技术在细胞学水平对大量的差异表达分子,采用高速采集数据,全自动分析的方式,验证出行使特定细胞学功能(包括增殖、凋亡、侵袭转移等)的基因,由此在差异表达的基础上,筛选出对肿瘤发生、发展具有重要功能的靶标分子。
    D. 在大规模的肿瘤样本中分析目的基因及相关分子的临床相关性
        大样本的回顾性研究能够在组织样本中找到目的基因表达相关性的临床证据,从病理和随访资料中,获得靶标分子的表达阳性率与临床的相关性,从而明确其应用价值。

     

    服务流程

    A. 新鲜组织样本的RNA抽提,基因芯片检测
    B. 生物信息学分析,文献检索,确定候选研究分子
    C. 从RNAi文库中调取候选研究分子的shRNA慢病毒工具
    D. 慢病毒感染细胞,在Cellomics系统上高通量验证候选分子的功能表型
    E. 在大规模临床样本中检测靶标分子的表达,明确其临床意义。

     

    应用领域

    A. 肿瘤功能基因研究
    B. 特定疾病模型的功能分子筛选
    C. 临床导向的诊断、治疗分子靶标筛选 

     

    样本要求

    高质量,具有明确病理和随访资料的肿瘤组织样本对基因表达分析和候选靶标分子的验证有重要作用。

    相关服务

    A.多种同类功能实验对靶标基因的验证
    B. 靶标基因在多细胞的平行功能验证
    C. 过表达目的基因的反向功能验证
    D. RNAi的回复功能实验
    E. 体内试验的验证(动物模型)
    F. 相关下游基因的表达检测
    G. 其他分子机制研究(如Y2H,信号通路荧光素酶报告系统)

    发表文章

     
    Twist, a Master Regulator of Morphogenesis, Plays an Essential Role in Tumor Metastasis
    Yang J, Mani SA, Donaher JL, Ramaswamy S, Itzykson RA, Come C, Savagner P, Gitelman I, Richardson A, Weinberg RA.
    Cell. 2004 Jun 25;117(7):927-39.
     
    Induction of tumor angiogenesis by Slit-Robo signaling and inhibition of cancer growth by blocking Robo activity.
    Wang BXiao YDing BBZhang NYuan XGui LQian KXDuan SChen ZRao YGeng JG.
    Cancer Cell. 2003 Jul;4(1):19-29.
     
    Differential expression of DOC-1 in microsatellite-unstable human colorectal cancer.
    Yuan Z, Sotsky Kent T, Weber TK.
    Oncogene. 2003 Sep 18;22(40):6304-10.
     
    Knockdown endogenous CypA with siRNA in U2OS cells results in disruption of F-actin structure and alters tumor phenotype.
    Calhoun CCLu YCSong JChiu R.
    Mol Cell Biochem. 2009 Jan;320(1-2):35-43. Epub 2008 Aug 14.
     
    Silencing MRP4 by small interfering RNA reverses acquired DDP resistance of gastric cancer cell.
    Zhang YHWu QXiao XYLi DWWang XP.
    Cancer Lett. 2010 May 1;291(1):76-82. Epub 2009 Nov 1.
     
    CXCR-4 knockdown by small interfering RNA inhibits cell proliferation and invasion of oral squamous cell carcinoma cells.
    Hong JSPai HKHong KOKim MAKim JHLee JIHong SPHong SD.
    J Oral Pathol Med. 2009 Feb;38(2):214-9. Epub 2008 Jun 12.
     
    CYP450 polymorphisms as risk factors for early-onset lung cancer: gender-specific differences.
    Timofeeva MNKropp SSauter WBeckmann LRosenberger AIllig TJäger BMittelstrass K,Dienemann HLUCY-ConsortiumBartsch HBickeböller HChang-Claude JCRisch AWichmann HE.
    Carcinogenesis. 2009 Jul;30(7):1161-9. Epub 2009 May 4.
     
    Silencing livin gene by siRNA leads to apoptosis induction, cell cycle arrest, and proliferation inhibition in malignant melanoma LiBr cells.
    Wang HTan SSWang XYLiu DHYu CSBai ZLHe DLZhao J.
    Acta Pharmacol Sin. 2007 Dec;28(12):1968-74.






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